Създаде метод за визуализиране на масспектрометрично изображение, адаптиран под човешкото виждане

Anonim
Създаде метод за визуализиране на масспектрометрично изображение, адаптиран под човешкото виждане 14929_1
Създаде метод за визуализиране на масспектрометрично изображение, адаптиран под човешкото виждане

Резултатите от проучването са публикувани в дневника Аналитична химия. Масспектрометрия с висока разделителна способност е метод за анализ на веществото, базиран на точното измерване на съотношението на масата за зареждане (m / z) йонизирани молекули и интензивността на съответния сигнал от тях (тяхното относително количество). Тази информация ви позволява да определите молекулното тегло на съединенията, тяхната структура, която спомага за идентифициране на съединения, като протеини, липиди, метаболити, пептиди, компоненти на лекарства и други вещества.

Mass Spectroometric Imijing (MCI) ви позволява да получите информация за пространственото разпределение на молекулите в тъканите, провеждайки масов спектрометричен анализ на йони при локална лазерна йонизация на молекули във всяка точка на изследваната проба (например, нарязана на тумора).

Тълкуването на данните на MSI е трудна задача. Първоначално е необходимо да се визуализира разпределението на йони на повърхността на повърхността на тъканта, т.е. за изграждане на нормален цветен образ, в който всяка област, която има подобен йонна състав - съответства на неговия цвят. От хиляди йони във всяка точка трябва да отидете само на три цифрови стойности, които трябва да спазват данните за MSI, които могат да бъдат свързани с триизмерното цветово пространство за последващия анализ от изследователя.

Създаде метод за визуализиране на масспектрометрично изображение, адаптиран под човешкото виждане 14929_2
Описание на метода / © Skoltech Press Service

"Важно е да се увеличи максимално информационното съдържание на произтичащия образ, е необходимо да се вземат предвид характеристиките на човешкото зрение, по-специално, неилинейността и качествено различна чувствителност към промени в яркостта и хрома.

И въпреки че теорията за цветовото възприятие се изследва доста дълго (от първата половина на 20-ти век), дори сред експертите, няма общоприети математически модели, доста добре описват всички известни свойства на човешкото виждане "Първият автор на проучването, казва студентът Skoltech Anastasia Sarychev.

Изследователи от центъра на научните и инженерните компютърни технологии за задачи с големи масиви за данни (CDIES) и лабораторията на Visual SPI RAS предлагат нов подход към визуализацията на данните на MSI, а не по-нисши от известните методи по отношение на детайлите, но в. \ T същото време въз основа на теорията на човешкото възприятие.

Новият метод запазва границите и градиентите при прилагане на избрани области с подобен йонна състав. По този начин произтичащият образ се тълкува по-лесно, отколкото при други подходи към изображенията на данните на MSI. Методът е тестван както върху модела, така и на експериментални данни, получени от изследователите на лабораторията за масова спектрометрия на Сколтеха, заедно с биолозите на центъра на невробиологията и невероятността на Скотеч.

Източник: гола наука

Прочетете още