Virușii sunt cele mai numeroase obiecte biologice de pe planeta noastră. Iar numărul de bacteriofaje, cunoscut și sub numele de fagi - viruși, infectarea celulelor bacteriene și arheii, potrivit estimărilor oamenilor de știință, este de 1031 de particule. Acestea afectează puternic comunitățile microbiene, acționând ca vectori orizontali de transfer al genelor care codifică funcții auxiliare, utile pentru tipurile de bacterii-gazde.
Timp de decenii, cercetătorii au suferit fagi care nu au dorit, totuși, datorită apariției unui metagenom de înaltă performanță, a devenit posibilă detectarea unui număr fără precedent de noi fagi. Astfel, descoperirea neașteptată a fost că majoritatea secvențelor de fag nu au putut fi atribuite oricărei taxonomii virale cunoscute stabilite de Comitetul Internațional privind taxonomia virusului (ICTV).
Se știe că fagii afectează diferite ecosisteme și având în vedere importanța compoziției și a funcțiilor microbiomului intestinal pentru sănătatea umană, creșterea atenției a început să se dedice fagilor care locuiesc în acest organism. Dezechilibrul în agregarea bacteriilor duce la dezvoltarea multor boli și stări complexe, cum ar fi alergii și obezitate. Cu toate acestea, până acum, am știut relativ puțin despre rolul pe care bacteriile intestinale și bacteriofagii joacă în sănătate și boli umane.
Oamenii de știință din laboratorul de interacțiune dintre gazdă și microbiota la Institutul de Mesaj și Institutul European de Bioinformatică (Regatul Unit), aplicând metoda de secvențiere ADN a făcut ca un catalog de biodiversitate a speciilor virale descoperite în 28.060 seturi de genomuri intestinale umane colectate în 28 de țări diferite în șase continente (Africa, Asia, Europa, America de Nord, America de Sud și Oceania) și 2898 de genomi de izolate bacteriene, care au crescut din acest organ abdominal. Rezultatele lucrărilor lor sunt prezentate în revista Cell.
Oamenii de știință au descoperit 142.809 de genomi ai fagilor care trăiesc în intestinul unei persoane, mai mult de jumătate dintre care s-au întâlnit vreodată. Diversitatea virală sa dovedit a fi cea mai mare dintre un astfel de tip de bacterii ca firme. În același timp, aproximativ 36% din clusterele virale nu au fost limitate la un singur tip, creând fluxuri de rețea de gene între tipurile diferite de bacterii diferite.
Printre zeci de mii de viruși, oamenii de știință au identificat un nou set larg de fagi cu caracteristici asemănătoare cu bacteriofagul crashage, descoperit în 2014 în apele reziduale din multe țări. Acest grup infectând bacteriile de bacterii anaerobe gram-negative din familia bacterilidită a fost numită Gubafag. Și, potrivit experților, ea și Crassphage - un strămoș comun.
"Am observat, de asemenea, o separare clară între figomii locuitorilor din America de Nord, Europa și Asia și eșantioane din Africa și America de Sud. Interesant, modelele Fagioma (un set de secvențe ale tuturor genomilor de fagi din eșantion. - Ref. Ed.) Corelat cu diferențe importante în stilul de viață al unei persoane. Iar fagii găsiți în probele urbane au vizat bacteroizi, dar nu pe bacteriile familiei Prevodellacea, în timp ce în probele rurale din Peru, Tanzania, Madagascar și Fiji au conținut fagiile cu o gamă de proprietari care vizează Prevodellaceae în loc de bacteroizi ", oamenii de știință a spus.
Potrivit acestora, catalogul de mare calitate la scară largă de înaltă calitate a genomului fagilor va îmbunătăți studiile viitoare ale virusului - componenta virusului microbioma intestinală - și va face posibilă analiza ecologică și evolutivă a bacteriofagurilor intestinale umane.
"Trebuie amintit că nu toți virușii sunt dăunători: ele sunt o componentă integrală a ecosistemului intestinal. Majoritatea virușilor pe care am dezvăluit au ADN ca material genetic, care diferă, diferă de agenții pato-cunoscuți, cum ar fi coronavirusul SARS-COV-2 sau virusul Zika, care sunt viruși ARN. În al doilea rând, eșantioanele noastre au fost obținute în principal de la oameni sănătoși care nu au boli specifice ", a spus dr. Alexander Almeida, unul dintre autorii studiului.
Sursa: Știința goală