Skoletech இல், டிஎன்ஏ பேக்கிங் முறைகள் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது

Anonim
Skoletech இல், டிஎன்ஏ பேக்கிங் முறைகள் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது 10627_1
Skoletech இல், டிஎன்ஏ பேக்கிங் முறைகள் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது

பத்திரிகை இயற்கை தகவல்தொடர்புகளில் கட்டுரை வெளியிடப்படுகிறது. இதுவரை இரண்டு மீட்டர் டி.என்.ஏ நூலகம் மனித உயிரினத்தின் சிறிய கர்னலில் வைக்கப்படுகிறது, இதனால் குரோமடின், டிஎன்ஏ சிக்கலான மற்றும் புரதங்கள், இது சிறியதாக மாறும், ஆனால் சிக்கலான கட்டமைப்புகளாக மாறும். டி.என்.ஏ பேக்கேஜிங் முறைகள் ஆய்வு செய்ய, உலகெங்கிலும் உள்ள விஞ்ஞானிகள் குரோமோசோம்களை (3C) இணக்கமாக மாற்றியமைப்பதன் மூலம் பயன்படுத்தப்படுகிறார்கள், மேலும் அவற்றின் மிகச் சிறந்த உற்பத்தியில் ஒன்று ஹை-சி முறையாகும். உயர் செயல்திறன் வரிசைமுறையைப் பயன்படுத்தி முழு மரபணுவின் டி.என்.ஏவின் தொடர்புகளையும் கண்டறிய இது அனுமதிக்கிறது.

இதில், ஒரு சிக்கல் உள்ளது: Hi-C வேலை டி.என்.ஏ மைக்ரோகிராம்களை டஜன் கணக்கான தேவைப்படுகிறது - அதாவது, ஒரு தனித்துவமான இடமாற்ற நிறமின் அமைப்புடன் மில்லியன் கணக்கான செல்கள் ஆகும். தனிப்பட்ட செல்கள் டி.என்.ஏ பேக்கேஜிங் அம்சங்களை கணக்கில் எடுத்துக்கொள்ளாத ஒரு பொதுவான படத்தைப் பெற இந்த தகவல் சராசரியாக இருக்க வேண்டும்.

"சராசரி நபர்" உண்மையில் இல்லை என, பாரம்பரிய ஹை-சி முறை காட்ட முடியாது, டி.என்.ஏ பிரிவுகளின் பல தொடர்புகளில் ஒரே கலத்தில் ஒரே நேரத்தில் நிகழ்கிறது. கூடுதலாக, இந்த "கூட்டு உருவப்படம்", என்ன உடல் செயல்முறைகள் குரோமடின் ஒரு முப்பரிமாண கட்டமைப்பை உருவாக்கும் என்ன புரிந்து கொள்ள உதவுகிறது.

"உதாரணமாக, சில கட்டமைப்புகளைப் பார்க்கிறோம், உதாரணமாக DOPOGRICAL தொடர்புடைய களங்கள் (TADADA) சராசரியாக டி.என்.ஏ தொடர்பு அட்டைகளில், ஆனால் அவை தனிப்பட்ட செல்கள் உள்ளதா இல்லையா என்பது எங்களுக்குத் தெரியாது, அல்லது இந்த கலைப்பொருட்கள் சராசரியாக உள்ளன. கூடுதலாக, மரபணு வெளிப்பாட்டின் பார்வையில் இருந்து, பரந்த பல்வேறு வகைகளில் கூட அதே திசுக்களின் செல்கள் ஏற்படுகின்றன என்று நாங்கள் அறிவோம் - இங்கிருந்து அவை கட்டமைப்பு மட்டத்தில் உள்ளவை எவ்வாறு வேறுபடுகின்றன என்பதைப் பற்றி ஒரு இயற்கை கேள்வி உள்ளது "என்று Co- Mikhail Gelfand இன் எழுத்தாளர், துணை ஜனாதிபதி ஸ்கொலதாவின் பயோமெடிகல் ஆராய்ச்சி படி.

Skoletech இல், டிஎன்ஏ பேக்கிங் முறைகள் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது 10627_2
HAILOIL X- நிறமூர்த்தத்தின் மூன்று பரிமாண சரிவு / © www.natur.com

இந்த சிக்கல்களை தீர்க்க மற்றும் ஒரு பரிசோதனையை ஒரு பரிசோதனையை தனிப்பட்ட செல்கள் மிகவும் ஏற்ற வகையில், பல நிறுவனங்களின் ஆராய்ச்சியாளர்கள் ஹை-சி ஒற்றை செல்கள் என்று ஒரு முறையை உருவாக்கியுள்ளனர். லைஃப் ஸ்கூப் கேத்தரின் சர்ச் தலைமையிலான Skoltech அணி Hi-C ஒற்றை செல்கள் தரவு செயலாக்க மேம்படுத்த மற்றும் drosophila செல்கள் அடிப்படை பண்புகள் ஆராய ஒரு பணியை வழங்கினார்.

