Nemški znanstveniki študirajo strukturo virusa SARS-COV-2 z uporabo 3D modeliranja. Molekularno dekodiranje koronavirusa bo pomagalo pri iskanju aktivnih za boj proti patogenskim sestavinam.
Strukturni biolog iz Würzburga Andrea Thorn že od samega začetka pandemije poskuša dešifrirati posamezne beljakovinske komponente SARS-COV-2. To je potrebno za razvijalce cepiv in drog po svetu, da bi našli sredstva za zaščito piše Berliner Zeitung. V intervjuju z objavo, specialist je dejal, da zaradi natančnega razumevanja strukture molekul koronavirus in prisotnosti njihovih modelov lahko ugotovite, kako deluje virus. Na primer, če zajame človeško celico in povzroči več virusov, je bil vsak korak izdelan iz beljakovinske molekule. Zato odklop teh beljakovinskih molekul pomeni zaustavitev okužbe.
Kako izgleda SARS-COV-2?
Coronavirus ni precej okrogel. Izgleda kot milo mehurček v stalnem gibanju. Zunanja plast je tanka mehka in je sestavljena iz maščobnih kislin, ki so kemično podobni mila. Tako lahko milo popolnoma raztopi virusno lupino - pod pogojem, da se roke umijejo dovolj dolge. Zunanja plast je prekrita s tako imenovanimi konicami, ki omogočajo virusu, da prodre na primer v pljučne celice. Toda dejstvo, da mnogi klic virusa dejansko je to samo "vrsta prevoza" virion. Znotraj ga nosi genski material za 28 beljakovinskih molekul. Večina jih je najprej vgrajena v gostiteljsko celico, da jo spremeni v predmet za proizvodnjo virusov.Mnogi menijo, da virusov ne morejo biti vidni. Morda sploh ne zavedajo, da so barvne slike, prikazane v medijih, so virusne slike. Virus in njegova nevarnost nista vidna. "Ljudje ne vidijo mnogih mrtvih, ne vidijo popolnoma preobremenjenih območij oživljanja, ker je prepoved obiskov. Prav tako je eden od razlogov, za katere smo ustvarili in natisnjeni
Narediti nevarnost bolj oprijemljivo, "je zabeležen biolog.
Kako dešifrirati molekularne strukture
Strokovnjaki ne merijo celotnega virusa, ampak samo njene posamezne molekule. Namen strukturnih biologov je iskanje enega od 28 različnih beljakovin sestavin SARS-COV-2. Druga naloga je kristalizirati jajčne beljakovine. Kristali so velikost desetin milimetra in je sestavljena iz tisoč enakih beljakovinskih molekul. Nato se ta kristal meri z rentgenskimi žarki na tako imenovanem sinhrotronskem pospeševalniku delcev kot Bessy II v Berlinu. Ti podatki nam omogočajo, da zgradimo tridimenzionalni model molekule, od katerih je kristal.
V okviru študije so modeli, ustvarjeni na podlagi pridobljenih meritev, preverjajo in izboljšajo. Člani Trne skupine Andrea sledi vsak atom, prikazan na 3D monitorju. Razmnoževanje bakterij lahko traja od 1 do 36 mesecev s čiščenjem, dokler ne deluje. Jajčni beljakovini kristalizira od 1 do 24 mesecev. Merjenje v sinhrotronu traja približno tri minute. Zbiranje podatkov in montaža struktur s pomočjo posebnih točk, ki zavzemajo od tedna do štirih mesecev, je pojasnil strokovnjak.
Do danes so znanstveniki merili 17 od 28 molekul virusov. Medtem ko strukture niso toliko - definicija traja več tednov ali mesecev - vendar se te strukture zlahka modelirajo na računalniku. Ker se spremeni le nekaj tisočih v molekuli. Po pandemiji se je število študij bistveno zmanjšalo in se ne financirajo več. Konstrukcijski biolog verjame: Če bi študije SARS-COV-2 nenehno izvajala znanstveniki več znanja o CoronaVirusu. To bi bila velika prednost in ji je omogočila, da se bolje pripravi na naslednjo pandemijo.