Вирусите са най-многобройните биологични обекти на нашата планета. И броят на бактериофагите, известен също като фаги - вируси, инфектиране на бактериални клетки и археини, според оценките на учените, е 1031 частици. Те силно засягат микробните общности, действащи като хоризонтални вектори на генно трансфер, кодиращи помощни функции, полезни за видовете бактерии-гостоприемници.
В продължение на десетилетия изследователите са претърпели фаги не толкова бързо, колкото искат, поради появата на високопроизводителна метагеномеле, стана възможно да се открие безпрецедентен брой нови фаги. По този начин неочакваното откритие е, че по-голямата част от фаговите последователности не могат да се приписват на известна вирусна таксономия, установена от Международния комитет по вирусната таксономия (ICTV).
Известно е, че фагите засягат различни екосистеми и като се има предвид важността на състава и функциите на чревната микробиома за човешкото здраве, нарастващото внимание започна да се отдалечава на фагите, обитаващи това тяло. Дисбалансът в агрегата на бактериите води до развитието на много болести и сложни държави, като алергии и затлъстяване. Въпреки това, досега знаехме относително малко за ролята, която чревните бактерии и бактериофаги играят в здраве и човешки заболявания.
Учените от лабораторията за взаимодействие между домакин и микробиота в Института на подстанцията и Европейския институт на биоинформатиката (Обединеното кралство), прилагане на метода на ДНК секвениране, направен е каталог на биоразнообразието на вирусните видове, открити в 28,060 комплекта човешки чревни геноми, събрани в 28 различни страни в шест континента (Африка, Азия, Европа, Северна Америка, Южна Америка и Океания) и 2898 генома на бактериални изолати, които са издигнати от този коремния орган. Резултатите от тяхната работа са представени в списание CELL.
Учените са открили 142 809 генома на фагите, живеещи в червата на човек, повече от половината от които някога са се срещали преди. Вирусното разнообразие се оказа най-високо сред такъв вид бактерии като фирми. В същото време около 36% от вирусните клъстери не са ограничени до един тип, създавайки мрежови потоци от гени между филогенетично различни видове бактерии.
Сред десетки хиляди вируси учените са идентифицирали нов широко разпространен набор от фаги с характеристики, наподобяващи бактериофагиране на Crassphage, открит през 2014 г. в отпадъчните води на много страни. Тази група заразявайки грам-отрицателните анаеробни бактериални бактерии на семейството на бактериоидите се наричаха Gubafag. И според експерти, тя и cracsphage - общ предшественик.
"Също така наблюдавахме ясно разделение между пехотата на жителите на Северна Америка, Европа и Азия и проби от Африка и Южна Америка. Интересно е, че моделите на фагиома (набор от последователности на всички фагови геноми в пробата. - Реф. Ед.) Свързани с важни различия в начина на живот на човека. И фаците, намерени в градските проби, бяха насочени към бактерии, но не и върху бактериите на семейството на Превотелацея, докато в селските проби от Перу, Танзания, Мадагаскар и Фиджи съдържаха фаги с редица собственици, насочени към Prevotellaceae вместо бактерии, "учените" казал.
Според тях, полученият висококачествен мащабен каталог на геномите на фаги ще подобри бъдещите проучвания на вируса - вирусния компонент на чревния микробиома - и ще позволи екологичен и еволюционен анализ на човешки чревни бактериофаги.
"Трябва да се помни, че не всички вируси са вредни: те са неразделна част от чревната екосистема. Повечето от вирусите, които разкрихме, имат ДНК като генетичен материал, т.е. се различават от известните патогени, като коронавирус SARS-COV-2 или вируса на Zika, които са РНК вируси. Второ, нашите проби бяха получени главно от здрави хора, които нямат никакви специфични заболявания ", каза д-р Александър Алмейда, един от авторите на проучването.
Източник: гола наука