ரஷியன் அகாடமி மற்றும் மாஸ்கோ மாநில பல்கலைக்கழகத்தின் உயிரியல் இன்ஸ்டிடியூட் ஆஃப் ரஷியன் அகாடமி மற்றும் மாஸ்கோ மாநில பல்கலைக்கழகத்தின் உயிரியல் இன்ஸ்டிடியூட் ஆஃப் ரஷியன்-பிரஞ்சு INDRIncyPinary விஞ்ஞான மையத்தின் Poncele பணியாளர்களுடன், டிரோசோபிலா செல்கள் சோதனைகள் பொருத்தமான செய்ய முறையை உகந்ததாக .

அணிகள் ஹை-சி முறையின் நிலையான நடவடிக்கைகளுடன் தொடங்கியது, இதில் குரோமடின் கட்டமைப்பு வேதியியல் ரீதியாக நிர்ணயிக்கப்படுகிறது, மற்றும் டி.என்.ஏ வெட்டி "மறுபரிசீலனை" என்று கூறுகிறது, அதனால் இயற்கை நிலைமைகளில் உள்ள துண்டுகள், "sewn ". ஆனால் அதற்கு பதிலாக ஒரே நேரத்தில் அனைத்து டி.என்.ஏ பயன்படுத்துவதற்கு பதிலாக, விஞ்ஞானிகள் Phi29 பாக்டீரியாபேஜ் பாலிமிரேஸ் பயன்படுத்தி ஒவ்வொரு செல் இருந்து டி.என்.ஏ சிறிய அளவு அதிகரிக்கிறது. டி.என்.ஏவை அதிகரிக்கும்போது, ​​டி.என்.ஏவை அதிகரிக்கும்போது, ​​டி.என்.ஏ யின் பெருமளவிலான டி.என்.ஏவை உருவாக்கும் திறன் காரணமாக இந்த பாலிமரேரேஸ் பயன்படுத்தப்படுகிறது, இது மிகவும் பிரபலமான பாலிமர்ஸை விட மிகவும் சிறிய எண்ணிக்கையிலான பிழைகள்.

இருப்பினும், இந்த வசதியான டி.என்.ஏ பாலிமிரேஸ், நகலெடுக்கும் அதிக துல்லியத்தன்மையைக் காட்டிலும், டி.என்.ஏ மூலக்கூறுகளுக்கு இடையில் "குதிக்க", ஹை-சி படிமுறை உண்மையான தொடர்புகளில் இருந்து வேறுபட முடியாது என்று செயற்கை பத்திரங்களை உருவாக்குகிறது. எனவே, ஆராய்ச்சியாளர்கள் பாலிமரேஸின் இந்த சீரற்ற "தாவல்கள்" நிராகரிப்புக்கு ஒரு வழிமுறையுடன் வர வேண்டியிருந்தது.

பல்வேறு உயிரினங்கள் குரோமடின் பேக்கேஜிங் பொதுவான அடிப்படை கொள்கைகளை கொண்டிருந்தால், Drosophila செல்கள் தங்கள் புதிய முறையைப் பயன்படுத்தின. பாலூட்டிகளின் செல்கள் பற்றிய முந்தைய ஆய்வுகள், மக்கள் ஹை-சி மூலம் பெறப்பட்ட தொடர்பு அட்டைகளில் மட்டுமே சூழல்களின் இருப்பை சுட்டிக்காட்டியது, ஆனால் தனிப்பட்ட செல்கள் அல்ல. இருப்பினும், Drosophila செல்கள் ஆய்வு இந்த களங்கள் ஒவ்வொரு குறிப்பிட்ட செல் என்று காட்டியது.

