Skompilowane najbardziej kompletny katalog wirusów zamieszkujących jelito ludzkie

Anonim
Skompilowane najbardziej kompletny katalog wirusów zamieszkujących jelito ludzkie 2040_1
Skompilowane najbardziej kompletny katalog wirusów zamieszkujących jelito ludzkie

Wirusy są najbardziej liczne obiektami biologicznymi na naszej planecie. I liczba bakteriofagów, znana również jako fagi - wirusy, zakażanie komórek bakteryjnych i archeys, według szacunków naukowców wynosi 1031 cząstek. Zdecydowanie wpływają na społeczności mikrobiologiczne, działając jako poziome wektory transferu genu kodujące funkcje pomocnicze, przydatne dla typów hostów bakterii.

Przez dziesięciolecia naukowcy doznali fagów nie tak szybko, jak chcieli, jednak ze względu na pojawienie się o wysokiej wydajności Metagenomino, stało się możliwe wykrycie bezprecedensowej liczby nowych fagów. Tak więc nieoczekiwane odkrycie było to, że większość sekwencji fagowych nie mogła być przypisana do żadnej znanej taksonomii wirusowej ustanowionej przez Międzynarodowy Komitet ds. Taxonomy Wirusa (ICTV).

Wiadomo, że fagi wpływają na różne ekosystemy i biorąc pod uwagę znaczenie kompozycji i funkcji mikrobiaka jelitowego dla zdrowia ludzkiego, zwiększając uwagę zwróconej uwagę na poświęcenie fagów zamieszkujących to ciało. Nierównowaga w agregacie bakterii prowadzi do rozwoju wielu chorób i złożonych państw, takich jak alergie i otyłość. Jednak do tej pory znaliśmy stosunkowo niewiele o roli, że bakterie jelitowe i bakteriofaga grają w zdrowiu i chorobach ludzkich.

Naukowcy z laboratorium interakcji między gospodarzem a mikrobiotą w Instytucie Sengera i Europejskiego Instytutu Bioinformatyki (Wielka Brytania), stosując metodę sekwencjonowania DNA dokonane katalog różnorodności biologicznej gatunków wirusowych odkrytych w 28.060 zestawach genomów ludzkich jelit zebranych 28 różnych krajów w sześciu kontynentach (Afryka, Azja, Europa, Ameryka Północna, Ameryka Południowa i Oceania) i 2898 genomów izolatów bakteryjnych, które podniesione z tego organu brzusznego. Wyniki ich pracy są prezentowane w magazynie komórkowym.

Naukowcy odkryli 142,809 genomów fagów żyjących w jelicie osobie, ponad połowa, z których kiedykolwiek spotkały się wcześniej. Różnorodność wirusowa okazała się najwyższa wśród takiego rodzaju bakterii jako firm. W tym samym czasie około 36% klastrów wirusowych nie ogranicza się do jednego typu, tworząc strumienie sieciowe genów między filogenetycznie różnymi typami bakterii.

Skompilowane najbardziej kompletny katalog wirusów zamieszkujących jelito ludzkie 2040_2
Bakteriofag i jego struktura / © Getty Images

Wśród dziesiątek tysięcy wirusów naukowcy zidentyfikowali nowy powszechny zestaw fagów z charakterystyką przypominającą bakteriofag o kresję, odkryto w 2014 r. W ściekach wielu krajów. Ta grupa zainfekowała gram-negatywne bakterie bakterii bakterii bakteroidaidaidai, nazywano Gubafag. I, według ekspertów, ona i kresją - wspólny przodek.

"Zaobserwowaliśmy również wyraźną separament między Fagomami mieszkańców Ameryki Północnej, Europy i Azji i próbek z Afryki i Ameryki Południowej. Co ciekawe, fagioma wzorce (zestaw sekwencji wszystkich genomów fagowych w próbce. - Ref. Ed.) Skorelowany z ważnymi różnicami w stylu życia osoby. I fagi znalezione w próbkach miejskich miały na celu bakteroidy, ale nie na bakterii rodziny Prevotellelacea, podczas gdy w próbkach wiejskich z Peru, Tanzanii, Madagaskaru i Fidżi zawierały fagi z szeregu właścicieli mających na celu prevotellaceae zamiast bakteroidy, "naukowcy powiedział.

Według nich, wynikająca z wysokiej wysokiej jakości katalog genomów fagów poprawi przyszłe badania wirusa - składnika wirusa mikrobiaka jelitowego - i umożliwi ekologiczną i ewolucyjną analizę bakteriofagów ludzkich.

"Należy pamiętać, że nie wszystkie wirusy są szkodliwe: są integralnym składnikiem ekosystemu jelitowego. Większość wirusów, które ujawniliśmy, ma DNA jako materiał genetyczny, to znaczy różnią się od znanych patogenów, takich jak Coronavirus Sars-Cov-2 lub wirus ZIKA, które są wirusami RNA. Po drugie, nasze próbki uzyskano głównie od zdrowych osób, które nie mają żadnych konkretnych chorób ", powiedział dr Aleksander Almeida, jeden z autorów badań.

Źródło: Naked Science

Czytaj więcej