Oprettet en metode til visualisering af massespektrometrisk billede, tilpasset under menneskelig vision

Anonim
Oprettet en metode til visualisering af massespektrometrisk billede, tilpasset under menneskelig vision 14929_1
Oprettet en metode til visualisering af massespektrometrisk billede, tilpasset under menneskelig vision

Resultaterne af undersøgelsen offentliggøres i tidsskriftet Analytisk Kemi. Massespektrometri med høj opløsning er en stofanalysemetode baseret på nøjagtig måling af massforholdet til opladning (m / z) ioniserede molekyler og intensiteten af ​​det tilsvarende signal fra dem (deres relative mængde). Disse oplysninger gør det muligt at bestemme molekylvægten af ​​forbindelserne, deres struktur, som hjælper med at identificere forbindelser, såsom proteiner, lipider, metabolitter, peptider, komponenter af lægemidler og andre stoffer.

Massespektrometrisk Imijing (MCI) giver dig mulighed for at få oplysninger om den rumlige fordeling af molekyler i væv, der udfører massespektrometrisk analyse af ioner ved lokal laserionisering af molekyler ved hvert punkt af prøven under undersøgelse (for eksempel et tumorskæring).

Fortolkning af MSI-data er en vanskelig opgave. I starten er det nødvendigt at visualisere fordelingen af ​​ioner på overfladen af ​​vævsafskæringsoverfladen, det vil sige at konstruere et normalt farvebillede, hvor hvert område med en lignende ionkomposition - svarer til dets farve. Fra tusindvis af ioner på hvert punkt skal du gå til kun tre numeriske værdier, der skal respektere MSI-dataene så fuldt ud, og som kan korreleres med tredimensionelt farveplads til efterfølgende analyse af forskeren.

Oprettet en metode til visualisering af massespektrometrisk billede, tilpasset under menneskelig vision 14929_2
Beskrivelse af metoden / © SKOLTECH PRESS SERVICE

"Det er vigtigt at maksimere informationsindholdet i det resulterende billede, det er nødvendigt at tage hensyn til funktionerne i menneskelig vision, især dets ikke-linearitet og kvalitativt forskellige følsomhed over for ændringer i lysstyrke og chroma.

Og selvom teorien om farveopfattelse undersøges i lang tid (siden første halvdel af det 20. århundrede), selv blandt eksperterne, er der ingen generelt accepterede matematiske modeller, der ganske godt beskriver alle de velkendte egenskaber ved menneskelig vision , "Den første forfatter af undersøgelsen, graduate student SKOLTECH Anastasia Sarychev siger.

Forskere fra centrum for videnskabelige og tekniske computing teknologier til opgaver med store data arrays (CDISE) og laboratoriet for Visual Spi RA'er tilbød en ny tilgang til visualisering af MSI-data, ikke ringere end tidligere kendte metoder med hensyn til detaljer, men på samme tid baseret på teorien om menneskelig farveopfattelse.

Den nye metode bevarer grænser og gradienter, når de anvender udvalgte områder af lignende ionisk sammensætning. På grund af dette fortolkes det resulterende billede lettere end i andre tilgange til billeddannelsen af ​​MSI-data. Metoden er blevet testet både på model og eksperimentelle data opnået af forskere af laboratoriet for massespektrometri af Skolteha sammen med biologerne i centrum af neurobiologi og neuroabilitet af Scothech.

Kilde: Naked Science

Læs mere