אין סקאָלעטעטש, אַנאַלייזד דנאַ פּאַקקאַגינג מעטהאָדס

Anonim
אין סקאָלעטעטש, אַנאַלייזד דנאַ פּאַקקאַגינג מעטהאָדס 10627_1
אין סקאָלעטעטש, אַנאַלייזד דנאַ פּאַקקאַגינג מעטהאָדס

דער אַרטיקל איז ארויס אין דער זשורנאַל נאַטור קאָמוניקאַציע. די כּמעט צוויי-מעטער דנאַ פאָדעם איז געשטעלט אין די קליינטשיק קערן פון די מענטשלעך צעל רעכט צו דעם פאַקט אַז טשראָמאַטין, די דנאַ קאָמפּלעקס און פּראָטעינס, טורנס עס סאָליד, טורנס עס צו פאַרברענגען סטראַקטשערז. צו לערנען די מעטהאָדס פון פּאַקקאַגינג דנאַ, סייאַנטיס איבער די וועלט זענען געניצט דורך די אַזוי גערופענע קאַנפאָרמיישאַן פון די קאַנפאָרמאַנט פון טשראָמאָסאָומז (3C), און איינער פון די מערסט פּראָדוקטיוו פון זיי איז די הי-C. אַלאַוז איר צו דערקענען די קאָנטאַקטן פון די דנאַ פון די גאנצע גענאָמע מיט הויך-פאָרשטעלונג סיקוואַנסינג.

אין דעם, אָבער, עס איז אַ פּראָבלעם: די הי-C אַרבעט ריקווייערז דאַזאַנז פון דנאַ מיקראָגראַמס - וואָס איז, מיליאַנז פון סעלז מיט אַ יינציק ספּיישאַל קראָומאַטטין אָרגאַניזאַציע. די אינפֿאָרמאַציע דאַרף צו אַוורידזשד צו באַקומען אַ פּראָסט בילד וואָס וועט נישט נעמען אין חשבון די פֿעיִקייטן פון דנאַ פּאַקקאַגינג אין יחיד סעלז.

פּונקט ווי די "דורכשניטלעך מענטש" טוט נישט אַקשלי עקסיסטירן, דער טראדיציאנעלן הי-C אופֿן קענען נישט ווייַזן, וואָס פון די קייפל ינטעראַקשאַנז פון דנאַ סעקשאַנז פאַלן סיימאַלטייניאַסלי אין דער זעלביקער צעל. אין דערצו, דעם "קאָלעקטיוו פּאָרטרעט" איז קוים העלפּינג צו פֿאַרשטיין וואָס גשמיות פּראַסעסאַז פירן צו די פאָרמירונג פון אַ דריי-דימענשאַנאַל סטרוקטור פון טשראָמאַטין.

"מיר זען עטלעכע סטראַקטשערז, למשל, די אַזוי גערופענע טאָפּאָלאָגיקאַללי פֿאַרבעסערן דאָמאַינס (טאַדאַדאַ), אין די אַוורידזשד דנאַ קאָנטאַקט קאַרדס, אָבער מיר טאָן ניט וויסן צי זיי עקסיסטירן אין יחיד סעלז, אָדער דאָס זענען אַרטאַפאַקץ אַוורידזשינג. אין אַדישאַן, מיר וויסן אַז פֿון די מיינונג פון דזשין אויסדרוק, אַ ברייט פאַרשיידנקייַט אַקערז אפילו אין די סעלז פון די זעלבע געוועב - פֿון דאָ עס איז אַ נאַטירלעך קשיא וועגן ווי דייווערס זיי זענען אין די סטראַקטשעראַל מדרגה, "זאגט דער קאָ- מחבר פון מיכיל גריזשאַנד, וויצע פּרעזידענט סקאָלאַטהאַ לויט צו ביאָמעדיקאַל פאָרשונג.

