Создаден метод за визуелизација на масовната спектрометриска слика, прилагодена под човечката визија

Anonim
Создаден метод за визуелизација на масовната спектрометриска слика, прилагодена под човечката визија 14929_1
Создаден метод за визуелизација на масовната спектрометриска слика, прилагодена под човечката визија

Резултатите од студијата се објавуваат во списанието Аналитичка хемија. Масовната спектрометрија со висока резолуција е метод за анализа на супстанции врз основа на точното мерење на масовниот сооднос за полнење (M / Z) јонизирани молекули и интензитетот на соодветниот сигнал од нив (нивното релативно количество). Оваа информација ви овозможува да ја одредите молекуларната тежина на соединенијата, нивната структура, која помага да се идентификуваат соединенијата, како што се протеини, липиди, метаболити, пептиди, компоненти на лекови и други супстанции.

Масовното спектрометриско Imijing (MCI) ви овозможува да добиете информации за просторна дистрибуција на молекулите во ткивата, спроведување на масовна спектрометриска анализа на јони во локалната ласерска јонизација на молекулите во секоја точка на примерокот во студијата (на пример, намалување на туморот).

Толкувањето на податоците на MSI е тешка задача. Првично, неопходно е да се визуелизира дистрибуцијата на јони на површината на површината на ткивото, односно да се изгради нормална слика во боја, во која секоја област има сличен јонски состав - одговара на неговата боја. Од илјадници јони во секоја точка треба да одите на само три нумерички вредности кои треба да ги почитуваат податоците на MSI како целосно и кои можат да бидат во корелација со тридимензионален простор во боја за неговата последователна анализа од страна на истражувачот.

Создаден метод за визуелизација на масовната спектрометриска слика, прилагодена под човечката визија 14929_2
Опис на методот / © Skoltech Прес-служба

"Важно е да се максимизира информативната содржина на добиената слика, неопходно е да се земат предвид карактеристиките на човечката визија, особено нејзината нелинеарност и квалитативно различна чувствителност на промените во осветленоста и хромот.

И, иако теоријата на перцепцијата на бои е подолго време (од првата половина на 20 век), дури и меѓу експертите не се општо прифатени математички модели, доста добро опишувајќи ги сите познати својства на човечката визија , "Првиот автор на студијата, дипломиран студент Сколч Анастасија Саричев вели.

Истражувачите од центарот за научни и инженерски компјутерски технологии за задачи со големи податоци за податоци (CDISISE) и лабораторија на Visual SPI RAS понудија нов пристап кон визуелизацијата на податоците на MSI, кои не се инфериорни во однос на претходно познатите методи во смисла на детали, но на Исто време врз основа на теоријата на перцепцијата на човечки бои.

Новиот метод ги задржува границите и градиентите при примена на избрани области со сличен јонски состав. Врз основа на ова, добиената слика се толкува полесно отколку во другите пристапи кон снимањето на податоците на MSI. Методот е тестиран и на модел и експериментални податоци добиени од истражувачите на лабораторијата за масовна спектрометрија на Скулха, заедно со биолозите на Центарот за невробиологија и невробилноста на Scothech.

Извор: Голи наука

Прочитај повеќе