Viry jsou nejvíce četnými biologickými objekty na naší planetě. A počet bakteriofágů, také známých jako fágy - viry, infikovat bakteriální buňky a archeys, podle odhadů vědců, je 1031 částic. Důrazně ovlivňují mikrobiální komunity, působící jako horizontální vektory přenosu genů kódujících pomocné funkce, které jsou užitečné pro typy bakterií-hostitele.
Po celá desetiletí, výzkumníci utrpěli fágy ne tak rychle, jak chtěli, vzhledem k vzniku vysoce výkonného metagenomyle, bylo možné zjistit bezprecedentní počet nových fágů. Neočekávaný objev byl tedy, že většina fágových sekvencí nemohla být přičítána žádnou známou virové taxonomii zřízené Mezinárodním výborem virové taxonomie (ICTV).
Je známo, že fágy ovlivňují různé ekosystémy a vzhledem k významu složení a funkcí střevního mikrobiomu pro lidské zdraví, rostoucí pozornost začala věnovat fágům obývajícím toto tělo. Nerovnováha v souhrnu bakterií vede k rozvoji mnoha nemocí a komplexních států, jako jsou alergie a obezita. Až do teď jsme však věděli, že poměrně málo o roli, kterou střevají bakteriální bakterie a bakteriofágy hrají ve zdravotnictví a lidských onemocnění.
Vědci z laboratoře interakce mezi hostitelem a mikrobiota na Ústavu Sengera a Evropského institutu bioinformatiky (Spojeného království), uplatňování metody sekvenování DNA provedla katalog biologické rozmanitosti virových druhů objevených v 28 060 sadách lidských střev genomů shromážděných v 28 Různé země v šesti kontinentech (Afrika, Asie, Evropa, Severní Amerika, Jižní Amerika a Oceánie) a 2898 genomů bakteriálních izolátů, které vzrostly z tohoto abdominálního orgánu. Výsledky jejich práce jsou prezentovány v buněčném časopise.
Vědci objevili 142 809 genomů fágů žijících ve střevě člověka, více než polovina z nich se někdy setkala. Virová rozmanitost se ukázala být nejvyšší mezi tak typem bakterií jako firem. Současně, asi 36% virových klastrů nebylo omezeno na jeden typ, vytváření síťových proudů genů mezi fylogeneticky odlišnými typy bakterií.
Mezi desítky tisíců virů vědci identifikovali novou rozšířenou soubor fágů s charakteristikami připomínajícím bakteriofáru Crasshage, objevený v roce 2014 v odpadních vodách mnoha zemí. Tato skupina infikující gram-negativní anaerobní bakterie bakterie rodiny baktereidaceae byla nazývána Gubafag. A podle odborníků, ona a crasshage - společného předka.
"Také jsme pozorovali jasné oddělení mezi fagomy obyvatel Severní Ameriky, Evropy a Asie a vzorků z Afriky a Jižní Ameriky. Zajímavé je, že vzory fagioma (soubor sekvencí všech fágových genomů ve vzorku. - ref. Ed.) Korelovaly s významnými rozdíly v životním stylu osoby. A fáby nalezené v městských vzorcích byly zaměřeny na bakteriidy, ale ne na bakteriích rodiny prevotelacea, zatímco ve venkovských vzorcích z Peru, Tanzanie, Madagaskar a Fidži obsahoval fágy s řadou vlastníků zaměřených na prevotelaceae namísto bakteriidů, "vědci řekl.
Podle nich bude výsledný vysoce kvalitní rozsáhlý katalog genomů fágů zlepší budoucí studie viru - virové složky střevního mikrobiomu - a umožní to ekologické a evoluční analýzy lidských střevních bakteriofýgů.
"Je třeba si pamatovat, že ne všechny viry jsou škodlivé: jsou integrální složkou střevního ekosystému. Většina virů, které jsme odhalili, mají DNA jako genetický materiál, to znamená, že se liší od dobře známých patogenů, jako je například Coronavirus SARS-Cov-2 nebo virus Zika, které jsou RNA viry. Za druhé, naše vzorky byly získány především ze zdravých lidí, kteří nemají žádné konkrétní nemoci, "řekl Dr. Alexander Almeida jeden z autorů studie.
Zdroj: Nahá věda