کامل ترین کاتالوگ ویروس های ساکن روده انسان را کامپایل کرده است

Anonim
کامل ترین کاتالوگ ویروس های ساکن روده انسان را کامپایل کرده است 2040_1
کامل ترین کاتالوگ ویروس های ساکن روده انسان را کامپایل کرده است

ویروس ها متعدد ترین اشیاء بیولوژیکی در سیاره ما هستند. و تعداد باکتریوفاوه ها، همچنین به عنوان فاژ ها شناخته می شود - ویروس ها، آلوده شدن سلول های باکتریایی و آرشینها، طبق برآوردهای دانشمندان، 1031 ذرات است. آنها به شدت بر جوامع میکروبی تأثیر می گذارند، که به عنوان انتقال ژن های انتقال ژن افقی که توابع کمکی را رمزگذاری می کنند، مفید است، برای انواع باکتری ها مفید است.

برای چندین دهه، محققان به دلیل ظهور متاگنومیل با کارایی بالا، به همان اندازه که آنها می خواستند، دچار فالوها شده اند، اما ممکن است تعداد بی سابقه ای از فاژ های جدید را تشخیص دهند. بنابراین، کشف غیر منتظره این بود که اکثریت توالی های فاژ را نمی توان به هر طبقه بندی شناخته شده ویروسی که توسط کمیته بین المللی طبقه بندی ویروس (ICTV) تعیین شده بود، نسبت داد.

شناخته شده است که فاژ ها بر روی اکوسیستم های مختلف تاثیر می گذارد و با توجه به اهمیت ترکیب و عملکرد میکروبیوم روده ای برای سلامت انسان، افزایش توجه به فاضلاب ساکن این بدن آغاز شد. عدم تعادل در مجموع باکتری ها منجر به توسعه بسیاری از بیماری ها و حالت های پیچیده مانند آلرژی و چاقی می شود. با این حال، تا به امروز، ما نسبتا کم در مورد نقش که باکتری روده و باکتریوفاژها در بیماری های بهداشتی و بیماری های انسانی بازی می کردند، می دانستیم.

دانشمندان از آزمایشگاه تعامل بین میزبان و میکروبیوتا در موسسه سنگر و موسسه اروپایی بیوانفورماتیک (بریتانیا)، با استفاده از روش توالی DNA، یک کاتالوگ تنوع زیستی گونه های ویروسی کشف شده در 28،060 مجموعه از ژنوم های روده ای انسان را جمع آوری کرد 28 کشور مختلف در شش قاره (آفریقا، آسیا، اروپا، آمریکای شمالی، آمریکای جنوبی و اقیانوسیه) و 2898 ژنوم جدایه های باکتریایی، که از این عضو شکم مطرح شده است. نتایج کار آنها در مجله سلولی ارائه شده است.

دانشمندان 142،809 ژنوم فاژها را که در روده یک فرد زندگی می کنند، کشف کرده اند، بیش از نیمی از آنها تا به حال قبل از آن ملاقات کرده اند. تنوع ویروسی در میان چنین نوعی از باکتری ها به عنوان شرکت ها بالاتر بود. در عین حال، حدود 36 درصد از خوشه های ویروسی به یک نوع محدود نمی شدند و جریان های شبکه ای از ژن های بین انواع مختلف باکتری ها را ایجاد می کردند.

کامل ترین کاتالوگ ویروس های ساکن روده انسان را کامپایل کرده است 2040_2
باکتریوفاژ و ساختار آن / گتی ایماژ

در میان ده ها هزار ویروس، دانشمندان مجموعه جدیدی از فاژ ها را با ویژگی های شبیه به باکتریوفاژ های Crassphage شناسایی کرده اند که در سال 2014 در فاضلاب بسیاری از کشورها کشف شده است. این گروه آلوده به باکتری های باکتری های بی هوازی گرم منفی از خانواده bacteroidaceae Gubafag نامیده می شود. و، به گفته کارشناسان، او و Crassphage - یک اجداد مشترک است.

"ما همچنین یک جدایی واضح بین فضولات ساکنان آمریکای شمالی، اروپا و آسیا و نمونه های آفریقا و آمریکای جنوبی را مشاهده کردیم. جالب توجه است، الگوهای Fagioma (مجموعه ای از توالی های تمام ژنیوم های فاژ در نمونه. - Ref. ed.) با تفاوت های مهم در شیوه زندگی یک فرد ارتباط دارد. و فاژ های موجود در نمونه های شهری، باکتری ها، اما نه بر روی باکتری های خانواده prevotellacea، در حالی که در نمونه های روستایی از پرو، تانزانیا، ماداگاسکار و فیجی حاوی فاژ ها با طیف وسیعی از صاحبان، به جای bacteroides، "دانشمندان" گفت.

به گفته آنها، کاتالوگ در مقیاس بزرگ با کیفیت بالا از ژنوم های فاضلاب، مطالعات آینده ویروس را بهبود می بخشد - مولکول ویروس میکروبیوم روده ای - و امکان تجزیه و تحلیل زیست محیطی و تکاملی باکتریوفاژ های روده انسان را فراهم می کند.

"باید به یاد داشته باشید که همه ویروس ها مضر نیستند: آنها جزء جدایی ناپذیر از اکوسیستم روده هستند. اکثر ویروس هایی که ما نشان دادیم DNA را به عنوان یک ماده ژنتیکی داریم، یعنی، از پاتوژن های شناخته شده مانند Coronavirus SARS-COV-2 یا ویروس زیکا، که ویروس های RNA هستند متفاوت است. در مرحله دوم، نمونه های ما به طور عمده از افراد سالم که بیماری های خاصی ندارند، به دست آمد. "دکتر الکساندر المیدا، یکی از نویسندگان این مطالعه.

منبع: علوم برهنه

ادامه مطلب