Compilou o catálogo mais completo de vírus que habitam o intestino humano

Anonim
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Os vírus são os objetos biológicos mais numerosos em nosso planeta. E o número de bacteriófagos, também conhecidos como fagos - vírus, infectar células bacterianas e arqueis, de acordo com as estimativas dos cientistas, são 1031 partículas. Eles afetam fortemente as comunidades microbianas, agindo como vetores de transferência de genes horizontais que codificam as funções auxiliares, úteis para tipos de hosts de bactérias.

Durante décadas, os pesquisadores sofreram fagos não tão rápido quanto queria, no entanto, devido ao surgimento de um metagenomilo de alto desempenho, tornou-se possível detectar um número sem precedentes de novos fagos. Assim, a descoberta inesperada foi que a maioria das sequências de fagos não pôde ser atribuída a qualquer taxonomia viral conhecida estabelecida pelo Comitê Internacional da Taxonomia do Vírus (ICTV).

Sabe-se que os fagos afetam vários ecossistemas e, dadas a importância da composição e funções do microbioma intestinal para a saúde humana, aumentando a atenção começar a se dedicar aos fagos que habitam esse corpo. O desequilíbrio no agregado de bactérias leva ao desenvolvimento de muitas doenças e estados complexos, como alergias e obesidade. No entanto, até agora, sabíamos relativamente pouco sobre o papel que as bactérias intestinais e bacteriófagos desempenham em saúde e doenças humanas.

Cientistas do laboratório de interação entre o hospedeiro e a microbiota no Instituto de Senger e do Instituto Europeu de Bioinformática (Reino Unido), aplicando o método de sequenciamento de DNA fez um catálogo de biodiversidade de espécies virais descobertas em 28.060 conjuntos de genomas intestinais humanos coletadas em 28 Países diferentes em seis continentes (África, Ásia, Europa, América do Norte, América do Sul e Oceania), e 2898 genomas de isolados bacterianos, que levantados desse órgão abdominal. Os resultados de seu trabalho são apresentados na revista celular.

Os cientistas descobriram 142.809 genomas dos fagos que vivem no intestino de uma pessoa, mais da metade dos quais já se encontraram antes. A diversidade viral acabou sendo a mais alta entre tal tipo de bactérias como empresas. Ao mesmo tempo, cerca de 36% dos clusters virais não estavam limitados a um tipo, criando fluxos de rede de genes entre tipos filogeneticamente diferentes de bactérias.

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Bacteriófago e sua estrutura / © Getty Images

Entre dezenas de milhares de vírus, os cientistas identificaram um novo conjunto generalizado de fagos com características que se assemelham a bacteriófago de crassfago, descobertos em 2014 nos águas residuais de muitos países. Este grupo infectando bactérias bactérias anaeróbicas gram-negativas da família Bacteroidaceae foi chamada Gubafag. E, de acordo com especialistas, ela e crassfago - um ancestral comum.

"Também observamos uma clara separação entre os fagoms dos habitantes da América do Norte, Europa e Ásia e amostras da África e da América do Sul. Curiosamente, padrões de fagioma (um conjunto de seqüências de todos os genomas de fagos na amostra. - Ref. Ed.) Correlacionado com importantes diferenças no estilo de vida de uma pessoa. E os fagos encontrados em amostras urbanas foram destinados a bacteróides, mas não nas bactérias da família PrevoTellacea, enquanto nas amostras rurais do Peru, Tanzânia, Madagascar e Fiji continham fagos com uma gama de proprietários voltados para a prevotelaceae, em vez de bacteroides, "cientistas contado.

Segundo eles, o catálogo de genomas de fagos de alta qualidade resultante melhorará estudos futuros de vírus - o componente do vírus do microbioma intestinal - e permitirá que seja possível análise ecológica e evolutiva de bacteriófagos intestinais humanos.

"Deve ser lembrado que nem todos os vírus são prejudiciais: eles são um componente integral do ecossistema intestinal. A maioria dos vírus que revelamos tenhamos DNA como material genético, isto é, difere dos conhecidos patógenos, como o Coronavirus Sars-Cov-2 ou o vírus Zika, que são vírus RNA. Em segundo lugar, nossas amostras foram obtidas principalmente de pessoas saudáveis ​​que não têm nenhuma doença específica ", disse o Dr. Alexander Almeida, um dos autores do estudo.

Fonte: Ciência nua

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