Сколетехта, ДНК төрү ысулларын анализлады

Anonim
Сколетехта, ДНК төрү ысулларын анализлады 10627_1
Сколетехта, ДНК төрү ысулларын анализлады

Мәкалә журнал табигать элемтәсендә бастырылган. Ике метрга якын DNA өч тапкыр кеше күзәнәгенең кечкенә ягыннан кеше күзәнгеч ядрәсе урнаштырылган, хроматин хроматин хроматин, хроматин, хроматин, хроматин, аны компактка, ләкин катлаулы структураларга керә. ДНКны төрү ысулларын өйрәнү өчен, бөтен дөнья буенча галим Хромосомалар (3С), һәм аларның иң продуктивының берсе Hi-C ысулы белән кулланыла. Бу сезгә югары җитештерүчән эзлеклелек ярдәмендә бөтен гено элемтәләрен ачыкларга мөмкинлек бирә.

Ләкин монда проблема бар: HI-C эше дистәләгән ДНКроромс - ягъни уникаль киңлек хроматин оешмасы белән миллионлаган күзәнәкләр. Бу мәгълүмат уртача рәсем алу өчен, аерым рәсем алу өчен, шәхси күзәнәкләрдә ДНК пакетларының үзенчәлекләрен исәпкә алмаганда.

"Урта кеше" чынбарлык булмаган кебек, традицион Hi-C ысулы күрсәтелә алмыйча, ДНК бүлекләре бер үк шакмакта бер үк күзәнәктә була. Моннан тыш, бу "коллектив портрет" христиан процессларының Хроматинның өч үлчәмле структурасы формалашуына нәрсә алып барганын аңларга булышмый.

"Без кайбер структураларны күрәбез, мәсәлән, тургаль бәйләнгән доменнар (Тадада), ләкин без аерым күзәнәкләрдә булганнарын белмибез, яисә алар арифика. Моннан тыш, без беләбез, бу омтылыш күзәнәкләрендә төрле тукымаларда да төрле тукымаларда да барлыкка килә - моннан аларның структур дәрәҗәдә никадәр төрле икәнлеге турында табигый сорау бар, " Биомедицина тикшеренүләре буенча Михаил Гелфанд, вице-президент Скотаж авторы.

Сколетехта, ДНК төрү ысулларын анализлады 10627_2
HAPloid X-хромосоманың өч үлчәмле җимерелүе / © www.nature.COM

Бу проблемаларны чишү һәм индивидуаль күзәнәкләр өчен эксперимент ясар өчен, берничә учреждение тикшерүчеләре hi-c бер күзәнәкләр дип аталган ысул белән эшләнде. Гелфанд һәм тормыш үзәгенең яшәү үзәгенең Scoop Scoop Scoop Choostech Scoop Cond-C ялгыз күзәнәкләр өчен мәгълүматны оптимальләштерү һәм Дрософила күзәнәкләренең төп үзлекләрен төгәл куллануны оптимальләштерү бурычы китерде.

Россия Фәннәр академиясе һәм Ломоносов исемендәге Россия Фәннәр "биология институтының биология институтыннан аларның хезмәттәшләре Россия-Француз интрискиплинар фәнни-үзәк хезмәткәрләре белән, дрософила күзәнәкләре белән экспериментлар өчен яраклы итү ысулын оптимальләштерделәр. .

Командалар Hi-C Hi-Cның стандарт адымнарыннан башланды, анда хроматин структурасы дөрес, һәм дона табигый шартларда, "яңадан тәрҗемә итәләр," тегелгән ". ". Ләкин аннан соң барлык ДНКны берьюлы куллану урынына, галимнәр һәр шакмактан кечкенә күләмне бер шакмактан PHI29 бактериофасы полимеры ярдәмендә көчәделәр. Бу полиперазе, өлешчә ДНКны көчәйгәндә, хәтта бик аз үрнәктә башка популяр политикага караганда күп санлы хаталар ясау мөмкинлеге аркасында кулланыла.

