Përpiloi katalogun më të plotë të viruseve që banonin në zorrën njerëzore

Anonim
Përpiloi katalogun më të plotë të viruseve që banonin në zorrën njerëzore 2040_1
Përpiloi katalogun më të plotë të viruseve që banonin në zorrën njerëzore

Viruset janë objektet më të shumta biologjike në planetin tonë. Dhe numri i bakteriofagëve, i njohur edhe si fag - viruse, duke infektuar qelizat bakteriale dhe archaeys, sipas vlerësimeve të shkencëtarëve, është 1031 grimca. Ata ndikojnë fuqimisht në komunitetet mikrobiale, duke vepruar si vektorë horizontalë të transferimit të gjeneve që kodojnë funksionet ndihmëse, të dobishme për llojet e baktereve-pret.

Për dekada të tëra, studiuesit kanë pësuar fagë jo aq shpejt sa donin, megjithatë, për shkak të shfaqjes së një metagenomyle të performancës së lartë, u bë e mundur të zbulonte një numër të paparë të fagëve të rinj. Kështu, zbulimi i papritur ishte se shumica e sekuencave të fagit nuk mund t'i atribuoheshin ndonjë taksonomie virale të njohur të krijuar nga Komiteti Ndërkombëtar për Taksonin e Virusit (ICTV).

Dihet se fazat ndikojnë në ekosisteme të ndryshme, dhe duke pasur parasysh rëndësinë e përbërjes dhe funksioneve të mikrobiomës së zorrëve për shëndetin e njeriut, rritja e vëmendjes filloi t'i kushtojë fagëve që banojnë në këtë trup. Mosbalancimi në agregat të baktereve çon në zhvillimin e shumë sëmundjeve dhe shteteve komplekse, siç janë alergjitë dhe obeziteti. Megjithatë, deri më tani, ne e dinim relativisht pak për rolin që bakteret e zorrëve dhe bakteriofagët luajnë në shëndetin dhe sëmundjet njerëzore.

Shkencëtarët nga laboratori i ndërveprimit midis pritësisë dhe mikrobiotave në Institutin e Sëmundjes dhe Institutit Europian të Bioinformatikës (Mbretëria e Bashkuar), duke aplikuar metodën e sekuencës së ADN-së, bëri një katalog të biodiversitetit të specieve virale të zbuluara në 28,060 grupe të gjenomëve të zorrëve njerëzorë të mbledhur 28 vende të ndryshme në gjashtë kontinente (Afrikë, Azi, Evropë, Amerikën e Veriut, Amerikën e Jugut dhe Oqeani), dhe 2898 gjenoma të izolimeve bakteriale, të cilat u ngritën nga ky organ i barkut. Rezultatet e punës së tyre janë paraqitur në revistën qelizore.

Shkencëtarët kanë zbuluar 142,809 gjenoma të fages që jetojnë në zorrë të një personi, më shumë se gjysma e të cilëve kanë takuar ndonjëherë më parë. Diversiteti viral doli të jetë më i larti në mesin e një lloji të tillë të baktereve si firma. Në të njëjtën kohë, rreth 36% e grupimeve virale nuk ishin të kufizuara në një lloj, duke krijuar rrjedha të rrjeteve të gjeneve midis llojeve të ndryshme të baktereve.

Përpiloi katalogun më të plotë të viruseve që banonin në zorrën njerëzore 2040_2
Bakteriofage dhe struktura e saj / © Getty Images

Midis dhjetëra mijëra viruseve, shkencëtarët kanë identifikuar një grup të ri të përhapur të fageve me karakteristika që i ngjan bakteriofagës së Crasafage, zbuluar në 2014 në ujërat e zeza të shumë vendeve. Ky grup që infekton bakteret e baktereve anerobike Gram-negative të familjes Bacteroidaceae u quajt Gubafag. Dhe, sipas ekspertëve, ajo dhe crasafage - një paraardhës i përbashkët.

"Ne gjithashtu vërejtëm një ndarje të qartë midis fagomave të banorëve të Amerikës së Veriut, Evropës dhe Azisë dhe mostrave nga Afrika dhe Amerika e Jugut. Interesante, modelet e fagioma (një grup i sekuencave të të gjitha genomeve fag në mostër. - Ref. Ed.) Lidhen me dallimet e rëndësishme në mënyrën e jetesës së një personi. Dhe fagët që gjenden në mostrat urbane kishin për qëllim bakteret, por jo në bakteret e familjes së prevoteleace, ndërsa në mostrat rurale nga Peruja, Tanzania, Madagaskari dhe Fixhi përmbante fages me një sërë pronarëve që synonin prevotelet, "shkencëtarë në vend të bacteroideve" tha.

Sipas tyre, katalogu që rezulton me cilësi të lartë në shkallë të gjerë të gjenomëve të fages do të përmirësojë studimet e ardhshme të virusit - komponenti i virusit të mikrobiomës së zorrëve - dhe do të bëjë të mundur analizën ekologjike dhe evolucionare të bakteriofagëve të zorrëve njerëzorë.

"Duhet të mbahet mend se jo të gjitha viruset janë të dëmshme: ato janë një komponent integral i ekosistemit të zorrëve. Shumica e viruseve që kemi zbuluar kanë ADN si një material gjenetik, domethënë, ndryshojnë nga patogjenët e njohur, të tilla si Coronavirus SARS-COV-2 ose virusi Zika, të cilat janë viruse ARN. Së dyti, mostrat tona u morën kryesisht nga njerëz të shëndetshëm që nuk kanë ndonjë sëmundje specifike ", tha Dr. Alexander Almeida, një nga autorët e studimit.

Burimi: Shkenca e zhveshur

Lexo më shumë