Vācu zinātnieki izpētīt SARS-COV-2 vīrusa struktūru, izmantojot 3D modelēšanu. Coronavirus molekulārā dekodēšana palīdzēs atrast aktīvu, lai apkarotu patogēnu sastāvdaļas.
Strukturālais biologs no Würzburg Andrea ērkšķis no paša sākuma pandēmijas mēģina atšifrēt atsevišķus proteīna komponentus SARS-COV-2. Tas ir nepieciešams, lai izstrādātājiem vakcīnu un narkotiku visā pasaulē, lai atrastu aizsardzības līdzekļus raksta Berliner Zeitung. Intervijā ar publikāciju speciālists teica, ka, pateicoties precīzai izpratnei par koronavīrusu molekulu struktūru un to modeļu klātbūtni, jūs varat uzzināt, kā vīruss darbojas. Piemēram, ja viņš uztver cilvēka šūnu un padara to vairāk vīrusu, tad katrs solis tika izgatavots no proteīna molekulas. Tāpēc šo proteīnu molekulu atcelšana nozīmē infekcijas pārtraukšanu.
Kā izskatās SARS-COV-2?
Coronavirus nav diezgan apaļas. Tas izskatās kā ziepju burbulis pastāvīgā kustībā. Ārējais slānis ir plāns mīksts un sastāv no taukskābēm, kas ir ķīmiski līdzīgas ziepēm. Tādējādi ziepes var pilnībā izšķīdināt vīrusu apvalku - ja rokas mazgāt pietiekami ilgi. Ārējais slānis ir pārklāts ar tā saukto tapu, kas ļauj vīrusu iekļūt, piemēram, plaušu šūnās. Bet fakts, ka daudzi sauc vīrusu, tas ir tikai "transporta veids" virions. Tajā ir ģenētisks materiāls 28 olbaltumvielu molekulām. Lielākā daļa no kuriem vispirms iebūvēts uzņēmējas šūnā, lai to pārvērstu par vīrusu ražošanai objektu.Daudzi uzskata, ka vīrusus nevar sasniegt redzamus. Viņi pat nevar saprast, ka medijos redzamie krāsu attēli ir vīrusu attēli. Vīruss un tā bīstamība nav redzama. "Cilvēki neredz daudzus mirušos neredz pilnīgi pārslodzes atdzīvināšanas filiāles, jo ir aizliegums apmeklējumiem. Tas ir arī viens no iemesliem, par kuriem mēs arī izveidojām un izdrukājām
Padarīt bīstamību vairāk taustāmu, "Biologs atzīmēja.
Kā atšifrēt molekulārās struktūras
Eksperti nenozīmē ne visu vīrusu, bet tikai tās individuālās molekulas. Strukturālo biologu mērķis ir meklēt vienu no 28 dažādiem SARS-COV komponentu proteīniem - 2. Vēl viens uzdevums ir kristalizēt olu proteīnu. Kristāli ir milimetra desmito daļu lielums un sastāv no tūkstošiem identisku proteīnu molekulu. Tad šis kristāls tiek mērīts, izmantojot rentgenstaru uz tā saukto synchrotron akseleratoru daļiņu kā Bessy II Berlīnē. Šie dati arī ļauj mums izveidot trīsdimensiju modeli molekulas, no kura ir izgatavots kristāls.
Kā daļu no pētījuma, modeļi, kas izveidoti, pamatojoties uz iegūtajiem mērījumiem, tiek pārbaudīti un uzlaboti. Andrea ērkšķu komandas locekļiem seko katrs atoms, kas attēlots 3D monitorā. Baktēriju reproducēšana var ilgt no 1 līdz 36 mēnešiem ar tīrīšanu, līdz tas darbojas. Olu proteīns kristalizējas no 1 līdz 24 mēnešiem. Mērīšana sinhrotron aizņem apmēram trīs minūtes. Datu vākšana un struktūru montāža ar īpašu punktu palīdzību aizņem no nedēļas līdz četriem mēnešiem, eksperts paskaidroja.
Līdz šim zinātnieki novērtēja 17 no 28 vīrusu molekulām. Lai gan struktūras nav tik daudz - definīcija aizņem vairākas nedēļas vai mēnešus - bet šīs struktūras var viegli modelēt datorā. Tā kā tiek mainīti tikai daži no tūkstošiem molekulas tūkstošiem. Pēc pandēmijas studiju skaits ir ievērojami samazinājies, un tie vairs nav finansēti. Strukturālais biologs uzskata: ja SARS-COV-2 pētījumos tika veikti pastāvīgi zinātniekiem, būtu vairāk zināšanu par koronavīrusu. Tas būtu milzīga priekšrocība un ļāva labāk sagatavoties nākamajam pandēmijai.