Stworzył metodę wizualizacji obrazu spektrometrycznego masowego, dostosowany pod ludzką wizją

Anonim
Stworzył metodę wizualizacji obrazu spektrometrycznego masowego, dostosowany pod ludzką wizją 14929_1
Stworzył metodę wizualizacji obrazu spektrometrycznego masowego, dostosowany pod ludzką wizją

Wyniki badania są publikowane w chemii analitycznej dziennika. Spektrometria masowa o wysokiej rozdzielczości jest metodą analizy substancji w oparciu o dokładny pomiar stosunku masy do ładowania (m / z) cząsteczki zjonizowane i intensywność odpowiedniego sygnału (ich względna). Informacje te pozwalają określić masę cząsteczkową związków, ich strukturę, która pomaga zidentyfikować związki, takie jak białka, lipidy, metabolity, peptydy, składniki leków i innych substancji.

Spektrometryczne spektrometryczne Imijjing (MCI) umożliwia uzyskanie informacji na temat rozkładu przestrzennego cząsteczek w tkankach, prowadzącą analizę spektrometryczną masę jonów w lokalnej jonizacji laserowej cząsteczek w każdym punkcie badanego próbki (na przykład, wycinanie guza).

Interpretacja danych MSI jest trudnym zadaniem. Początkowo konieczne jest wizualizacja rozkładu jonów na powierzchni powierzchni odcięcia tkanki, która jest, aby skonstruować normalny obraz koloru, w którym każdy obszar ma podobną kompozycję jonową - odpowiada jej kolorowi. Od tysięcy jonów w każdym punkcie musisz przejść do zaledwie trzech wartości numerycznych, które powinny szanować dane MSI w pełni i które mogą być skorelowane z trójwymiarową przestrzenią kolorów dla jego późniejszej analizy przez badacza.

Stworzył metodę wizualizacji obrazu spektrometrycznego masowego, dostosowany pod ludzką wizją 14929_2
Opis metody / © SKOLTECH Press Service

"Ważne jest, aby zmaksymalizować zawartość informacji o wynikowym obrazie, należy wziąć pod uwagę cechy ludzkiej wizji, w szczególności jej nieliniowości i jakościowo różnej wrażliwości na zmiany jasności i chroma.

I chociaż teoria postrzegania kolorów jest zbadana przez długi czas (od pierwszej połowy XX wieku), nawet wśród ekspertów nie ma ogólnie przyjętych modeli matematycznych, dość dobrze opisujące wszystkie znane właściwości ludzkiej wizji : "Pierwszy autor badanie, dyplomowy student Skoltech Anastasia Sarchev mówi.

Naukowcy z centrum technologii obliczeniowych naukowych i inżynieryjnych dla zadań z dużymi tablicami danych (CDISE) oraz laboratorium wizualnego SPI RAS oferowały nowe podejście do wizualizacji danych MSI, nie gorsze od wcześniej znanych metod pod względem szczegółowości, ale w taki sam czas na podstawie teorii postrzegania koloru ludzkiego.

Nowa metoda zachowuje granice i gradienty przy stosowaniu wybranych obszarów podobnej kompozycji jonowej. Z tego powodu wynikowy obraz jest łatwiejszy niż w innych podejściach do obrazowania danych MSI. Metoda została przetestowana zarówno na modelach, jak i danych eksperymentalnych uzyskanych przez naukowców laboratorium spektrometrii masowej Skolteha wraz z biologów centrum neurobiologii i neuroilności Scotech.

Źródło: Naked Science

Czytaj więcej