Virussen zijn de meest talrijke biologische objecten op onze planeet. En het aantal bacteriofagen, ook bekend als fagen - virussen, infecteren van bacteriële cellen en archeys, volgens schattingen van wetenschappers, is 1031 deeltjes. Ze beïnvloeden de microbiële gemeenschappen ten zeerste, die optreedt als horizontale genoverdrachtse vectoren die coderen voor hulpfuncties, nuttig voor soorten bacteriën-hosts.
Al tientallen jaren hebben onderzoekers de fagen leed, niet zo snel als ze wilden, omdat het echter vanwege de opkomst van een krachtige metagenomyle werd, werd het mogelijk om een ongekend aantal nieuwe fagen te detecteren. Aldus was de onverwachte ontdekking dat de meerderheid van de faagsequenties niet konden worden toegeschreven aan een bekende virale taxonomie die is vastgesteld door het Internationaal Comité voor Virus Taxonomy (ICTV).
Het is bekend dat fagen verschillende ecosystemen beïnvloeden, en gezien het belang van de samenstelling en functies van het darmmicrobioom voor de gezondheid van de mens, begon toenemende aandacht te schenken aan de fagen die aan dit lichaam wonen. De onevenwichtigheid in het aggregaat van bacteriën leidt tot de ontwikkeling van vele ziekten en complexe staten, zoals allergieën en obesitas. Tot nu toe kenden we echter relatief weinig over de rol die darmbacteriën en bacteriofagen in gezondheid en menselijke ziekten spelen.
Wetenschappers van het laboratorium voor interactie tussen de gastheer en de microbiota bij het Instituut voor Senger en het Europees Instituut voor Bioinformatics (Verenigd Koninkrijk), die de DNA-sequencing-methode toepassen, maakten een catalogus van de biodiversiteit van virale soorten die werden ontdekt in 28.060 sets van menselijke darmlingen die zijn verzameld 28 verschillende landen in zes continenten (Afrika, Azië, Europa, Noord-Amerika, Zuid-Amerika en Oceanië) en 2898 genomen van bacteriële isolaten, die van dit abdominale orgaan worden verhoogd. De resultaten van hun werk worden gepresenteerd in celmagazine.
Wetenschappers hebben 142.809-genomen van de fagen ontdekt die in de darm van een persoon wonen, waarvan er meer dan de helft ooit heeft ontmoet. Virale diversiteit bleek het hoogste van zo'n soort bacteriën als bedrijven. Tegelijkertijd was ongeveer 36% van de virale clusters niet beperkt tot één type, het creëren van netwerkstromen van genen tussen fylogenetisch verschillende soorten bacteriën.
Onder tienduizenden virussen hebben wetenschappers een nieuwe wijdverspreide reeks fagen geïdentificeerd met kenmerken die lijken op crassfagebacteriofaag, ontdekt in 2014 in het afvalwater van vele landen. Deze groep infecteren gram-negatieve anaerobe bacteriënbacteriën van de familie Bacterioïdeacea werd Gubafag genoemd. En volgens deskundigen, zij en crassfase - een gemeenschappelijke voorouder.
"We observeerden ook een duidelijke scheiding tussen de fagoms van de inwoners van Noord-Amerika, Europa en Azië en monsters uit Afrika en Zuid-Amerika. Interessant is dat fagioom patronen (een reeks sequenties van alle faag-genomomen in het monster. - Ref. Ed.) Correleerden met belangrijke verschillen in de levensstijl van een persoon. En de fagen gevonden in stedelijke monsters waren gericht op bacterioïden, maar niet op de bacteriën van de prevotelacea-familie, terwijl in landelijke monsters uit Peru, Tanzania, Madagaskar en Fiji fages bevatten met een reeks eigenaren gericht op prevotellaceae in plaats van bacteroïden, "wetenschappers," verteld.
Volgens hen zal de resulterende hoogwaardige grootschalige catalogus van de genomen van de fagen de toekomstige studies van virus - de viruscomponent van het darmmicrobioom verbeteren - en zal het mogelijk maken voor ecologische en evolutionaire analyse van menselijke darmbacteriofagen.
"Het moet onthouden worden dat niet alle virussen schadelijk zijn: ze zijn een integrale component van het darm ecosysteem. De meeste virussen die we hebben geopenbaard hebben DNA als een genetisch materiaal hebben, dat is, verschillen van de bekende pathogenen, zoals Coronavirus SARS-COV-2 of het ZIKA-virus, dat RNA-virussen zijn. Ten tweede werden onze monsters voornamelijk verkregen van gezonde mensen die geen specifieke ziekten hebben, "zei Dr. Alexander Almeida, een van de auteurs van het onderzoek.
Bron: Naked Science