אין סקאָלעטעטש, אַנאַלייזד דנאַ פּאַקקאַגינג מעטהאָדס 10627_2
דריי-דימענשאַנאַל ייַנבראָך פון די Haploid X-ChraroSome / © www.nature.com

צו באַשליסן די פּראָבלעמס און מאַכן אַן עקספּערימענט הי-C מער פּאַסיק פֿאַר יחיד סעלז, ריסערטשערז פון עטלעכע אינסטיטוציעס האָבן דעוועלאָפּעד אַ מעטאָד גערופן הי-C איין סעלז. סקאָלטעטש מאַנשאַפֿט געפֿירט דורך Gelftand און מיטאַרבעטער פּראָפעסאָר פון די צענטער פֿאַר לעבן שאַק קאַטערין טשורטש דעליוועריד אַ אַרבעט צו אַפּטאַמייז דאַטן פּראַסעסינג און עקספּלאָריטע די פונדאַמענטאַל פּראָפּערטיעס פון דראָסאָפילאַ סעלז.

זייער קאָלעגע פון ​​די ביאָלאָגי אינסטיטוט פון די ביאָלאָגי פון די רוסישע אַקאַדעמי פון ססיענסעס און מאָסקווע שטאַט אוניווערסיטעט געהייסן נאָך מוו לאָמאָנאָסאָוו, צוזאַמען מיט די עמפּלוייז פון די רוסיש-פראנצויזיש צענטער PoncEls .

די טימז האָבן אנגעהויבן מיט די סטעפּס פון די הי-C, אין וואָס די סטרוקטור פון טשראָמאַטין איז פאַרפעסטיקט קעמיקלי, און די דנאַ איז שנייַדן און "ריאַסעמבלי" אַזוי אַז פראַגמאַנץ, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים, וואָס אין נאַטירלעך טנאָים ". אָבער אַנשטאָט פון ניצן אַלע דנאַ אין אַמאָל, סייאַנטיס אַמפּלאַפייד די קליינטשיק סומע פון ​​דנאַ פון יעדער צעל ניצן PHI29 באַקטעריאָפאַגע פּאָלימעראַסע. דער פּאָלימעראַסע איז אָפט געניצט ווען אַמפּלאַפייינג דנאַ, אין טייל, רעכט צו זיין פיייקייט צו מאַכן אַ גרויס סומע פון ​​דנאַ אפילו אויף אַ זייער קליין מוסטער מיט אַ פיל קלענערער נומער פון ערראָרס ווי אנדערע פאָלקס פּאַלימעראַסעס.

אָבער, עס פארקערט אויס אַז דאָס באַקוועם דנאַ פּאָלימעראַסע, טראָץ די גאַנץ הויך אַקיעראַסי פון קאַפּיינג, קענען נאָך "שפּרינגען" צווישן דנאַ מאָלעקולעס, קריייטינג קינסטלעך קייטן אַז די הי-C אַלגאָריטהם קענען ניט זיין אונטערשיידן פון פאַקטיש ינטעראַקשאַנז. דעריבער, ריסערטשערז האט צו קומען מיט אַ מעקאַניזאַם פֿאַר רידזשעקשאַן פון די טראַפ "דזשאַמפּס" פון פּאָלימעראַסע.

זיי געוויינט זייער נייַע אופֿן אויף דראָסאָפילאַ סעלז צו געפֿינען זיך אויב פאַרשידן אָרגאַניזאַמז האָבן פּראָסט פונדאַמענטאַל פּרינסאַפּאַלז פון טשראָמאַטין פּאַקקאַגינג. פֿריִערדיקע שטודיום אויף מאַממאַליאַן סעלז אנגעוויזן די עקזיסטענץ פון טאַדעס בלויז אויף קאָנטאַקט קאַרדס באקומען דורך באַפעלקערונג הי-C, אָבער נישט אין יחיד סעלז. אָבער, די לערנען פון די סעלז פון דראָסאָפילאַ געוויזן אַז די דאָומיינז זענען אין יעדער ספּעציפיש צעל.

