I virus sono i più numerosi oggetti biologici sul nostro pianeta. E il numero di batterofagi, noto anche come fages - virus, infettando cellule batteriche e archeys, secondo le stime degli scienziati, è 1031 particelle. Incidono fortemente le comunità microbiche, agendo come vettori di trasferimento del gene orizzontale che codificano le funzioni ausiliarie, utili per i tipi di host di batteri.
Per decenni, i ricercatori hanno subito gradi non così veloci come volevano, tuttavia, a causa dell'emergere di un metagenomyle ad alte prestazioni, è diventato possibile rilevare un numero senza precedenti di nuovi fages. Pertanto, la scoperta inaspettata era che la maggior parte delle sequenze di Phage non poteva essere attribuita a nessuna tassonomia virale conosciuta stabilita dal comitato internazionale sulla tassonomia del virus (ICTV).
È noto che i fagi colpiscono vari ecosistemi, e data l'importanza della composizione e delle funzioni del microbioma intestinale per la salute umana, l'aumento dell'attenzione cominciò a dedicare ai fagi che abitano questo corpo. Lo squilibrio nell'aggregato dei batteri conduce allo sviluppo di molte malattie e stati complessi, come allergie e obesità. Tuttavia, fino ad ora, sapevamo relativamente poco riguardo al ruolo che i batteri intestinali e i batteriofagi svolgono in salute e malattie umane.
Gli scienziati del laboratorio di interazione tra l'ospite e la microbitata presso l'Istituto di Senger e l'Istituto europeo di Bioinformatica (Regno Unito), applicando il metodo di sequenziamento del DNA fecero un catalogo di biodiversità delle specie virali scoperte in 28.060 serie di genomi intestinali umani raccolti in 28 diversi paesi in sei continenti (Africa, Asia, Europa, Nord America, Sud America e Oceania) e 2898 genomi di isolati batterici, sollevati da questo organo addominale. I risultati del loro lavoro sono presentati nella rivista cellulare.
Gli scienziati hanno scoperto 142.809 genomi dei foraggi che vivono nell'intestino di una persona, più della metà dei quali mai incontrati prima. La diversità virale si è rivelata la più alta tra tale tipo di batteri come aziende. Allo stesso tempo, circa il 36% dei cluster virali non erano limitati a un tipo, creando flussi di rete di geni tra tipi di batteri filyogeneticamente diversi.
Tra le decine di migliaia di virus, gli scienziati hanno identificato una nuova serie diffusa di foraggi con caratteristiche che assomigliano a batteriofagi di crassphage, scoperte nel 2014 nelle acque reflue di molti paesi. Questo gruppo infettando i batteri anaerobici di batteri anaerobici gram-negativi della famiglia dei battroidaceae si chiamava GubaFag. E, secondo gli esperti, lei e crassphage - un antenato comune.
"Abbiamo anche osservato una chiara separazione tra i fomba degli abitanti del Nord America, dell'Europa e dell'Asia e dei campioni dall'Africa e dall'America del Sud. È interessante notare che i modelli di fagioma (un insieme di sequenze di tutti i genomi di fago nel campione. - Rif. Ed.) Correlato con importanti differenze nello stile di vita di una persona. E i favi trovati nei campioni urbani erano rivolti a batteridi, ma non sui batteri della famiglia di prevotellacea, mentre nei campioni rurali del Perù, della Tanzania, del Madagascar e delle Fiji contenevano fages con una serie di proprietari volti a Prevottellaceae invece dei batteroides, "scienziati detto.
Secondo loro, il conseguente catalogo su larga scala di alta qualità dei genomi di fagi migliore migliorerà studi futuri di virus - il componente virus del microbioma intestinale - e consentirà l'analisi ecologica ed evolutiva dei batteriofagi intestinali umani.
"Deve essere ricordato che non tutti i virus sono dannosi: sono una componente integrale dell'ecosistema intestinale. La maggior parte dei virus che abbiamo rivelato hanno il DNA come materiale genetico, cioè differisce dai ben noti patogeni, come Coronavirus SARS-Cov-2 o il virus Zika, che sono virus dell'RNA. In secondo luogo, i nostri campioni sono stati ottenuti principalmente da persone sane che non hanno malattie specifiche ", ha detto il dottor Alexander Almeida, uno degli autori dello studio.
Fonte: scienza nuda