Tổng hợp danh mục virus hoàn chỉnh nhất sinh sống ở ruột người

Anonim
Tổng hợp danh mục virus hoàn chỉnh nhất sinh sống ở ruột người 2040_1
Tổng hợp danh mục virus hoàn chỉnh nhất sinh sống ở ruột người

Virus là nhiều đối tượng sinh học nhiều nhất trên hành tinh của chúng ta. Và số lượng vi khuẩn, còn được gọi là phage - virus, lây nhiễm các tế bào vi khuẩn và cổ kính, theo ước tính của các nhà khoa học, là 1031 hạt. Chúng ảnh hưởng mạnh mẽ đến các cộng đồng vi sinh vật, hoạt động như các vectơ chuyển gen ngang mã hóa các chức năng phụ trợ, hữu ích cho các loại vi khuẩn máy chủ.

Trong nhiều thập kỷ, các nhà nghiên cứu đã phải chịu đựng các phage không nhanh như họ muốn, tuy nhiên, do sự xuất hiện của một metagenomyle hiệu suất cao, có thể phát hiện ra một số lượng mới chưa từng có. Do đó, khám phá bất ngờ là phần lớn các chuỗi phage không thể được quy cho bất kỳ phân loại virus đã biết nào được thành lập bởi Ủy ban quốc tế về phân loại virus (ICTV).

Được biết, các phage ảnh hưởng đến nhiều hệ sinh thái khác nhau, và có tầm quan trọng của thành phần và chức năng của vi khuẩn đường ruột đối với sức khỏe của con người, tăng sự chú ý bắt đầu dành cho các phage trong cơ thể này. Sự mất cân bằng trong tổng hợp vi khuẩn dẫn đến sự phát triển của nhiều bệnh và các quốc gia phức tạp, chẳng hạn như dị ứng và béo phì. Tuy nhiên, cho đến bây giờ, chúng ta biết tương đối ít về vai trò mà vi khuẩn và vi khuẩn gây bệnh trong bệnh về sức khỏe và bệnh tật.

Các nhà khoa học từ phòng thí nghiệm tương tác giữa máy chủ và Microbiota tại Viện Thượng Hải và Viện Th sinh sinh học Châu Âu (Vương quốc Anh), áp dụng phương pháp giải trình tự DNA khiến một danh mục đa dạng sinh học của các loài virus được phát hiện ở 28.060 bộ bộ gen ruột của con người được thu thập trong 28 quốc gia khác nhau trong sáu lục địa (Châu Phi, Châu Á, Châu Âu, Bắc Mỹ, Nam Mỹ và Châu Đại Dương), và 2898 gen của các chủng vi khuẩn, được nuôi dưỡng từ cơ quan bụng này. Kết quả công việc của họ được trình bày trong tạp chí CELL.

Các nhà khoa học đã phát hiện ra 142.809 bộ gen của các phage sống trong ruột của một người, hơn một nửa trong số họ đã từng gặp nhau trước đây. Sự đa dạng của virus hóa ra là cao nhất trong số một loại vi khuẩn như các công ty. Đồng thời, khoảng 36% cụm virus không giới hạn ở một loại, tạo ra các luồng mạng của các gen giữa các loại vi khuẩn khác nhau.

Tổng hợp danh mục virus hoàn chỉnh nhất sinh sống ở ruột người 2040_2
Vi khuẩn và cấu trúc của nó / © getty hình ảnh

Trong số hàng chục ngàn virus, các nhà khoa học đã xác định một bộ phage mới rộng rãi với các đặc điểm giống như vi khuẩn Crassphage, được phát hiện vào năm 2014 tại nước thải của nhiều quốc gia. Nhóm này lây nhiễm vi khuẩn vi khuẩn kỵ khí gram âm của gia đình Bacteroidaceae được gọi là Gubafag. Và, theo các chuyên gia, cô và crassphage - một tổ tiên chung.

Chúng tôi cũng quan sát thấy một sự tách biệt rõ ràng giữa các dân cư của cư dân Bắc Mỹ, Châu Âu và Châu Á và các mẫu từ Châu Phi và Nam Mỹ. Thật thú vị, các mẫu fagioma (một tập hợp các chuỗi của tất cả các bộ gen phage trong mẫu. - ed.) Tương quan với sự khác biệt quan trọng trong lối sống của một người. Và các phage được tìm thấy trong các mẫu đô thị đã nhắm đến các loại vi khuẩn, nhưng không phải là vi khuẩn của gia đình Prevotellacea, trong khi ở các mẫu nông thôn từ Peru, Tanzania, Madagascar và Fiji chứa các phage với một loạt các chủ sở hữu nhằm vào Prevotellaceae thay vì các nhà khoa học, các nhà khoa học kể lại.

Theo họ, kết quả là danh mục bộ gen quy mô lớn chất lượng cao của các phage sẽ cải thiện các nghiên cứu về virus trong tương lai - thành phần virus của vi khuẩn đường ruột - và sẽ giúp có thể phân tích sinh thái và tiến hóa của vi khuẩn đường ruột ở người.

"Cần phải nhớ rằng không phải tất cả các vi-rút đều có hại: chúng là một thành phần không thể thiếu của hệ sinh thái ruột. Hầu hết các vi-rút mà chúng ta đã tiết lộ có DNA như một vật liệu di truyền, đó là khác nhau so với các mầm bệnh nổi tiếng, chẳng hạn như Coronavirus SARS-COV-2 hoặc virus Zika, là vi-rút RNA. Thứ hai, các mẫu của chúng tôi được lấy chủ yếu từ những người khỏe mạnh không có bất kỳ bệnh cụ thể nào, Tiến sĩ Alexander Almeida, một trong những tác giả của nghiên cứu.

Nguồn: Khoa học khỏa thân

Đọc thêm