Ustvarili metodo za vizualizacijo masne spektrometrične slike, prilagojene pod človeškim vidom

Anonim
Ustvarili metodo za vizualizacijo masne spektrometrične slike, prilagojene pod človeškim vidom 14929_1
Ustvarili metodo za vizualizacijo masne spektrometrične slike, prilagojene pod človeškim vidom

Rezultati študije so objavljeni v reviji Analitična kemija. Visoka ločljivost masna spektrometrija je metoda analize snovi, ki temelji na natančnem merjenju masnega razmerja za polnjenje (m / z) ioniziranih molekul in intenzivnosti ustreznega signala iz njih (njihova relativna količina). Te informacije vam omogočajo, da določite molekulsko maso spojin, njihovo strukturo, ki pomaga prepoznati spojine, kot so beljakovine, lipidi, presnovki, peptide, komponente zdravil in drugih snovi.

Masni spektrometrični zdravila Imijing (MCI) omogoča pridobivanje informacij o prostorski porazdelitvi molekul v tkivih, ki izvajajo masovno spektrometrično analizo ionov na lokalni laserski ionizaciji molekul na vsaki točki vzorca v študiji (na primer tumor rez).

Razlaga podatkov MSI je težka naloga. Sprva je treba prikazati porazdelitev ionov na površini površine prereza tkiva, to je, da zgradi normalno barvno sliko, v kateri je vsako območje podobno ionsko sestavo - ustreza njegovi barvi. Od tisoč ionov na vsaki točki morate iti na samo tri numerične vrednote, ki morajo spoštovati podatke MSI kot v celoti in ki jih je mogoče povezati s tridimenzionalnim barvnim prostorom za njegovo naknadno analizo s strani raziskovalca.

Ustvarili metodo za vizualizacijo masne spektrometrične slike, prilagojene pod človeškim vidom 14929_2
Opis metode / © Skoltech Tiskovna služba

"Pomembno je povečati informativno vsebino nastale slike, zato je treba upoštevati značilnosti človeške vizije, zlasti njene nelinearnosti in kvalitativno različno občutljivost na spremembe svetlosti in krome.

In čeprav je teorija zaznavanja barv pregledana že dolgo časa (od prve polovice 20. stoletja), tudi med strokovnjaki, ni splošno sprejetih matematičnih modelov, precej dobro opisujejo vse znane lastnosti človeške vizije , "Prvi avtor študije, Diplomski študent Skoltech Anastasia Sarychev pravi.

Raziskovalci iz centra znanstvenih in inženirskih računalniških tehnologij za naloge z velikimi podatkovnimi nizi (CDISE) in laboratorija vizualnih SPI RAS je ponudil nov pristop k vizualizaciji podatkov MSI, ne pa podrejenih predhodno znanih metod v smislu podrobnosti, ampak na isti čas, ki temelji na teoriji človeškega barvnega zaznavanja.

Nova metoda ohranja meje in gradiente pri uporabi izbranih področij podobne ionske sestave. Na podlagi tega se dobljeno podobo olajša lažje kot v drugih pristopih k slikanju podatkov MSI. Metoda je bila preizkušena tako na modelu in eksperimentalnih podatkih, ki so jih raziskovalci laboratorija za množično spektrometrijo Skupaj z biologi centra nevrobiologije in nevropež Scothech.

Vir: Naked Science

Preberi več