Izveidoja metodi masas spektrometrijas attēla vizualizēšanai, kas pielāgota cilvēka redzējumam

Anonim
Izveidoja metodi masas spektrometrijas attēla vizualizēšanai, kas pielāgota cilvēka redzējumam 14929_1
Izveidoja metodi masas spektrometrijas attēla vizualizēšanai, kas pielāgota cilvēka redzējumam

Pētījuma rezultāti tiek publicēti žurnālā analītiskā ķīmijā. Augstas izšķirtspējas masas spektrometrija ir vielu analīzes metode, kas balstīta uz precīzu mērījumu attiecību, lai uzlādētu (m / z) jonizētās molekulas un atbilstošā signāla intensitāti (to relatīvais daudzums). Šī informācija ļauj noteikt savienojumu molekulmasu, to struktūru, kas palīdz identificēt savienojumus, piemēram, proteīnus, lipīdus, metabolītus, peptīdus, narkotiku un citu vielu sastāvdaļas.

Masas spektrometrija IMIJING (MCI) ļauj iegūt informāciju par molekulu telpisko sadalījumu audos, veicot masveida spektrometrisko analīzi jonus vietējā lāzera jonizācijā molekulu katrā pētījuma parauga punktā (piemēram, audzēja griezums).

MSI datu interpretācija ir grūts uzdevums. Sākotnēji ir nepieciešams vizualizēt jonu sadalījumu uz audu nogriezšanas virsmas virsmas, tas ir, lai izveidotu normālu krāsu attēlu, kurā katra platība ir līdzīga jonu sastāvs - atbilst tās krāsai. No tūkstošiem jonu katrā brīdī jums ir jādodas uz tikai trim skaitliskām vērtībām, kurām būtu jāievēro MSI dati tikpat pilnībā un ko var korelēt ar trīsdimensiju krāsu telpu tās turpmākai pētnieka analīzei.

Izveidoja metodi masas spektrometrijas attēla vizualizēšanai, kas pielāgota cilvēka redzējumam 14929_2
Metodes / © Skoltech preses dienesta apraksts

"Ir svarīgi maksimāli palielināt iegūtā attēla informācijas saturu, ir jāņem vērā cilvēka redzes iezīmes, jo īpaši tās nelinearitāte un kvalitatīvi atšķirīga jutība pret spilgtuma un hroma izmaiņām.

Un, lai gan krāsu uztveres teorija tiek pārbaudīta diezgan ilgu laiku (kopš 20. gadsimta pirmās puses), pat starp ekspertiem nav vispārpieņemtiem matemātiskiem modeļiem, diezgan labi aprakstot visas pazīstamas cilvēka redzes īpašības , "Pirmais pētījuma autors, absolvents Skoltech Anastasia Sarychevs saka.

Pētnieki no zinātnisko un inženiertehnisko skaitļošanas tehnoloģiju centra uzdevumiem ar lieliem datu masīviem (CDISE) un Visual SPI RAS laboratorija piedāvāja jaunu pieeju MSI datu vizualizācijai, kas nav zemāka par iepriekš zināmām metodēm detalizācijas ziņā, bet pie tajā pašā laikā, pamatojoties uz cilvēka krāsu uztveres teoriju.

Jaunā metode saglabā robežas un slīpumus, piemērojot izvēlētās līdzīgas jonu kompozīcijas laukumus. Pateicoties tam, iegūtais attēls tiek interpretēts vieglāk nekā citās pieejas attēlveidošanai MSI datu. Metode ir pārbaudīta gan modelī, gan eksperimentālos datus, kas iegūti, pētnieki laboratorijas masu spektrometrijas Skolteha kopā ar biologiem neirobioloģijas un neironabilitātes SCHOCK.

Avots: Naked Science

Lasīt vairāk