İnsan bağırsağının yaşadığı en eksiksiz virüs kataloğunu derledi

Anonim
İnsan bağırsağının yaşadığı en eksiksiz virüs kataloğunu derledi 2040_1
İnsan bağırsağının yaşadığı en eksiksiz virüs kataloğunu derledi

Virüsler gezegenimizdeki en çok biyolojik nesnedir. Bilim insanlarının tahminlerine göre, fajlar - virüsler, enfekte ederek bakteri hücreleri ve archails olarak da bilinen bakteriyofajların sayısı 1031 partiküldür. Mikrobiyal toplulukları güçlü bir şekilde etkiler, yatay gen aktarma vektörleri olarak hareket eden yardımcı fonksiyonları kodlayan, bakteri-barındıran türleri için yararlıdır.

On yıllardır, araştırmacılar, istedikleri kadar hızlı değil, yüksek performanslı bir metagenomyanın ortaya çıkması nedeniyle, benzeri görülmemiş bir sayıda yeni fajın tespit edilmesi mümkün oldu. Böylece, beklenmedik bir keşif, faj dizilerinin çoğunluğunun, Uluslararası Virüs Taksonomisi (ICTV) Komitesi tarafından kurulan bilinen herhangi bir viral taksonomise atfedilememesidir.

Fajların çeşitli ekosistemleri etkilediği ve insan sağlığı için bağırsak mikrobiyomunun bileşiminin ve işlevlerinin önemini göz önüne aldıkları bilinmektedir, bu vücuda yaşayan fajlara dikkat çekmeye başladı. Bakterilerin toplamındaki dengesizlik, alerji ve obezite gibi birçok hastalık ve karmaşık durumun gelişimine yol açar. Ancak, şimdiye kadar, bağırsak bakterilerinin ve bakteriyofajların sağlık ve insan hastalıklarında oynadığı rol hakkında nispeten az şey biliyorduk.

Senger Enstitüsü ve Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü (Birleşik Krallık) Enstitüsü Enstitüsü ve Avrupa Biyoinformatics Enstitüsü (Birleşik Krallık) arasındaki Etkileşim Laboratuvarı'ndan, DNA Sıralama Yönteminin 28.060 setinde keşfedilen 28.060 setinde keşfedilen viral türlerin biyolojik çeşitliliğinin bir kataloğunu yaptı. Altı kıtada 28 farklı ülke (Afrika, Asya, Avrupa, Kuzey Amerika, Güney Amerika ve Okyanusya) ve bu karın organından yükseltilen 2898 bakteri izolatı genomu. Çalışmalarının sonuçları hücre dergisinde sunulmaktadır.

Bilim adamları, bir kişinin bağırsaklarında yaşayan fajların 142.809 genomunu keşfetti, yarısından daha önce tanıştı. Viral çeşitliliği, firmalar olarak böyle bir bakteri arasından en yüksek olduğu ortaya çıktı. Aynı zamanda, viral kümelerin yaklaşık% 36'sı bir tipte sınırlı değildir, filogenetik olarak farklı bakteri türleri arasında ağ akışları oluşturur.

İnsan bağırsağının yaşadığı en eksiksiz virüs kataloğunu derledi 2040_2
Bakteriyofaj ve Yapısı / © Getty Images

On binlerce virüs arasında, bilim adamları, 2014 yılında birçok ülkenin atık suda keşfedilen CrassFage Bakteriyofajı'na benzeyen özelliklere sahip olan yeni bir yaygın faj seti tanımlamıştır. Bacteroidaceae ailesinin gram-negatif anaerobik bakteri bakterilerini enfekte eden bu grup GUBAFAG olarak adlandırıldı. Ve, uzmanlara göre, o ve crassfaj - ortak bir atadır.

"Ayrıca Kuzey Amerika, Avrupa ve Asya sakinlerinin fagomları arasında, Afrika ve Güney Amerika'dan örnekler arasında net bir ayrım yaptık. İlginç bir şekilde, Fagioma desenleri (numunedeki tüm faj genomlarının dizileri kümesi. - Ref. Ed.) Bir kişinin yaşam tarzındaki önemli farklılıklarla ilişkilendirildi. Kentsel örneklerde bulunan fajlar bakteriyotlara, ancak Prevotellacea ailesinin bakterilerinde değil, PERU, Tanzanya, Madagaskar ve Fiji'den kırsal örneklerde, Bacteroides yerine Prevotellaceae'yu, "Bilim İnsanları" söyledi.

Bunlara göre, ortaya çıkan yüksek kaliteli büyük ölçekli fajlar genomları kataloğu, virüsün gelecekteki çalışmalarını iyileştirir - bağırsak mikrobiyomunun virüs bileşeni - ve insan bağırsak bakteriyofajlarının ekolojik ve evrimsel analizini mümkün kılacaktır.

"Tüm virüslerin zararlı olmadığı unutulmamalıdır: onlar bağırsak ekosisteminin ayrılmaz bir bileşenidir. Görüntülendiğimiz virüslerin çoğu, genetik bir malzeme olarak DNA'ya sahip olduğu, yani Coronavirus SARS-COV-2 veya RNA virüsleri olan Zika virüsü gibi tanınmış patojenlerden farklıdır. İkincisi, örneklerimiz, çalışmanın yazarlarından biri olan Dr. Alexander Almeida, özellikle de belirli bir hastalığa sahip olmayan sağlıklı insanlardan elde edildi "dedi.

Kaynak: Çıplak Bilim

Devamını oku