Kompilis la plej kompletan katalogon de virusoj loĝantaj la homan inteston

Anonim
Kompilis la plej kompletan katalogon de virusoj loĝantaj la homan inteston 2040_1
Kompilis la plej kompletan katalogon de virusoj loĝantaj la homan inteston

Virusoj estas la plej multaj multnombraj biologiaj objektoj en nia planedo. Kaj la nombro de bacteriófagos, ankaŭ konata kiel fagoj - virusoj, infektante bakteriajn ĉelojn kaj arkeojn, laŭ la taksoj de sciencistoj, estas 1031 partikloj. Ili forte influas la mikrobajn komunumojn, agante kiel horizontala gena translokiga vektoroj kodas helpajn funkciojn, utilajn por specoj de bakterioj.

Dum jardekoj, esploristoj suferis fagojn ne tiel rapide, ĉar ili tamen volis, pro la apero de alta rendimento Metagentile, ĝi eblis detekti senprecedencan nombron de novaj fagoj. Tiel, la neatendita malkovro estis, ke la plimulto de fago-sekvencoj ne povus esti atribuitaj al iu konata viral-taksonomio establita de la Internacia Komitato pri Virusa Taksonomio (ICTV).

Oni scias, ke fagoj influas diversajn ekosistemojn, kaj donis la gravecon de la kunmetaĵo kaj funkcioj de la intesta mikrobiomo por homa sano, pliigante la atenton komencis dediĉi al la fagoj loĝantaj ĉi tiun korpon. La malekvilibro en la aldonita bakterio kondukas al la disvolviĝo de multaj malsanoj kaj kompleksaj ŝtatoj, kiel alergioj kaj obezeco. Tamen, ĝis nun, ni sciis relative malmulte pri la rolo, ke intestaj bakterioj kaj bakteriofagoj ludas en sano kaj homaj malsanoj.

Sciencistoj de la laboratorio de interago inter la gastiganto kaj mikrobiota ĉe la Instituto de Senger kaj la Eŭropa Instituto de Bioinformatikoj (Unuiĝinta Reĝlando), aplikante la metodon de sekvencado de DNA faris katalogon de biodiverseco de viralaj specioj malkovritaj en 28,060 aroj de homaj intestaj genaroj kolektitaj en 28 malsamaj landoj en ses kontinentoj (Afriko, Azio, Eŭropo, Nordameriko, Sudameriko kaj Oceanio), kaj 2898 genaroj de bakteriaj izolatoj, kiuj kreskigis de ĉi tiu abdomena organo. La rezultoj de ilia laboro estas prezentitaj en ĉela revuo.

Sciencistoj malkovris 142,809 genarojn de la fagoj, kiuj vivas en la intesto de persono, pli ol duono el kiuj iam antaŭe renkontis. Virusa diverseco montriĝis la plej alta inter tia speco de bakterioj kiel firmaoj. Samtempe, ĉirkaŭ 36% de viraj amasoj ne limiĝis al unu tipo, kreante retajn rojojn de genoj inter fitologenetike malsamaj specoj de bakterioj.

Kompilis la plej kompletan katalogon de virusoj loĝantaj la homan inteston 2040_2
Bacteriófago kaj ĝia strukturo / © Getty-bildoj

Inter dekoj da miloj da virusoj, sciencistoj identigis novan disvastigatan aron de fagoj kun trajtoj similaj al Crassphage Bacteriófaga, malkovrita en 2014 en la kloako de multaj landoj. Ĉi tiu grupo infektas Gram-negativan anaerobian bakteriojn de la bakterioj Batteroidaceae nomiĝis Gubafag. Kaj, laŭ spertuloj, ŝi kaj Crassphage - komuna praulo.

"Ni ankaŭ observis klaran apartigon inter la fagoj de la loĝantoj de Nordameriko, Eŭropo kaj Azio kaj specimenoj el Afriko kaj Sudameriko. Kurioze, fagioma ŝablonoj (aro de sekvencoj de ĉiuj fagoj genomoj en la specimeno. - Ref. Ed.) Korelaciita kun gravaj diferencoj en la vivstilo de persono. Kaj la fagoj trovitaj en urbaj specimenoj estis celitaj al bakterioidoj, sed ne sur la bakterioj de la prevotellacea familio, dum en kamparaj specimenoj de Peruo, Tanzanio, Madagaskaro kaj Fiĝioj enhavis fagojn kun gamo da posedantoj celantaj prevotellaceae anstataŭ bacteroides, "sciencistoj". diris.

Laŭ ili, la rezultanta altkvalita grandskala katalogo de genomomoj de fagoj plibonigos estontajn studojn de viruso - la viruso-komponanto de la intesta mikrobiomo - kaj ebligos ekologian kaj evoluan analizon de homaj intestaj bakteriofagoj.

"Devas esti memorita, ke ne ĉiuj virusoj estas malutilaj: ili estas integra komponanto de la intesta ekosistemo. Plej multaj el la virusoj, kiujn ni malkaŝis, havas DNA kiel genetika materialo, tio estas, diferencas de la bonkonataj patogenoj, kiel Coronavirus Sars-COV-2 aŭ la Zika-viruso, kiuj estas ARN-virusoj. Due, niaj specimenoj estis akiritaj ĉefe de sanaj homoj, kiuj ne havas specifajn malsanojn, "diris doktoro Alexander Almeida, unu el la aŭtoroj de la studo.

Fonto: Nuda Scienco

Legu pli