Створаны метад візуалізацыі дадзеных мас-спектраметрычнага имиджинга, адаптаваны пад чалавечае зрок

Anonim
Створаны метад візуалізацыі дадзеных мас-спектраметрычнага имиджинга, адаптаваны пад чалавечае зрок 14929_1
Створаны метад візуалізацыі дадзеных мас-спектраметрычнага имиджинга, адаптаваны пад чалавечае зрок

Вынікі даследавання апублікаваныя ў часопісе Analytical Chemistry. Мас-спектраметрыя высокага дазволу - гэта метад аналізу рэчывы, заснаваны на дакладным вымярэнні адносіны масы да зарада (m / z) іянізаваных малекул і інтэнсіўнасці адпаведнага сігналу ад іх (іх адноснага колькасці). Гэтая інфармацыя дазваляе вызначыць малекулярную масу злучэнняў, іх структуру, што дапамагае ідэнтыфікаваць злучэння, напрыклад, вавёркі, ліпіды, метабаліты, пептыды, кампаненты лекаў і іншых рэчываў.

Мас-спектраметрычнага имиджинг (МСИ) дазваляе атрымаць інфармацыю аб прасторавым размеркаванні малекул у тканінах, праводзячы мас-спектраметрычнага аналіз іёнаў пры лакальнай лазернай іянізацыі малекул ў кожным пункце доследнага ўзору (напрыклад, зрэзу пухліны).

Інтэрпрэтацыя дадзеных МСИ - складаная задача. Спачатку патрабуецца візуалізаваць размеркавання іёнаў на паверхні зрэзу тканіны, то ёсць пабудаваць звычайнае каляровы малюнак, на якім кожнай вобласці, якая мае падобны іённы склад - адпавядае свой колер. Ад тысяч іёнаў у кожнай кропцы трэба перайсці да ўсяго толькі трох лікавым значэнняў, якія павінны як мага паўней адлюстроўваць дадзеныя МСИ і якія можна суаднесці з трохмерным каляровай прасторай для яго наступнага аналізу даследчыкам.

Створаны метад візуалізацыі дадзеных мас-спектраметрычнага имиджинга, адаптаваны пад чалавечае зрок 14929_2
Апісанне метаду / © Прэс-служба Сколтеха

«Важна максымізаваць інфарматыўнасць атрымліваецца выявы, неабходна ўлічваць асаблівасці чалавечага зроку, у прыватнасці, яго нелінейнасць і якасна розную адчувальнасць да зменаў яркасці і каляровасці.

І, хоць тэорыя цветовоспріятія даследуецца даволі даўно (яшчэ з першай паловы XX стагоддзя), да гэтага часу нават сярод экспертаў няма агульнапрызнаных матэматычных мадэляў, дастаткова добра апісваюць усе вядомыя ўласцівасці чалавечага зроку », - распавядае першы аўтар даследавання, аспірантка Сколтеха Анастасія Сарычева.

Даследчыкі з Цэнтра Сколтеха па навуковых і інжынерных вылічальных тэхналогіях для задач з вялікімі масівамі дадзеных (CDISE) і Лабараторыі глядзельных сістэм ИППИ РАН прапанавалі новы падыход да візуалізацыі дадзеных МСИ, не які саступае раней вядомым метадам па ўзроўні дэталізацыі, але пры гэтым заснаваны на тэорыі чалавечага цветовоспріятія .

Новы метад захоўвае межы і градыенты пры накладанні вылучаных абласцей падобнага іённага складу. У сілу гэтага, якое атрымліваецца малюнак інтэрпрэтуецца лягчэй, чым у іншых падыходах да візуалізацыі МСИ дадзеных. Метад быў правераны як на мадэльных, так і на Эксперыментальная інфармацыя, атрыманых даследнікамі лабараторыі мас-спектраметрыі Сколтеха сумесна з біёлагамі Цэнтра нейробиологии і нейрореабилитации Сколтеха.

Крыніца: Naked Science

Чытаць далей