Ләкин бу уңайлы ДНК полимеразасы, күчереп торуны югары югары дәрәҗәдә булса да, әле дә ДНК МеЛелукольләр арасында "суга сикерә ала, Я яхшы бәйләнешләрдән аерылып тора алмый. Шуңа күрә тикшерүчеләр полимеразлыкның бу очраклы "сикерүләрен" кире кагу механизмын уйнарга тиеш иде.

Алар төрле организмнарның хроматин пакетларының төп принципларының уртак принциплары икәнлеген ачыклау өчен, Дрософила күзәнәкләрендә яңа ысулын кулландылар. Маммаллеләр күзәнәкләрендә алдагы тикшеренүләр Тадесның халык тарафыннан алынган элемтә карталары буенча гына булуын күрсәтте, ләкин аерым күзәнәкләрдә түгел. Ләкин, Дрософила күзәнәкләрен өйрәнү бу доменаларның һәр доменнарының һәрбер шакмакта булуын күрсәтте.

Сколетехта, ДНК төрү ысулларын анализлады 10627_3
Дрософиладагы 3D геномында заказ һәм стохастика / © www.nature.com

Бу тотрыклы доменнарны формалаштыру өчен нинди биологик механизмның җаваплылыгы кирәк, өстәмә тикшеренүләр таләп ителәчәк; Галимнәр ике модель булганмы. Аларның берсе шаккатырырга тәкъдим итә, Дрософилада "ябылу" механизмы белән, ягъни кайбер бүлекләр бер-берсенә бәйләнештә булырга мөмкин. Икенчесе буенча, элмәкләр экспрессив механизмы дип аталганны сурәтләү, зур протеин комплекслары DNA TreDs'тан әйләнеп чыгалар, ДНК бу пакеты аркасында.

"Бәлкем, иң кызыклы сорауларның берсе - катлаулы хроматин кагыйдәләре төрле тере организмнарның төрле төрләрендә бер үк. Ялгыз күзәнәкләрнең HI-C ысулын кулланып, без бу бөҗәкләрнең гежетында да имезүче күзәнәкләрендәге доменнарда да доменнарга охшаган доменнар да белдек. Ләкин, бу корылмалар имезүчеләргә караганда күпкә заказ бирелә ", диде Александр Галицын, Шолтех аспиранты һәм мәкаләнең беренче авторларының берсе.

"Без хроматин архитектурасын һәм әйләнеш һәм Тадов формалаштыру өчен механизм архитектурасын өйрәнүне дәвам итәрбез. Бу өлкәдә җавапсыз әле күп сораулар бар. Без инде кайбер организмнарда бу механизмнарның төрле булырга мөмкинлеген беләбез, ләкин громатин катлау эволюциясе тулаем нинди? Әгәр дә без моны җитәрлек җентекләп аңларга телибез икән, без бушлыкны тутырырга, хроматин структурасын өйрәнергә тиеш, һәм инде тикшерелгәннәр генә түгел. Шуңа күрә, без диңгез спонглары, чүпрәле һәм Амоба белән эшлибез ", - ди Етраин Теммева.

Аның сүзләре буенча, төркем шулай ук ​​хроматинны авырулар белән, тән һәм картлык үсеше белән үзгәрешләр белән шөгыльләнә. "Әгәр без Хроматинаның архитектурасы геннарны белдерү белән тыгыз уйлансак, бу сорауларга җавап биреп, без кеше тәненең, картлык һәм авырулар үсешен көйләү белән эш итә алырбыз", ди Техаева.

Укуда Россия Фәннәр Академиясе Биология институты белгечләре, М.В. Ломоносов исемендәге Милли Университет белгечләре, укуда Россия-Француз Интеррискиплинар Фициент фәннәре Понщеле һәм башка оешмалар катнаша.

Чыганак: Ялангач фән

Күбрәк укы