Virusi so najbolj številne biološke predmete na našem planetu. In število bakteriofagov, znanih tudi fages - virusi, okužijo bakterijske celice in arheys, po ocenah znanstvenikov, je 1031 delcev. Močno vplivajo na mikrobne skupnosti, ki delujejo kot horizontalni vektorji prenosa genov, ki kodirajo pomožne funkcije, ki so uporabne za vrste bakterijskih gostitelji.
Že desetletja so raziskovalci utrpeli fages, ki niso tako hitro, kot so želeli, vendar zaradi nastanka visokozmogljivega metagenoma je postalo mogoče zaznati številne nove fage. Tako je bilo nepričakovano odkritje, da večina sekvenc fage ni bilo mogoče pripisati nobeni znani virusni taksonomiji, ki ga je ustanovil Mednarodni odbor za virusno vozovnost (ICTV).
Znano je, da fages vplivajo na različne ekosisteme in glede na pomen sestave in funkcij črevesnega mikrobioma za zdravje ljudi, ki se je povečala pozornost, ki se je začela posvetiti fatam, ki naseljujejo tega telesa. Neuravnoteženost v agregatu bakterij vodi do razvoja številnih bolezni in kompleksnih držav, kot so alergije in debelost. Vendar pa smo do sedaj, smo vedeli relativno malo o vlogi, ki jo imajo črevesne bakterije in bakteriofage igrajo v zdravju in človeških bolezni.
Znanstveniki iz laboratorija za interakcijo med gostiteljico in mikrobioto na Inštitutu za Singence in Evropski inštitut za bioinformatiko (Združeno kraljestvo), ki uporabljajo metodo sekvenciranja DNK, so izdelali katalog biotske raznovrstnosti virusnih vrst, odkritih v 28.060 kompletih človeških črevesninskih genomov, zbranih v 28 Različne države na šestih celinah (Afrika, Azija, Evropa, Severna Amerika, Južna Amerika in Oceanija) in 2898 genomov bakterijskih izolatov, ki so se dvignili iz tega trebušnega organa. Rezultati njihovega dela so predstavljeni v reviji Cell.
Znanstveniki so odkrili 142.809 genomov fadov, ki živijo v črevesju osebe, več kot polovica tega, kar se je kdaj kdaj srečal. Virusna raznolikost se je izkazala, da je najvišja med takšno vrsto bakterij kot podjetja. Hkrati pa približno 36% virusnih grozdov ni bilo omejeno na eno vrsto, kar je ustvarilo mrežne tokove genov med filogenetskimi različnimi vrstami bakterij.
Med več deset tisoč virusov so znanstveniki identificirali nov razširjen nabor fagel z značilnostmi, ki spominjajo na crassfage bakteriofag, odkrili leta 2014 v odpadne vode v mnogih državah. Ta skupina, ki okuži gram-negativne anaerobne bakterije bakterije bakterije bakterijeidaceae, se je imenovala Gubafag. In, po mnenju strokovnjakov, ona in crassphage - skupni prednik.
»Opazili smo tudi jasno ločitev med fagomi prebivalcev Severne Amerike, Evrope in Azije in vzorcev iz Afrike in Južne Amerike. Zanimivo je, da so vzorci fagioma (niz zaporedij vseh fagov genomov v vzorcu. - Ref. Ed.) Povezano s pomembnimi razliki v življenjskem slogu osebe. In fage, ki jih najdemo v mestnih vzorcih, so bili usmerjeni v baktoide, ne pa na bakterije družine Prevotellacea, medtem ko so v podeželskih vzorcih iz Peruja, Tanzanije, Madagaskarja in Fidžija, so vsebovali številne lastnike, katerih cilj je namesto baktorillacejev, "znanstveniki povedal.
Po njihovem mnenju bo rezultat visokokakovostnega obsežnega kataloga genomov fagels izboljšal prihodnje študije virusa - virusne komponente črevesnega mikrobioma - in bo omogočil ekološko in evolucijsko analizo človeških črevesnih bakteriofagov.
"Ne smemo pozabiti, da niso vsi virusi škodljivi: so sestavni del črevesnega ekosistema. Večina virusov, ki smo jih razkrili, ima DNK kot genski material, to je, se razlikujejo od znanih patogenov, kot so coronavirus SARS-COV-2 ali Zika virus, ki so RNA virusi. Drugič, naši vzorci so bili pridobljeni predvsem od zdravih ljudi, ki nimajo posebnih bolezni, «je dejal dr. Alexander Almeida, eden od avtorjev študije.
Vir: Naked Science