Skapade en metod för visualisering av masspektrometrisk bild, anpassad under mänsklig vision

Anonim
Skapade en metod för visualisering av masspektrometrisk bild, anpassad under mänsklig vision 14929_1
Skapade en metod för visualisering av masspektrometrisk bild, anpassad under mänsklig vision

Resultaten av studien publiceras i tidskriften Analytical Chemistry. Högupplöst masspektrometri är en substansanalysmetod baserat på noggrann mätning av massförhållandet att ladda (m / z) joniserade molekyler och intensiteten hos motsvarande signal från dem (deras relativa kvantitet). Denna information gör att du kan bestämma molekylvikten för föreningarna, deras struktur, som hjälper till att identifiera föreningar, såsom proteiner, lipider, metaboliter, peptider, läkemedelskomponenter och andra ämnen.

Masspektrometrisk IMIJING (MCI) låter dig få information om den rumsliga fördelningen av molekyler i vävnader, vilket leder masspektrometrisk analys av joner vid lokal laserjonisering av molekyler vid varje punkt av provet under studie (till exempel en tumörskärning).

Tolkning av MSI-data är en svår uppgift. Ursprungligen är det nödvändigt att visualisera fördelningen av joner på ytan av vävnadsavstängningsytan, det vill säga att konstruera en normal färgbild, i vilken varje område som har en liknande jonkomposition - motsvarar dess färg. Från tusentals joner vid varje punkt måste du gå till bara tre numeriska värden som bör respektera MSI-data så fullständigt och som kan korreleras med tredimensionellt färgutrymme för sin efterföljande analys av forskaren.

Skapade en metod för visualisering av masspektrometrisk bild, anpassad under mänsklig vision 14929_2
Beskrivning av metoden / © Skoltech Press Service

"Det är viktigt att maximera informationsinnehållet i den resulterande bilden, det är nödvändigt att ta hänsyn till funktionerna i människans vision, i synnerhet dess icke-linearitet och kvalitativt olika känslighet för förändringar i ljusstyrka och chroma.

, Även om teorin om färguppfattning undersöks under ganska lång tid (sedan första hälften av 20-talet), även bland experterna, finns det inte allmänt accepterade matematiska modeller, ganska väl beskrivna alla kända egenskaper hos människans vision , "Den första författaren av studien, säger Graduate Student Skoltech Anastasia Sarychev.

Forskare från centrumet för vetenskaplig och teknisk datorteknik för uppgifter med stora datarrays (CDEISE) och laboratoriet för Visual Spi Ras erbjöd ett nytt tillvägagångssätt för visualisering av MSI-data, inte sämre än tidigare kända metoder i detalj, men vid samma tid baserad på teorin om mänsklig färguppfattning.

Den nya metoden behåller gränser och gradienter vid applicering av utvalda områden med liknande jonisk komposition. På grund av detta tolkas den resulterande bilden lättare än i andra tillvägagångssätt för avbildning av MSI-data. Metoden har testats både på modell och experimentdata erhållna av forskare av laboratoriet för masspektrometri av Skolteha tillsammans med biologerna i centrum av Neurobiology och Neuroability of Scothech.

Källa: Naken vetenskap

Läs mer