Створен је метод за визуелизацију масене спектрометријске слике, прилагођен под људском визијом

Anonim
Створен је метод за визуелизацију масене спектрометријске слике, прилагођен под људском визијом 14929_1
Створен је метод за визуелизацију масене спектрометријске слике, прилагођен под људском визијом

Резултати студије објављују се у часопису Аналитичка хемија. Масена спектрометрија високе резолуције је метода анализе супстанци заснована на тачном мерењу масовне односа да напуни (м / з) јонизовани молекули и интензитет одговарајућег сигнала од њих (њихова релативна количина). Ове информације вам омогућава да одредите молекулску тежину једињења, њихову структуру која помаже у препознавању једињења, попут протеина, липида, метаболита, пептида, компоненти лекова и других супстанци.

Масовна спектрометријска имијинг (МЦИ) омогућава вам да добијете информације о просторној расподјели молекула у ткивима, проводећи масовну спектрометријску анализу јона на локалној ласерској јонизацији молекула у свакој тачки узора у проучавању (на пример, пререзач тумора).

Тумачење података МСИ је тежак задатак. У почетку је потребно визуализовати дистрибуцију јона на површини површине прекида ткива, односно да би се изградила нормална слика у боји, у којој је свака област имала сличан јонски састав - одговара својој боји. Од хиљада јона у свакој тачки морате да одете на само три нумеричке вредности које би МСИ подаци требало да поштују у потпуности и који се могу уговорити са тродимензионалном простором боја за његову накнадну анализу истраживача.

Створен је метод за визуелизацију масене спектрометријске слике, прилагођен под људском визијом 14929_2
Опис методе / © Сколтецх Пресс Сервице

"Важно је максимизирати информативни садржај добијене слике, потребно је узети у обзир карактеристике људске визије, посебно његова не-линеарношћу и квалитативно различитом осетљивошћу на промене светлости и хроме.

И, иако је теорија перцепције боје прилично дуго времена (од прве половине 20. века), чак и међу стручњацима, нема општеприхваћених математичких модела, прилично добро описујући сва позната својства људске визије "Први аутор студије, дипломирани студент Сколтецх Анастасиа Сарицхев каже.

Истраживачи из Центра за научно-инжењерске рачунарске технологије за задатке са великим низовима података и лабораторија визуелног СПИ РАС-а понудили су нови приступ визуелизацији података МСИ-а, а не инфериорним од претходно познатих метода у погледу детаља истовремено засновано на теорији перцепције људске боје.

Нова метода задржава границе и градијете приликом примене одабраних подручја сличног јонског састава. На основу тога, резултирајућа слика се олакшава него у другим приступима са сликама МСИ подацима. Метода је тестирана и на моделу и експерименталним подацима добијеним истраживачима лабораторије масене спектрометрије Сколтеха заједно са биолозима средишта неуробиологије и неуробљивости Сцотехом.

Извор: Гола наука

Опширније