Неміс ғалымдары 3D модельдеу арқылы SARS-COV-2 вирусының құрылымын зерттейді. Коронавирустың молекулалық декодтауы патоген ингредиенттерімен күресуге белсенді болуға көмектеседі.
Вюрцбург Андреа тікеннен келген құрылымдық биолог пандемия басталғаннан бастап SARS-COV-2 ақуыз компоненттерін анықтауға тырысады. Бұл әлемдегі вакциналар мен есірткіні жасаушылар үшін қорғау құралдарын табу үшін қажет, деп жазады Берлинер Цейтунг. Жарияланыммен сұхбатта маман Коронавирус молекулаларының құрылымы мен олардың модельдерінің болуы арқасында вирустың қалай жұмыс істейтінін білуге болады деп мәлімдеді. Мысалы, егер ол адам жасушасын ұстап, оны көбірек вирустар шығарса, онда әр қадам ақуыз молекуласынан жасалған. Сондықтан, осы ақуыз молекулаларының ажыратылуы инфекцияны тоқтатуды білдіреді.
SARS-COV-2 не көрінеді?
Коронавирус өте дөңгелек емес. Бұл тұрақты қозғалыста сабын көпіршіге ұқсайды. Сыртқы қабат жұқа жұмсақ және сабынға ұқсас май қышқылдарынан тұрады. Осылайша, сабын вирус қабығын толығымен ерітеді - қолдар жеткілікті ұзақ жуады. Сыртқы қабат вирусқа өкпенің жасушаларына енуіне мүмкіндік беретін шыбықтармен жабылған. Бірақ көптеген вирустар қоңырау шалу, бұл тек «көлік түрі» вирирование. Оның ішінде 28 ақуыз молекулалары үшін генетикалық материал бар. Олардың көпшілігі алдымен хост ұяшығына вирустар өндіруге арналған объектіні айналдыру үшін жасалынған.Көбісі вирустар көрінбейді деп сенеді. Олар бұқаралық ақпарат құралдарында көрсетілген түсті суреттер вирус бейнелері екенін де түсінбеуі мүмкін. Вирус және оның қауіпі көрінбейді. «Адамдар көптеген өлгендерді көрмейді.
Қауіп тудыратын «биолог» атап өтілді.
Молекулалық құрылымдарды қалай құруға болады
Сарапшылар бүкіл вирусты емес, тек оның жеке молекулаларын өлшейді. Құрылымдық биологтардың мақсаты - SARS-COV-2 компоненттерінің 28 түрлі белоктарының біреуін іздеу. Тағы бір тапсырма - жұмыртқаның ақуызын кристалдандыру. Кристаллдар - бұл миллиметрдің оннан бір бөлігі және ақуыз молекулаларынан тұрады. Содан кейін бұл кристалл Берлиндегі BESSY II ретінде бөлшектердің синглдік үдеткішіндегі X-Rays көмегімен өлшенеді. Бұл мәліметтер сонымен қатар, кристалдың молекуласының үш өлшемді моделін құруға мүмкіндік береді.
Зерттеу аясында алынған өлшеулер негізінде құрылған модельдер тексеріліп, жетілдірілген. Андреа тікен командасының мүшелеріне 3D мониторында бейнеленген әр атом. Бактериялардың көбеюі 1-ден 36 айға дейін, ол жұмыс істемейінше тазалайды. Жұмыртқа ақуызы 1 айдан 24 айға дейін кристалданады. Синхротрондағы өлшеу шамамен үш минутты алады. Арнайы пункттердің көмегімен конструкцияларды жинау және құрастыру, келесі аптадан төрт айға дейін, сарапшы түсіндірді.
Бүгінгі таңда ғалымдар 28 вирус молекулаларының 17-ін құрады. Егер құрылымдар соншалықты көп болмаса - анықтама бірнеше апта немесе ай қажет, бірақ бұл құрылымдарды компьютерде оңай модельдеуге болады. Содан бері молекуладағы мыңдаған адамдар ғана өзгереді. Пандемиядан кейін оқу саны айтарлықтай төмендеді және олар енді қаржыландырылмайды. Құрылымдық биолог сенеді: егер SARS-COV-2 зерттеу жүргізілсе, үнемі ғалымдар Коронавир туралы көбірек білетін болады. Бұл үлкен артықшылық болар еді және келесі пандемияға жақсы дайындалуға мүмкіндік берді.