Немски учени изследват структурата на вируса на SARS-COV-2, използвайки 3D моделиране. Молекулярното декодиране на коронавирус ще помогне при намирането на активни за борба с патогенните съставки.
Структурният биолог от Вюрцбург Андреа трън от самото начало на пандемията се опитва да дешифрира отделните протеинови компоненти на SARS-COV-2. Това е необходимо за разработчиците на ваксини и наркотици по света, за да открият средствата за защита, пише Берлинър Zeitung. В интервю с публикуването, специалист каза, че благодарение на точно разбиране на структурата на молекулите на коронавирусите и присъствието на техните модели можете да разберете как работи вирусът. Например, ако улавя човешката клетка и го прави да произвежда повече вируси, след това всяка стъпка е направена от протеинова молекула. Следователно изключването на тези протеинови молекули означава спиране инфекция.
Как изглежда SARS-COV-2?
Коронавирусът не е доста кръгъл. Прилича на сапунен балон в постоянно движение. Външният слой е тънък мек и се състои от мастни киселини, които са химически подобни на сапун. По този начин сапунът може напълно да разтвори вирусната обвивка - при условие, че ръцете се измиват достатъчно дълго. Външният слой е покрит с така наречените шипове, които позволяват вируса да проникне например в белодробни клетки. Но фактът, че много обаждане на вируса е всъщност това е просто "вид транспорт". Вътре в него носи генетичен материал за 28 протеинови молекули. Повечето от които са вградени в клетката гостоприемник, за да го превръщат в обект за производство на вируси.Мнозина смятат, че вирусите не могат да бъдат видими. Те дори не осъзнават, че цветните изображения, показани в носителя, са вирусни изображения. Вирусът и неговата опасност не се виждат. "Хората не виждат много мъртви, не виждат напълно претоварени клонове за реанимация, защото има забрана за посещения. Също така е една от причините, поради които създадохме и отпечатахме
За да направите опасност по-осезаем ", отбеляза биологът.
Как да дешифрираме молекулярни структури
Експертите измерват не целия вирус, но само неговите индивидуални молекули. Целта на структурните биолози е да се търси един от 28-те различни протеини на компонентите на SARS-COV-2. Друга задача е да кристализирате яйчния протеин. Кристалите са размерът на десети от милиметъра и се състоят от хиляди идентични протеинови молекули. След това този кристал се измерва с помощта на рентгенови лъчи върху така наречения синхротрон ускорителя на частиците като Bessy II в Берлин. Тези данни също ни позволяват да изградим триизмерен модел на молекула, от която се прави кристалът.
Като част от проучването, моделите, създадени въз основа на получените измервания, се проверяват и подобряват. Членовете на екипа на Андреа Торн са последвани от всеки атом, изобразен на 3D монитор. Възпроизвеждането на бактерии може да отнеме от 1 до 36 месеца с почистване, докато не работи. Яйчният протеин кристали от 1 до 24 месеца. Измерването в синхротрон отнема около три минути. Събиране на данни и монтаж на структури с помощта на специални точки заемат от седмица до четири месеца, обяснено експерт.
Към днешна дата учените измерват 17 от 28 вирусни молекули. Докато структурите не са толкова много - определението отнема няколко седмици или месеци - но тези структури могат лесно да бъдат моделирани на компютъра. Тъй като само няколко хиляди в молекулата са променени. След пандемия броят на проучванията значително намалява и вече не се финансират. Структурният биолог смята: ако изследванията на SARS-COV-2 са били проведени постоянно учени ще имат повече знания за коронавирус. Това би било огромно предимство и да го позволи да се подготви по-добре за следващата пандемия.