Саставио најпопуларнији каталог вируса који живе у људском цреву

Anonim
Саставио најпопуларнији каталог вируса који живе у људском цреву 2040_1
Саставио најпопуларнији каталог вируса који живе у људском цреву

Вируси су најбројнији биолошки предмети на нашој планети. И број бактериофага, познатих и као фаге - вируси, инфицирање бактеријских ћелија и археја, према проценама научника, је 1031 честица. Снажно утичу на микробне заједнице, делујући као хоризонтални вектори преноса гена који кодирају помоћне функције, корисне за врсте бактерија-домаћина.

Десетљећима су истраживачи претрпели фаге који нису толико брзо колико желе, међутим, због појаве метагеномиле високих перформанси, постали су могуће открити невиђен број нових фага. Дакле, неочекивано откриће је да се већина фагових секвенци не може приписати некој познати вирусна таксономија коју је успоставио Међународни комитет за таксономију вируса (ИЦТВ).

Познато је да фагови утичу на различите екосистеме и с обзиром на важност састава и функција цревне микробиове за здравље људи, све већа пажња почела је да се фагови настањују у овом телу. Неравнотежа у агрегату бактерија доводи до развоја многих болести и сложених држава, као што су алергије и гојазност. Међутим, до сада смо релативно мало знали о улози која су цревне бактерије и бактериофаге играју у здравству и људским болестима.

Научници из лабораторија интеракције између домаћина и микробиоте на Институту Сенгера и Европског института за биоинформатику (Уједињено Краљевство), наношење методе секвенцирања ДНК-а направио је каталог биодиверзитета вирусне врсте откривене у 28.060 скупова на 28.060 скупова прикупљених на сакупљеним улагању у 28.060 скупа цревних генома у 28.060 28 различитих земаља на шест континената (Африка, Азија, Европа, Северна Америка, Јужна Америка и Океанија) и 2898 генома бактеријских изолата, који су се подигли из овог трбушног органа. Резултати њиховог рада представљени су у ћелијском часопису.

Научници су открили 142.809 генома фалога који живе у цревима особе, од којих је икада раније икада срели. Вирусна разноликост је показала да је највиша међу таквим врстама бактерија као фирми. Истовремено, око 36% вирусних кластера није било ограничено на једну врсту, стварајући мрежне токове гена између филогенетки различитих врста бактерија.

Саставио најпопуларнији каталог вируса који живе у људском цреву 2040_2
Бактериофаг и његова структура / © Гетти Имагес

Међу десетинама хиљада вируса, научници су идентификовали нови широко распрострањени сет факата са карактеристикама који подсећају на црасспхаге бактериофажу, откривено у отпадним водама многих земаља. Ова група занимају грам-негативне анаеробне бактерије бактерија бактеријске породице звала се ГУБАФАГ. И према стручњацима, она и црассфаге - заједнички предак.

"Такође смо приметили јасно раздвајање између фагоната становника Северне Америке, Европе и Азије и узорака из Африке и Јужне Америке. Занимљиво је да се дезове фагиома (скуп секвенци свих фага геномија у узорку. - Реф. Ед.) Корелирано са важним разликама у начину живота особе. А фагови који се налазе у урбаним узорцима били су усмерени на бактерије, али не и на бактерије породице превотеллацеа, док у руралним узорцима из Перу, Танзаније, Мадагаскара и Фиџима садржавали су фаге са низом власника, уместо бактела, уместо бактела, уместо бактела рекао.

Према њима, резултирајући висококвалитетни каталог генома великог квалитета побољшаће будуће студије вируса - компонента вируса цревне микробиома - и омогућиће је еколошком и еволутивном анализом бактериоца о цревима људи.

"Мора да се памти да нису сви вируси штетни: то су интегрална компонента цревног екосистема. Већина вируса који смо открили да имају ДНК као генетски материјал, односно разликују се од познатих патогена, попут Цоронавирус САРС-Цов-2 или Вирус Зика, који су вируси РНА. Друго, наши узорци су добијени углавном од здравих људи који немају никакве специфичне болести ", рекао је др Александар Алмеида, један од аутора студије.

Извор: Гола наука

Опширније