אין סקאָלעטעטש, אַנאַלייזד דנאַ פּאַקקאַגינג מעטהאָדס 10627_3
סדר און סטאָטשאַסטיקאַטי אין די 3 ד-גענאָמע פון ​​Trosophila / © www.nature.com

צו פֿאַרשטיין וואָס בייאַלאַדזשיקאַל מעקאַניזאַם איז פאַראַנטוואָרטלעך פֿאַר די פאָרמירונג פון די סאַסטיינאַבאַל דאָומיינז, נאָך פאָרשונג וועט זיין פארלאנגט; בשעת סייאַנטיס געפֿינט צוויי מאָדעלס פון זייער פּאַסירונג. איינער פון זיי סאַגדזשעסץ אַז טשראָמאַטין אין דראָסאָפילאַ איז אָרגאַניזירט דורך די מעקאַניזאַם פון "סטיקקינעסס", דאָס איז, עטלעכע פון ​​די סעקשאַנז זענען מער מסתּמא צו זיין פארבונדן צו יעדער אנדערער. לויט צו אן אנדער, דיסקרייבינג די אַזוי גערופענע כינגז יקסטרוזשאַן מעקאַניזאַם, גרויס פּראָטעין קאַמפּלעקסאַז שאַפֿן לופּס פון דנאַ פֿעדעם און רעכט צו דעם פּעקל דנאַ.

"אפשר איינער פון די מערסט טשיקאַווע ישוז איז צי די כּללים פון פאָלדינג טשראָמאַטין זענען די זעלבע אין פאַרשידענע טייפּס פון לעבעדיק אָרגאַניזאַמז. די הי-C אופֿן פון איין סעלז, דראָזאַפילס, מיר געפֿונען זיך אַז דאָומיינז ענלעך צו דאָומאַינס אין מאַממאַליאַן סעלז זענען אויך פאָרשטעלן אין דעם דזשאָון פון דעם שנוק. די סטראַקטשערז זענען פיל מער באפוילן ווי אין מאַמאַלז, "האט אלעקסאנדער גרים סטשאָלטעטש גראַדזשאַוואַט תּלמיד און איינער פון די ערשטע מחברים פון דעם אַרטיקל.

"מיר וועלן פאָרזעצן צו לערנען די אַרקאַטעקטשער פון טשראָמאַטין און מעקאַניזאַמז פֿאַר די פאָרמירונג פון לופּס און טאַדאָוו. עס זענען נאָך פילע פֿראגן אין דעם געגנט אָן ענטפֿערס. מיר וויסן שוין אַז די מעקאַניזאַמז אין עטלעכע אָרגאַניזאַמז קען בייַטן, אָבער וואָס איז די עוואָלוציע פון ​​טשראָמאַטין פאָלדינג ווי אַ גאַנץ? אויב מיר וועלן צו פֿאַרשטיין דאָס אויף אַ גענוג דעטאַל מדרגה, מיר דאַרפֿן צו פּלאָמבירן די גאַפּס, געלערנט די סטרוקטור פון טשראָמאַטין אין מאָדנע אָרגאַניזאַמז, און ניט נאָר יענע וואָס זענען שוין געזונט ינוועסטאַגייטאַד. דעריבער, מיר זענען שוין ארבעטן מיט מאַרינע ספּאַנדזשאַז, הייוון און אַמיבאַז, "זאגט קאַטערין טעממבעוואַ.

לויט צו איר, די גרופּע איז אויך פאַרקנאַסט אין אַ מעגלעך קשר פון ענדערונגען אין דער אָרגאַניזירונג פון טשראָמאַטין מיט חולאתן, אַנטוויקלונג פון דעם גוף און יידזשינג. "אויב מיר יבערנעמען אַז די אַרקאַטעקטשער פון טשראָמאַטינאַ איז ענג שייַכות צו דער אויסדרוק פון גענעס, און ענטפֿערן צו די פֿראגן, מיר וועלן קענען צו האַנדלען מיט דער אַנטוויקלונג פון דער אינטוויקלונג פון דער מענטש גוף, יידזשינג און חולאתן," זאגט טעהרעראַוועאַ.

ספּעשאַלאַסץ פון דעם אינסטיטוט פון ביאָלאָגי פון די גענאַ פון די רוסישע אַקאַדעמי פון ססיענסעס, מאָסקווע שטאַט אוניווערסיטעט געהייסן נאָך מ.ס. וו. לאָמאָנאָסאָוו, די רוסיש פאָרשונג, די רוסיש פאָרשונג, די סייקאַליישאַן פון רוסיש פאָרסיקלע און אנדערע אָרגאַנאַזיישאַנז.

מקור: נאַקעט וויסנשאַפֿט

לייענען מער