Znanstvenici iz Skolkovsk Instituta za znanost i tehnologiju, Institut za probleme informacija Harkevichovih informacija pod Ruskom akademijom znanosti, prvo državno medicinsko sveučilište nazvano po Pavlovu i SmorodintSEV Institut objavio je preispršivač rada na virološkom portalu , u kojem su ispričali o 47-godišnjem pacijentu s Covidom devetnaest. Činjenica je da je u njezinu slučaju, Coronavirus je stekao 18 mutacija, a bila je bolesna više od četiri mjeseca.
Krajem ožujka prošle godine, žena s B-Cell Nehodgkinsky limfoma četvrta pozornica je hospitalizirana za prolaz planirane kemoterapije rituksimab (antitumorsko sredstvo iz skupine monoklonskih antitijela). Ležala je u istoj komori s starijim bolesnikom, koji je ubrzo otkrio Covid-19.
Dana 17. travnja, 47-godišnja žena bila je otpuštena iz bolnice, ali je manje od dva tjedna dijagnosticirala koronavirusnu bolest. "Do tog vremena činilo se simptomima COVID-19 (povišena tjelesna temperatura). Ovaj izvorni uzorak je odbačen odmah nakon testiranja i nije bio dostupan za sekvenciranje. Ponovljeni nasoplarni udarci od 14. svibnja, 19. lipnja, 9. lipnja i 14. srpnja, dali su negativan rezultat na SARS-Cov-2. Ipak, pacijent od 25. svibnja do 21. kolovoza, opaženi su simptomi teških COVID-19. Rezultati njegovog testiranja bili su ponovno pozitivni 3, 5, 8, 11, 13, 17, 20, 21, 26, 27. kolovoza, kao i 3. rujna i 9. Konačno, rezultat je bio negativan 12. rujna, a zatim ponovno 10. studenog do 16. prosinca ", pišu autori studije.
Znanstvenici su sekvencirali genom uzorka virusa dobiveni 20. kolovoza od nazofarinksa. Za usporedbu, oni su također sekvencirani ženski razmaz uzorak (pacijent a), od kojih je 47-godišnji pacijent (a) vjerojatno i zaražen. Kao rezultat toga, ispostavilo se da je iz referenci, Wuhan soj SARS-Cov-2, uzorak Rusa razlikuje 25 genetskih promjena. "Od tih, sedam varijacija polimorfizama s jednim nukleotidnim, uključujući tri u susjednim položajima 21881-21883, smještene su u uzorak pacijenta u liniji B.1.1. Genomi nosi preostalih 18 genetskih promjena. Uzorak prvog starijeg pacijenta i smješten je u osnovnu liniju B.1.1, potvrđujući da su 18 mutacija specifične za pacijenta S ", objasnili su stručnjaci.
Dakle, autori izvješća, sekvencirano genom koronavirusom od pacijenta s limfom, karakterizira neovisna stjecanja 18 novih mutacija akumuliranih od 10. do 20. kolovoza: to odgovara brzini od 1.67E-3. Nukleotid godišnje, to jest, značajno prelazi prosječnu brzinu evolucije značajno SARS-COV-2. Uključujući mutacije S-protein Y453F i Δ69-70HV ("kombinacija Δf"), koji su otkriveni kontaminiranom koronavirusom za onečišćenju.
"Obje mutacije se nalaze kod pacijenta s međufaznim frekvencijom: to je slučaj polimorfizma unutar domaćina. Budući da je filogenetska analiza pokazala da pacijentov pedigre nije povezan s kursom za mink, ponovno formirane mutacije. Neovisno stjecanje identičnih para promjena u minki i pacijenta s limfomom, kao i između nekoliko bolesnika s depresivnim imunitetom, uključuje dogovorene promjene u odabiru. Pacijent je dao jedini uzorak za danas s kombinacijom Y453F i s mutacija: Δ69-70HV izvan klastera 5, to jest, stečeno neovisno o minki ", dodali su.
Osim toga, pacijent je otkrio još dvije mutacije, koje su se ranije pronađene u drugim bolesnicima s COVID-19 s oslabljenim imunitetom, uključujući N501Y. Ova promjena je prisutna u takozvanom britanskom soju Coronavirusa i južnoafričke verzije.
"Budući da se sve te mutacije kupuju s konferdinentno (to jest, slično genotipu. - cca. Ed.), Stoga doprinosi pritisku odabira, koji je zajednički pacijentima s oslabljenim imunitetom i, eventualno za mink, ali se razlikuje od toga u populaciji. Ipak, opcije identificirane u bolesnika s oslabljenim imunitetom (iu minki) mogu se kasnije proširiti na zajedničku populaciju, utječući na karakteristike cirkulirajućih sojeva ", autori studije sažele su se.
Šef znanstvene grupe Gregory Baykin, profesor Skolkovskog instituta za znanost i tehnologiju, istaknuo je u komentaru za ruske medije, kao što je opisano u slučaju izvješća - jedan. "Za opću epidemiološku situaciju, ne predstavlja mnogo važnosti. Nadamo se da je ovaj virus koji je nastao u tijelu ovog pacijenta, nije išao nigdje. Umjesto toga, to su pokušaji da se shvate kako se taj virus razvija i što prirodna selekcija djeluje na njemu ", naglasio je.
Izvor: Gola znanost