Учените разказаха за руската жена, в която Коронавирус придоби 18 нови мутации

Anonim
Учените разказаха за руската жена, в която Коронавирус придоби 18 нови мутации 5749_1
Учените разказаха за руската жена, в която Коронавирус придоби 18 нови мутации

Учените от науката и технологиите на науката и технологиите на Сколковск, Института за проблемите на информацията за информацията на Харкевич в рамките на Руската академия на науките, първият държавен медицински университет, наречен на Павлов и Института Smorodintsev, публикуваха Preprint на работата по портала Virology.org , в което те казаха за около 47-годишен пациент с ковид деветнадесет. Факт е, че в нейния случай коронавирусът придобива 18 мутации и е била болна за повече от четири месеца.

В края на март миналата година една жена с B-клетъчна неходгонски лимфом четвърти етап е хоспитализирана за преминаването на планираната химиотерапия ритуксимаб (антитуморно средство от група моноклонални антитела). Тя лежеше в една и съща стая с пациент в напреднала възраст, който скоро разкри COVID-19.

На 17 април 47-годишната жена бе освободена от болницата, но по-малко от две седмици тя диагностицира коронавирусна болест. "По това време се появяват симптоми на COVID-19 (повишена телесна температура). Тази изходна проба се изхвърля веднага след тестването и не е на разположение за секвениране. Повтарящи се алкохолни удари от 14 май 19 юни и 14 юли, те дадоха отрицателен резултат върху SARS-COV-2. Въпреки това, пациентът от 25 май до 21 август, са наблюдавани симптомите на тежки COVID-19. Резултатите от нейното изпитване отново са положителни 3, 5, 8, 11, 13, 17, 20, 21, 26, 27 август, както и на 3 и 9 септември. И накрая, резултатът е отрицателен на 12 септември и след това отново на 10 ноември и на 16 декември ", авторите на изследването пишат.

Учените разказаха за руската жена, в която Коронавирус придоби 18 нови мутации 5749_2
Позицията на пробата на коронавируса 47-годишен пациент в ред Б.1.1. Филогенетовото дърво В.1.1, реконструирано за 49 083 последователности, се нарязва, за да съдържа произволен комплект от 1% от всички проби, включително проба от пациент S (червена точка). Пациентът А е черна точка. Линията на пациента S (червено) има 18 мутации, включително δ69-70HV и Y435F S-протеин, маркирани с два вътрешни кръгове жълто и синьо, съответно. Линия B.1.1.7 и клъстер 5 засенчени / © Баскин Г.А. Друг

Учените се подчиняват на генома на пробата на вируса, получена на 20 август от назофаринкса. За сравнение, те също се подреждат на женската скална извадка (пациент а), от която 47-годишен (ите) пациент (и) е предполагаем и заразен. В резултат на това той се оказа, че от референтния щам Wuhan щам SARS-COV-2, проба от руснаци разграничават 25 генетични промени. "От тях, седем варианта на еднокулетидни полиморфизми, включително три в съседни позиции 21881-21883, се поставят в пробата на пациента в ред В.1.1. Геномът носи останалите 18 генетични промени. Проба от първия пациент в напреднала възраст и е поставен в основната линия В.1.1, потвърждавайки, че 18 мутации са специфични за пациента - обясниха експертите.

Така авторите на доклада, секвенирани от коронавирусния геном от пациента с лимфома, се характеризират с независимо придобиване на 18 нови мутации, натрупани от 10 април до 20 август: това съответства на скоростта от 1.67E-3 промени в Нуклеотидът годишно, т.е. значително надвишава средната скорост на еволюцията, значително SARS-COV-2. Включително мутации на S-протеин Y453F и Δ69-70HV ("комбинация δf"), които са разкрити в замърсен норка коронавирус.

"И двете мутации се намират при пациент с междинна честота: това е случай на полиморфизъм вътре в хоста. Тъй като филогенетичният анализ показва, че родословието на пациента не е свързано с клъстер на норка, се образуват мутации. Независимото придобиване на идентичен двойка промени в норка и пациент с лимфом, както и между няколко пациенти с депресиран имунитет, включва съгласувани промени в избора. Пациентът е предоставил единствената извадка за днес с комбинация от Y453F и S мутации: Δ69-70HV извън клъстера 5, който е придобит независимо от норка, "добавиха те.

Учените разказаха за руската жена, в която Коронавирус придоби 18 нови мутации 5749_3
Шпиклотели в известни варианти на коронавирус и регистрирани случаи на така наречената продължителна COVID-19. Показващи мутациите на аминокиселинната последователност, кодирана от ген на шипове. Редове отгоре надолу: 501Y: Вариант V2; Версия VOC-202012/01 (британски щам); опционен клъстер 5; Пациент с отслабен имунитет, получавайки плазмена възстановена; Пациент с отслабен имунитет, приемащ смес от моноклонални антитела Регенерон; Пациент с отслабен имунитет, приемащ плазма за възстановяване; Пациент с отслабен имунитет, който не е получил лечение с плазма или антитела на възстановяване. Ярки цветове маркирани мутации се наблюдават най-малко в две проучвания / © Basykin G.A. Друг

В допълнение, пациентът разкри още две мутации, които преди това се срещат при други пациенти с COVID-19 с отслабен имунитет, включително N501Y. Тази промяна присъства в така наречения британски щам на коронавирус и южноафриканската версия.

"Тъй като всички тези мутации са закупени с съгласувано (това е, подобно на генотипа. - прибл. Ед.), Следователно, допринася за налягането на подбора, което е обичайно за пациентите с отслабен имунитет и, вероятно за норка, но се различава от това в населението. Въпреки това, опциите, идентифицирани при пациенти с отслабения имунитет (и в норка), могат по-късно да се разпространят в общото население, засягащи характеристиките на циркулиращите щамове, "авторите на изследването се обобщават.

Ръководителят на научната група Грегъри Байткин, професор по Института и технологии и технологии на Сколковски, отбелязан в коментар за руските медии, както е описано в делото на доклада - един. "За обща епидемиологична ситуация тя не представлява много значение. Надяваме се, че този вирус, който произхожда от тялото на този пациент, не отиде никъде. По-скоро те се опитват да разберат как се развива този вирус и какъв естествен подбор действа върху него ", подчерта той.

Източник: гола наука

Прочетете още