შედგენილია ადამიანის ნაწლავის დასახლებულ ვირუსების ყველაზე სრულყოფილი კატალოგი

Anonim
შედგენილია ადამიანის ნაწლავის დასახლებულ ვირუსების ყველაზე სრულყოფილი კატალოგი 2040_1
შედგენილია ადამიანის ნაწლავის დასახლებულ ვირუსების ყველაზე სრულყოფილი კატალოგი

ვირუსები ჩვენი პლანეტის ყველაზე მრავალრიცხოვანი ბიოლოგიური ობიექტებია. ბაქტერიოფაგების რაოდენობა, რომელიც ასევე ცნობილია, როგორც Phages - ვირუსები, ბაქტერიული უჯრედების და არეატების ინფექციები, მეცნიერების შეფასებით, არის 1031 ნაწილაკები. ისინი მკაცრად იმოქმედებს მიკრობულ თემებში, მოქმედებენ ჰორიზონტალური გენი გადაცემის ვექტორების, დამხმარე ფუნქციების კოდირებით, სასარგებლოა ბაქტერიების ტიპისთვის.

ათწლეულების მანძილზე მკვლევარებმა არ დაავადებულნი იყვნენ ისეთივე სწრაფი, რადგან მათ უნდოდათ, თუმცა, მაღალი ხარისხის მეტაგენომლის წარმოშობის გამო, შესაძლებელი გახდა ახალი პრობლემების უპრეცედენტო რაოდენობის გამოვლენა. ამგვარად, მოულოდნელი აღმოჩენა იყო, რომ ვირუსის ტაქსონომიის საერთაშორისო კომიტეტის მიერ დადგენილი ნებისმიერი ცნობილი ვირუსული ტაქსონომია არ შეიძლება მიეწოდოს.

ცნობილია, რომ ეს ფაზები სხვადასხვა ეკოსისტემებს იწვევს და ადამიანის ჯანმრთელობისათვის ნაწლავის მიკრობიომის შემადგენლობისა და ფუნქციების მნიშვნელობას, ყურადღებას ამახვილებს ამ ორგანოს დასახლებაზე. ბაქტერიების აგრეგატში დისბალანსი იწვევს მრავალი დაავადების განვითარებას და კომპლექსურ მდგომარეობას, როგორიცაა ალერგიები და სიმსუქნე. თუმცა, აქამდე შედარებით ცოტა ვიცოდით, რომ ნაწლავის ბაქტერიები და ბაქტერიოფაგები ჯანმრთელობასა და ადამიანურ დაავადებებში ითამაშეს.

მეცნიერებმა მასპინძელთა და მიკროავტოს შორის ლაბორატორიის ლაბორატორიის ლაბორატორიის ლაბორატორია და ბიოინფორმაციული ინსტიტუტის (გაერთიანებული სამეფო) ინსტიტუტში, დნმ-ის თანმიმდევრობის მეთოდების გამოყენებით, შეიქმნა ვირუსული სახეობების ბიომრავალფეროვნების კატალოგი, რომელიც აღმოაჩინეს ადამიანის ნაწლავის გენომების 28,060 კომპლექტში ექვსი სხვადასხვა ქვეყანას ექვსი კონტინენტზე (აფრიკა, აზია, ევროპა, ჩრდილოეთ ამერიკა, სამხრეთ ამერიკა და ოკეანია), და 2898 ბაქტერიული იზოლატების გენომები, რომლებიც ამ მუცლის ორგანოდან გაიზარდა. მათი მუშაობის შედეგები წარმოდგენილია საკანში ჟურნალში.

მეცნიერებმა აღმოაჩინეს 142,809 ადამიანი, რომელიც ცხოვრობს ნაწლავში, რომელთა ნახევარზე მეტი, რომელთაგან უფრო ადრე შეხვდა. ვირუსული მრავალფეროვნება აღმოჩნდა ყველაზე მაღალი ბაქტერიების, როგორც ფირმების სახით. ამავდროულად, ვირუსული კლასტერების დაახლოებით 36% არ შემოიფარგლებოდა ერთ ტიპზე, ფილოგენეტულად სხვადასხვა ტიპის ბაქტერიების ქსელის ნაკადების შექმნა.

შედგენილია ადამიანის ნაწლავის დასახლებულ ვირუსების ყველაზე სრულყოფილი კატალოგი 2040_2
ბაქტერიოფაჟი და მისი სტრუქტურა / © გეტის სურათები

ათობით ათასი ვირუსით, მეცნიერებმა გამოავლინეს ახალი ფართოდ გავრცელებული კომპლექტი ფირფიტების მქონე Crassphage Bacteriophage- ში, რომელიც 2014 წელს აღმოაჩინეს მრავალი ქვეყნის ჩამდინარე წყლებში. ბაქტერიოიდასეის ოჯახის გრამ-უარყოფითი ანაერობული ბაქტერიების ინფექციის ამ ჯგუფმა Gubafag- ს უწოდებდა. და ექსპერტების აზრით, ის და Crassphage - საერთო წინაპარი.

"ჩვენ ასევე ვნახეთ მკაფიო გამოყოფა ჩრდილოეთ ამერიკის, ევროპისა და აზიისა და აფრიკისა და სამხრეთ ამერიკის ნიმუშების ნიმუშების მკაფიო გამოყოფას შორის. საინტერესოა, Fagioma ნიმუშების (კომპლექტი sequences ყველა phage გენომების ნიმუში. - Ref. Ed.) კორელაცია მნიშვნელოვანი განსხვავებები პიროვნების ცხოვრებაში. და ურბანული ნიმუშების ფირფიტები მიზნად ისახავდა ბაქტერიოიდებს, მაგრამ არა პერუს, ტანზანიას, მადაგასკარისა და ფიჯის სოფლის ნიმუშებში, რომლებიც სოფელში, მადაგასკარისა და ფიჯისგან შედგებოდნენ, რომლებიც ბაქტერიოიდების ნაცვლად, "მეცნიერები" განუცხადა.

მათი თქმით, ფულის გენომების მაღალი ხარისხის ფართომასშტაბიანი კატალოგი გააუმჯობესებს ვირუსის მომავალ კვლევებს - ნაწლავის მიკრობიომის ვირუსის კომპონენტს - ადამიანის ნაწლავის ბაქტერიოფაგების ეკოლოგიური და ევოლუციური ანალიზისთვის.

"უნდა აღინიშნოს, რომ ყველა ვირუსები არ არის საზიანო: ისინი ნაწლავის ეკოსისტემის განუყოფელი კომპონენტია. უმეტესი ვირუსების, რომ ჩვენ გამოვლინდა დნმ როგორც გენეტიკური მასალა, ანუ, განსხვავდება ცნობილი პათოგენების, როგორიცაა Coronavirus Sars-Cov-2 ან Zika Virus, რომლებიც RNA ვირუსები. მეორე, ჩვენი ნიმუშები ძირითადად ჯანსაღი ადამიანები იყვნენ, რომლებსაც არ გააჩნიათ რაიმე კონკრეტული დაავადებები ", - ამბობს კვლევის ერთ-ერთი ავტორის დოქტორი ალექსანდრე ალმეიდა.

წყარო: შიშველი მეცნიერება

Წაიკითხე მეტი