Virus er de mest talrige biologiske objekter på vores planet. Og antallet af bakteriofager, også kendt som fager - vira, inficerer bakterieceller og arkæer, ifølge forskere estimater, er 1031 partikler. De påvirker kraftigt de mikrobielle samfund, der virker som vandrette genoverføringsvektorer, der koder for hjælpefunktioner, nyttige til typer af bakteriehoste.
I årtier har forskere lidt fager ikke så hurtigt som de ønskede på grund af fremkomsten af en højtydende metagenomyle, blev det muligt at opdage et hidtil uset antal nye fager. Den uventede opdagelse var således, at flertallet af fagsekvenser ikke kunne henføres til enhver kendt viral taxonomi, der blev oprettet af Den Internationale Udvalg om Virus Taxonomi (ICTV).
Det er kendt, at fager påvirker forskellige økosystemer, og i betragtning af vigtigheden af sammensætningen og funktionerne i tarmmikrobioma til menneskers sundhed, begyndte at øge opmærksomheden at bruge til de fager, der beboede denne krop. Ubalancen i aggregatet af bakterier fører til udvikling af mange sygdomme og komplekse stater, såsom allergier og fedme. Men indtil nu kendte vi relativt lidt om den rolle, som tarmbakterier og bakterioplysninger spiller i sundhedsmæssige og menneskelige sygdomme.
Forskere fra laboratoriet for interaktion mellem værten og Microbiota på Institut for Senger og Det Europæiske Institut for Bioinformatik (Det Forenede Kongerige), der anvender DNA-sekventeringsmetoden, lavede et katalog af biodiversitet af virale arter, der blev opdaget i 28.060 sæt humane intestinale genomer indsamlet i 28 forskellige lande på seks kontinenter (Afrika, Asien, Europa, Nordamerika, Sydamerika og Oceanien) og 2898 genomer af bakterielle isolater, som rejst fra dette abdominalorgan. Resultaterne af deres arbejde er præsenteret i cellemagasinet.
Forskere har opdaget 142.809 genomer af de fager, der bor i tarmene af en person, mere end halvdelen af hvem nogensinde har mødt før. Viral mangfoldighed viste sig at være den højeste blandt en sådan type bakterier som virksomheder. Samtidig var ca. 36% af virale klynger ikke begrænset til en type, hvilket skabte netværksstrømme af gener mellem fylogenetisk forskellige typer bakterier.
Blandt titusindvis af vira har forskere identificeret et nyt udbredt sæt fager med egenskaber, der lignede crassphage-bakteriofag, opdaget i 2014 i mange landes spildevand. Denne gruppe inficerer Gram-negative anaerobe bakterier bakterier af familien Bacteroidaceae blev kaldt GUBAFAG. Og ifølge eksperter, hun og crassphage - en fælles forfader.
"Vi observerede også en klar adskillelse mellem fagoms af indbyggerne i Nordamerika, Europa og Asien og prøver fra Afrika og Sydamerika. Interessant nok fagiom mønstre (et sæt sekvenser af alle faggenomer i prøven. - Ref. Ed.) Korreleret med vigtige forskelle i en persons livsstil. Og de fager, der blev fundet i byprøver, var rettet mod bakterier, men ikke på bakterierne i Prevotellacea-familien, mens i landdistrikterne prøver fra Peru, Tanzania, Madagaskar og Fiji indeholdt fager med en række ejere rettet mod Prevotellaceae i stedet for bakterier, "forskere fortalte.
Ifølge dem vil den resulterende højkvalitets store katalog af fag af fager forbedre fremtidige undersøgelser af virus - viruskomponenten i tarmmikrobioma - og vil gøre det muligt at økologisk og evolutionær analyse af humane intestinale bakteriofager.
"Det skal huskes, at ikke alle vira er skadelige: de er en integreret del af tarmøkosystemet. De fleste af de vira, vi afslørede, har DNA som et genetisk materiale, det vil sige, adskiller sig fra de velkendte patogener, såsom Coronavirus Sars-Cov-2 eller Zika-viruset, som er RNA-vira. For det andet blev vores prøver opnået hovedsageligt fra raske mennesker, der ikke har nogen specifikke sygdomme, "sagde Dr. Alexander Almeida, en af forfatterne af undersøgelsen.
Kilde: Naked Science