Stvorio je metodu za vizualizaciju masenog spektrometrijskog slike, prilagođena ljudskom vizijom

Anonim
Stvorio je metodu za vizualizaciju masenog spektrometrijskog slike, prilagođena ljudskom vizijom 14929_1
Stvorio je metodu za vizualizaciju masenog spektrometrijskog slike, prilagođena ljudskom vizijom

Rezultati istraživanja objavljuju se u časopisu Analitička kemija. Masena spektrometrija visoke rezolucije je metoda analize tvari na temelju točnog mjerenja masenog omjera za punjenje (m / z) ioniziranih molekula i intenziteta odgovarajućeg signala od njih (njihova relativna količina). Ove informacije vam omogućuje da odredite molekularnu težinu spojeva, njihovu strukturu, koja pomaže identificirati spojeve, kao što su proteini, lipidi, metaboliti, peptidi, komponente lijekova i drugih tvari.

Masena spektrometrijska imizija (MCI) omogućuje vam da dobijete informacije o prostornoj raspodjeli molekula u tkivima, provodeći maseni spektrometrijsku analizu iona na lokalnoj laserskoj ionizaciji molekula na svakoj točki uzorka u proučavanju (na primjer, tumorski rez).

Tumačenje MSI podataka je težak zadatak. U početku, potrebno je vizualizirati raspodjelu iona na površini tkiva izlazne površine, tj. Konstruirati normalnu sliku u boji, u kojoj svaki prostor koji ima sličan ionski sastav - odgovara njegovoj boji. Od tisuća iona u svakoj točki morate ići na samo tri numeričke vrijednosti koje bi trebale poštivati ​​MSI podatke kao potpuno i koji se mogu povezati s trodimenzionalnim prostorom boja za svoju naknadnu analizu od strane istraživača.

Stvorio je metodu za vizualizaciju masenog spektrometrijskog slike, prilagođena ljudskom vizijom 14929_2
Opis metode / © Skoltech Press Service

"Važno je maksimizirati informacijski sadržaj rezultirajuće slike, potrebno je uzeti u obzir značajke ljudske vizije, osobito, njezinu nelinearnost i kvalitativno različitu osjetljivost na promjene u svjetlini i kromu.

I, iako je teorija percepcije boje ispitana već duže vrijeme (od prve polovice 20. stoljeća), čak i među stručnjacima nema općeprihvaćenih matematičkih modela, prilično dobro opisuje sva poznatih svojstava ljudske vizije "," Prvi autor studije, diplomski student Skoltech Anastasia Sarychev kaže.

Istraživači iz središta znanstvenih i inženjerske računalne tehnologije za zadatke s velikim polja podataka (CDISE) i laboratorij za vizualne SPI RAS ponudili su novi pristup vizualizaciji MSI podataka, a ne inferiornije od prethodno poznatih metoda u smislu detalja, ali na isto vrijeme na temelju teorije percepcije ljudske boje.

Nova metoda zadržava granice i gradijente prilikom primjene odabranih područja sličnog ionskog pripravka. Na temelju toga, rezultirajuća slika se interpretira lakše nego u drugim pristupima snimanjem MSI podataka. Metoda je testirana i na modelu i eksperimentalnim podacima dobivenim istraživačima laboratorija masene spektrometrije Skolteha zajedno s biolozima središta neurobiologije i neurobilnosti Scothech.

Izvor: Gola znanost

Čitaj više