Creëerde een werkwijze voor het visualiseren van massaspectrometrische beeld, aangepast onder menselijke visie

Anonim
Creëerde een werkwijze voor het visualiseren van massaspectrometrische beeld, aangepast onder menselijke visie 14929_1
Creëerde een werkwijze voor het visualiseren van massaspectrometrische beeld, aangepast onder menselijke visie

De resultaten van het onderzoek worden gepubliceerd in de Journal Analytical Chemistry. Hoge resolutie massaspectrometrie is een stofanalyse-methode op basis van nauwkeurige meting van de massaverhouding om (M / Z) geïoniseerde moleculen en de intensiteit van het overeenkomstige signaal van hen (hun relatieve hoeveelheid) op te laden. Met deze informatie kunt u het molecuulgewicht van de verbindingen bepalen, hun structuur, die helpt om verbindingen te identificeren, zoals eiwitten, lipiden, metabolieten, peptiden, componenten van drugs en andere stoffen.

Massaspectrometrische iMijing (MCI) Hiermee kunt u informatie verkrijgen over de ruimtelijke verdeling van moleculen in weefsels, waardoor massaspectrometrische analyse van ionen bij lokale laserionisatie van moleculen op elk punt van het onderwijsmonster (bijvoorbeeld een tumorsnede) wordt geleid.

Interpretatie van MSI-gegevens is een moeilijke taak. Aanvankelijk is het noodzakelijk om de distributie van ionen op het oppervlak van het oppervlak van de weefselafsnijding te visualiseren, dat wil zeggen, om een ​​normaal kleurenbeeld te construeren, waarin elk gebied met een vergelijkbare ionenstelling - overeenkomt met de kleur. Van duizenden ionen op elk punt moet je naar slechts drie numerieke waarden gaan die de MSI-gegevens als volledig moeten respecteren en die kunnen worden gecorreleerd met driedimensionale kleurruimte voor de daaropvolgende analyse van de onderzoeker.

Creëerde een werkwijze voor het visualiseren van massaspectrometrische beeld, aangepast onder menselijke visie 14929_2
Beschrijving van de methode / © Skoltech Pers Service

"Het is belangrijk om het informatiegehalte van het resulterende beeld te maximaliseren, het is noodzakelijk om rekening te houden met de kenmerken van menselijke visie, met name de niet-lineariteit en kwalitatief andere gevoeligheid voor veranderingen in helderheid en chroma.

En hoewel de theorie van de kleurperceptie al heel lang wordt onderzocht (sinds de eerste helft van de 20e eeuw), zelfs bij de experts zijn er geen algemeen aanvaarde wiskundige modellen, vrij goed beschreven alle bekende eigenschappen van mensenvisie , "De eerste auteur van de studie, afgestudeerde student Skoltech Anastasia Sarychev zegt.

Onderzoekers uit het centrum van wetenschappelijke en technische computertechnologieën voor taken met grote datarrays (CDise) en het laboratorium van visuele SPI RAS bood een nieuwe benadering van visualisatie van MSI-gegevens, niet inferieur aan eerder bekende werkwijzen in termen van detail, maar bij de dezelfde tijd gebaseerd op de theorie van de menselijke kleurperceptie.

De nieuwe methode behoudt grenzen en hellingen bij het aanbrengen van geselecteerde gebieden van vergelijkbare ionen samenstelling. Op grond hiervan wordt het resulterende beeld eenvoudiger geïnterpreteerd dan bij andere benaderingen van de beeldvorming van MSI-gegevens. De methode is zowel op model- als experimentele gegevens getest die wordt verkregen door onderzoekers van het laboratorium voor massaspectrometrie van Skolteha samen met de biologen van het centrum van neurobiologie en neuroability of Scothech.

Bron: Naked Science

Lees verder