Sastavio je najpopularniji katalog virusa koji nastanjuju u ljudskom crijevu

Anonim
Sastavio je najpopularniji katalog virusa koji nastanjuju u ljudskom crijevu 2040_1
Sastavio je najpopularniji katalog virusa koji nastanjuju u ljudskom crijevu

Virusi su najbrojniji biološki objekti na našoj planeti. A broj bakteriofaga, također poznat kao faga - virusi, infrabring bakterijske stanice i arheys, prema procjenama znanstvenika, je 1031 čestica. Oni snažno utječu na mikrobne zajednice, djelujući kao horizontalni vektori za prijenos gena koji kodiraju pomoćne funkcije, korisne za vrste bakterijskih hostova.

Već desetljećima istraživači su pretrpjeli fage ne tako brzo kao što su htjeli, međutim, zbog nastanka metagenomila visokih performansi, postalo je moguće otkriti bez presedana broj novih fagova. Stoga je neočekivano otkriće bilo da se većina sekvenci faga ne može pripisati nikakvoj poznatoj virusnoj taksonomiji koju je utvrdio Međunarodni odbor za taksonomiju virusa (ICTV).

Poznato je da fagi utječu na različite ekosustave, a s obzirom na važnost kompozicije i funkcije crijevnog mikrobioma za ljudsko zdravlje, povećanje pozornosti počela je posvetiti fazi koji nastanjuju ovo tijelo. Neravnoteža u agregatu bakterija dovodi do razvoja mnogih bolesti i složenih stanja, kao što su alergije i pretilost. Međutim, do sada smo relativno malo znali o ulozi koju crijevne bakterije i bakteriofasi igraju u zdravlju i ljudskim bolestima.

Znanstvenici iz laboratorija interakcije između domaćina i Microbiota na Institutu za Senger i Europski institut za bioinformatiku (Ujedinjeno Kraljevstvo), primjenom metode sekvenciranja DNA napravili su katalog biološke raznolikosti virusnih vrsta otkrivenih u 28.060 setovima ljudskih crijevnih genoma prikupljenih u 28 različitih zemalja u šest kontinenata (Afrika, Azija, Europa, Sjeverna Amerika, Južna Amerika i Oceanija) i 2898 genoma bakterijskih izolata, koje su podignute iz tog trbuha. Rezultati njihovog rada prikazani su u staničnom magazinu.

Znanstvenici su otkrili 142.809 genoma u faganima koji žive u crijevu osobe, od kojih je više od polovice koje su ikada prije sreli. Pokazalo se da je virusna raznolikost najviša među takvom vrstom bakterija kao tvrtki. U isto vrijeme, oko 36% virusnih klastera nije bilo ograničeno na jedan tip, stvarajući mrežne tokove gena između filogenetski različitih vrsta bakterija.

Sastavio je najpopularniji katalog virusa koji nastanjuju u ljudskom crijevu 2040_2
Bakteriofag i njezina struktura / © getty slike

Među desecima tisuća virusa, znanstvenici su identificirali novi rasprostranjeni skup fagova s ​​karakteristikama nalik na crashphage bakteriofage, otkrivene u 2014. u otpadnim vodama mnogih zemalja. Ova skupina inficira gram-negativne anaerobne bakterije bakterija bakterija bakteretoidacee je nazvana Gubafag. I, prema stručnjacima, ona i cranfhage - zajednički predak.

"Također smo promatrali jasno razdvajanje pedagoga stanovnika Sjeverne Amerike, Europe i Azije i uzoraka iz Afrike i Južne Amerike. Zanimljivo je da fagioma uzorci (skup sekvenci svih genoma fage u uzorku. - Ref. Ed.) Korelira s važnim razlikama u načinu života osobe. I fage koji se nalaze u urbanim uzorcima namijenjeni su baktereidima, ali ne i na bakterije obitelji Prevotellacea, dok je u ruralnim uzorcima iz Perua, Tanzania, Madagaskar i Fidži sadržavao s nizom vlasnika usmjeren na provitellaceae umjesto baktereidesa, "znanstvenici rekao je.

Prema njima, rezultirajući visokokvalitetni katalog genoma iz genoma u genomima će poboljšati buduće studije virusa - virus komponente crijevnog mikrobioma - i omogućit će ekološku i evolucijsku analizu ljudskih crijevnih bakteriofaga.

"Mora se pamtiti da nisu svi virusi štetni: oni su integralna komponenta crijevnog ekosustava. Većina virusa koje smo otkrili imaju DNK kao genetskog materijala, odnosno se razlikuju od poznatih patogena, kao što je Coronavirus SARS-COV-2 ili Žika virus, koji su RNA virusi. Drugo, naši uzorci su uglavnom dobiveni od zdravih ljudi koji nemaju nikakve specifične bolesti ", rekao je dr. Alexander Almeida, jedan od autora studije.

Izvor: Gola znanost

Čitaj više