Összeállította az emberi bélben lakó vírusok legteljesebb katalógusa

Anonim
Összeállította az emberi bélben lakó vírusok legteljesebb katalógusa 2040_1
Összeállította az emberi bélben lakó vírusok legteljesebb katalógusa

A vírusok a bolygónk leginkább számos biológiai tárgya. És a bakteriofágok száma, más néven fágok - vírusok, fertőzés bakteriális sejtek és régészeti, a tudós becslése szerint 1031 részecskék. Ezek erősen befolyásolja a mikrobiális közösségek, meghatalmazotti horizontális géntranszfer vektorokat kódoló segédfunkciók, hasznos típusú baktériumot-gazdaszervezetek.

Évtizedek óta a kutatók nem olyan gyorsan szenvedtek, mint amilyennek akartak, azonban a nagy teljesítményű metagenomyle kialakulása miatt azonban lehetővé tette az új fágok példátlan számát. Így a váratlan felfedezés az volt, hogy a fágszekvenciák többségét nem lehetett tulajdonítani a Vírus Taxonómia (ICTV) nemzetközi bizottság által létrehozott ismert vírus taxonómiához.

Ismeretes, hogy a fágok különböző ökoszisztémákat érintenek, és tekintettel az emberi egészség intesztinális mikrobiomájának összetételének és funkcióinak fontosságára, a figyelemre méltó figyelmet a szervezetben lakó fágoknak szentelték. A baktériumok aggregátumának egyensúlyhiánya számos betegség és komplex állam fejlődéséhez vezet, mint például az allergiák és az elhízás. Eddig azonban viszonylag keveset tudtunk arról, hogy a bélbaktériumok és a bakteriofágok az egészségben és az emberi betegségekben játszottunk.

A Senger Senger Intézetében és az Európai Bioinformatikai Intézetben (Egyesült Királyság) közötti kölcsönhatás laboratóriumából származó tudósok a DNS-szekvenálási módszert alkalmazva, a vírusfajok biológiai sokféleségének katalógusa a 28.060 humán bélrendszeri genomokban 28 különböző országban hat kontinensen (Afrika, Ázsia, Európa, Észak-Amerika, Dél-Amerika és Óceánia), és 2898-genomok baktérium izolátumok, ami felveti ebből hasi szerv. Munkájuk eredményeit a Cell Magazinban mutatják be.

A tudósok felfedezték a fágok 142,809 genomját, akik egy személy belváján élnek, több mint fele korábban találkozott. A vírus sokféleség kiderült, hogy a legtöbb ilyen típusú baktériumok, mint cégek. Ugyanakkor a vírus klaszterek kb. 36% -a nem korlátozódott egy típusra, hanem a filogenetikailag különböző baktériumok közötti gének hálózati áramát.

Összeállította az emberi bélben lakó vírusok legteljesebb katalógusa 2040_2
Bakteriofág és szerkezete / © getty képek

Több tízezer vírus közül a tudósok új, széles körű fágokat azonosítottak a Crazpext bakteriofághoz hasonló jellemzőkkel, amelyek 2014-ben felfedezték a sok ország szennyvízében. Ez a csoport, amely fertőzött Gram-negatív anaerob baktérium baktériumokat a bakteroidaceae családnak Gubafagnak nevezték. És a szakértők szerint ő és crassportházs - egy közös ős.

"Világos elválasztást is megfigyeltünk az Észak-Amerika, Európa és Ázsia lakosai és Afrika és Dél-Amerika mintái között. Érdekes módon fagioma minták (a mintában lévő összes fág genom szekvenciája. - Ref. Ed.) A személy életmódjának fontos különbségeivel korrelált. És a fágok találhatók városi mintákat célzó bakteroidokká, de nem a baktériumok prevotellacea család, míg a vidéki mintákban Peru, Tanzánia, Madagaszkár és Fidzsi tartalmazott fágok számos tulajdonosok célzó Prevotellaceae helyett Bacteroides, „tudósok mondta.

Szerintük, a kapott jó minőségű nagyméretű katalógus genomok fágok javítja jövőkutatás vírus - a vírus eleme a bél microbioma - és lehetővé teszi, hogy az ökológiai és evolúciós elemzés az emberi bél bakteriofágok.

"Emlékeztetni kell arra, hogy nem minden vírus káros: a bél ökoszisztéma szerves részét képezik. A legtöbb vírus, hogy kiderült van DNS mint egy genetikai anyag, amely, különbözik a jól ismert kórokozók, mint például a koronavírus SARS koronavírus-2 vagy a Zika vírus, amely RNS-vírusok. Másodszor, a mintáinkat elsősorban olyan egészséges emberekből kaptuk, akiknek nincsenek specifikus betegségeinek - mondta Dr. Alexander Almeida, a tanulmány egyik szerzője.

Forrás: meztelen tudomány

Olvass tovább