Virus är de mest många biologiska föremålen på vår planet. Och antalet bakteriofager, även kända som fagervirus, infekterar bakterieceller och arkeys, enligt forskarnas uppskattningar, är 1031 partiklar. De påverkar starkt de mikrobiella samhällena, som fungerar som horisontella genöverföringsvektorer som kodar för hjälpfunktioner, användbara för typer av bakterie-värdar.
I årtionden har forskare lidit fager inte så fort som de ville, dock på grund av uppkomsten av en högpresterande metagenomyl, blev det möjligt att upptäcka ett oöverträffat antal nya fager. Således var den oväntade upptäckten att majoriteten av fagsekvenserna inte kunde hänföras till någon känd virus taxonomi som fastställdes av den internationella kommittén om virus taxonomi (ICTV).
Det är känt att fager påverkar olika ekosystem, och med tanke på vikten av kompositionen och funktioner i tarmmikrobiom för människors hälsa, började öka uppmärksamheten att ägna sig åt de fager som bor i kroppen. Obalansen i bakteriernas aggregat leder till utvecklingen av många sjukdomar och komplexa stater, såsom allergier och fetma. Men hittills visste vi relativt lite om den roll som tarmbakterier och bakteriofager spelar i hälsa och mänskliga sjukdomar.
Forskare från laboratoriet för interaktion mellan värd och Microbiota vid Institutet för Senger och European Institute of Bioinformatics (Storbritannien), som tillämpade DNA-sekvenseringsmetoden, vilket gjorde en katalog över biologisk mångfald av viralart som upptäcktes i 28,060 uppsättningar av humana intestinala genomer som samlades in i 28 olika länder i sex kontinenter (Afrika, Asien, Europa, Nordamerika, Sydamerika och Oceanien) och 2898 genomer av bakterieolyckor, som uppväckt från detta bukorgan. Resultaten av deras arbete presenteras i cellmagasin.
Forskare har upptäckt 142 809 genomer av fagerna som bor i tarmarna hos en person, varav mer än hälften någonsin har träffat tidigare. Viral mångfald visade sig vara den högsta bland en sådan typ av bakterier som företag. Samtidigt var cirka 36% av virala kluster inte begränsade till en typ, vilket skapade nätverksströmmar av gener mellan fylogenetiskt olika typer av bakterier.
Bland tiotusentals virus har forskare identifierat en ny utbredd uppsättning fager med egenskaper som liknar crassphage bakteriofag, upptäckt 2014 i avloppsvatten i många länder. Denna gruppinfektion av gramnegativa anaeroba bakteriebakterier av Bacteroidaceae-familjen kallades Gubafag. Och enligt experter, hon och Crassphage - en gemensam förfader.
"Vi observerade också en tydlig separation mellan invånarna i invånarna i Nordamerika, Europa och Asien och prover från Afrika och Sydamerika. Intressant, fagiommönster (en uppsättning sekvenser av alla faggenomer i provet. - Ref. Ed.) Korrelat med viktiga skillnader i en persons livsstil. Och de fager som finns i stadsprover riktades mot bakteroider, men inte på bakterierna av Prevotellacea-familjen, medan i landsbygdsprover från Peru, Tanzania, Madagaskar och Fiji innehöll fager med en rad ägare, som syftar till Prevotellaceae istället för Bacteroides, "Forskare berättade.
Enligt dem kommer den resulterande högkvalitativa storskaliga katalogen av fager att förbättra framtida studier av virus - viruskomponenten i tarmmikrobiomet - och kommer att göra det möjligt att ekologisk och evolutionär analys av humana intestinala bakteriofager.
"Det måste komma ihåg att inte alla virus är skadliga: de är en integrerad del av tarmkosystemet. De flesta av de virus som vi avslöjade har DNA som ett genetiskt material, det vill säga skiljer sig från de välkända patogenerna, såsom Coronavirus SARS-COV-2 eller ZIKA-viruset, som är RNA-virus. För det andra erhölls våra prover huvudsakligen från friska människor som inte har några specifika sjukdomar, säger Dr. Alexander Almeida, en av författarna till studien.
Källa: Naken vetenskap