Skoletech இல், டிஎன்ஏ பேக்கிங் முறைகள் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது 10627_3
Drosophila / © www.natur.com இன் 3D-genome இல் ஆர்டர் மற்றும் stochasticity

இந்த நிலையான களங்கள் உருவாவதற்கு எந்த உயிரியல் வழிமுறை பொறுப்பு என்பதை புரிந்து கொள்ள, கூடுதல் ஆராய்ச்சி தேவைப்படும்; விஞ்ஞானிகள் தங்கள் நிகழ்வின் இரண்டு மாதிரிகள் வழங்கியிருக்கையில். Drosophila உள்ள குரோமடின் "ஒட்டும் தன்மை" இயந்திரம் ஏற்பாடு என்று கூறுகிறது, அதாவது, அதன் சில பிரிவுகள் சில ஒருவருக்கொருவர் இணைக்கப்பட வாய்ப்பு அதிகம். மற்றொரு படி, என அழைக்கப்படும் கீல்கள் பிரித்தெடுத்தல் பொறிமுறையை விவரிக்கும், பெரிய புரத வளாகங்கள் டி.என்.ஏ நூல்களில் இருந்து சுழல்கள் உருவாக்குகின்றன மற்றும் இந்த தொகுப்பு டி.என்.ஏ காரணமாக.

"ஒருவேளை மிகவும் சுவாரஸ்யமான பிரச்சினைகளில் ஒன்று, மடிப்பு குரோமடின் விதிகள் பல்வேறு வகையான உயிரினங்களில் ஒரே மாதிரியானவை. ஒற்றை செல்கள், droozophils ஹை-சி முறை பயன்படுத்தி, நாம் பாலூட்டிகளின் செல்கள் உள்ள களங்கள் போன்ற களங்கள் இந்த பூச்சி மரபணு உள்ளது என்று கண்டுபிடிக்கப்பட்டது. எனினும், இந்த கட்டமைப்புகள் பாலூட்டிகளில் விட மிகவும் கட்டளையிடப்பட்டுள்ளன "என்று அலெக்ஸாண்டர் Galitsyn, Scholtech பட்டதாரி மாணவர் மற்றும் கட்டுரையின் முதல் ஆசிரியர்களில் ஒருவர் கூறினார்.

"சுழல்கள் மற்றும் டாடோவின் உருவாவதற்கு குரோமடின் மற்றும் இயக்கவியல் கட்டிடக்கலைகளையும் நாங்கள் தொடர்ந்து படிப்போம். பதில்கள் இல்லாமல் இந்த பகுதியில் பல கேள்விகள் உள்ளன. சில உயிரினங்களில் உள்ள இந்த வழிமுறைகள் வேறுபடலாம் என்று ஏற்கனவே அறிந்திருக்கிறோம், ஆனால் ஒட்டுமொத்த தோற்றமளிக்கும் பரிணாமம் என்ன? நாம் இதை புரிந்து கொள்ள விரும்பினால், போதுமான அளவிலான விவரம், இடைவெளிகளை நிரப்ப வேண்டும், விசித்திரமான உயிரினங்களில் குரோமடின் கட்டமைப்பைப் படிப்பதோடு, ஏற்கனவே நன்கு விசாரணை செய்யப்பட்டவை அல்ல. எனவே, நாங்கள் ஏற்கனவே கடல் கடற்பாசிகள், ஈஸ்ட் மற்றும் அமீபாஸுடன் பணிபுரிகிறோம், "என்கிறார் கேத்தரின் டெம்பெவா.

அவளைப் பொறுத்தவரை, குழுக்கள் நோயாளிகளுடன், உடலின் மற்றும் வயதானவர்களின் வளர்ச்சியுடன் குரோமடின் அமைப்பில் மாற்றங்கள் ஏற்படுகின்றன. "குரோமடினாவின் கட்டிடக்கலை மரபணுக்களின் வெளிப்பாடாக நெருக்கமாக தொடர்புடையதாக இருப்பதாக நாங்கள் கருதினால், இந்த கேள்விகளுக்கு பதிலளித்தோம், மனித உடல், வயதான மற்றும் நோய்களின் வளர்ச்சியை ஒழுங்குபடுத்தும் விதிமுறைகளை நாம் சமாளிக்க முடியும்" என்கிறார் டெஹ்ரேவா கூறுகிறார்.

ரஷ்ய அகாடமி அகாடமி ஆஃப் சயின்சின் ஜெனாவின் உயிரியல் இன்ஸ்டிடியூட் இன்ஸ்டிடியூட் ஆப் பிரான்ஸ் விஞ்ஞான ஆராய்ச்சிக்கான தேசிய மையம், ரஷ்ய-பிரெஞ்சு இன்டிசிபுல்லரி விஞ்ஞான மைய மையம் பொன்சேல் மற்றும் பிற அமைப்புகளுக்கான தேசிய மையமாக எம்.. லாமோனோசோவிற்குப் பெயரிடப்பட்ட மாஸ்கோ மாநில பல்கலைக்கழகம்.

மூல: நிர்வாண விஞ்ஞானம்

மேலும் வாசிக்க