Konpile katalòg ki pi konplè nan viris abite trip imen an

Anonim
Konpile katalòg ki pi konplè nan viris abite trip imen an 2040_1
Konpile katalòg ki pi konplè nan viris abite trip imen an

Viris yo ki pi anpil objè yo byolojik sou planèt nou an. Ak nimewo a nan bakteryofaj, ke yo rele tou faz - viris, enfekte selil bakteri ak archeys, selon estimasyon syantis yo, se 1031 patikil. Yo fòtman afekte kominote yo microbes, aji kòm orizontal vektè transfere Gene kodaj fonksyon oksilyè, itil pou kalite bakteri-gen tout pouvwa a.

Pou deseni, chèchè yo te soufri faces pa osi vit ke yo te vle, sepandan, akòz Aparisyon nan yon metagenomyilil pèfòmans-wo, li te vin posib yo detekte yon nimewo san parèy nan nouvo faz. Kidonk, dekouvèt la inatandi te ke majorite nan sekans faily pa t 'ka atribiye a nenpòt kask viral li te ye etabli pa Komite Entènasyonal la sou Viris Taksonomi (ICTV).

Li konnen ke faz afekte ekosistèm divès kalite, ak bay enpòtans ki genyen nan konpozisyon sa a ak fonksyon nan mikrobiom a entesten pou sante moun, ogmante atansyon yo te kòmanse konsakre nan faz yo abite kò sa a. Move balans la nan total la nan bakteri mennen nan devlopman nan maladi anpil ak eta konplèks, tankou alèji ak obezite. Sepandan, jouk koulye a, nou te konnen relativman ti kras sou wòl nan ki bakteri entesten ak bakteryofaj jwe nan sante ak maladi moun.

Syantis soti nan laboratwa a nan entèraksyon ant lame a ak mikrobiota nan Enstiti a nan Senger ak Enstiti Ewopeyen an nan Bioinformatics (Wayòm Ini), k ap aplike metòd la sekans ADN te fè yon katalòg nan divèsite biyolojik nan espès viral dekouvri nan 28.060 kouche nan jeni imen an kolekte nan 28 diferan peyi nan sis kontinan (Lafrik di, Azi, Ewòp, Amerik di Nò, Amerik di Sid ak Oceania), ak 2898 jnom nan izole bakteri, ki leve soti vivan nan sa a ògàn nan vant. Rezilta yo nan travay yo yo prezante nan magazin selilè.

Syantis yo te dekouvri 142.809 jnom nan faz yo k ap viv nan trip la nan yon moun, plis pase mwatye nan moun te janm te rankontre anvan. Viral divèsite te tounen soti yo dwe pi wo a nan mitan tankou yon kalite bakteri kòm konpayi. An menm tan an, sou 36% nan grap viral yo pa te limite a yon kalite, kreye sous dlo rezo nan jèn ant phylogenetically diferan kalite bakteri.

Konpile katalòg ki pi konplè nan viris abite trip imen an 2040_2
Bakteryophage ak estrikti li yo / © Geti Images

Pami dè dizèn de dè milye de viris, syantis yo te idantifye yon nouvo seri toupatou nan faz ak karakteristik fè l sanble souvan bakteryofaj kranponophage, dekouvri nan 2014 nan dlo ize a nan anpil peyi. Gwoup sa a enfekte gram-negatif bakteri anaerobik bakteri nan fanmi an bakteroidaceae te rele Gubafag. Epi, dapre ekspè yo, li ak kranpris - yon zansèt komen.

"Nou menm tou nou obsève yon separasyon klè ant Fagoms yo nan moun ki rete nan Amerik di Nò, Ewòp ak Azi ak echantiyon soti nan Lafrik ak Amerik di Sid. Enteresan, modèl Fagioma (yon seri sekans nan tout jan degrenminasyon nan echantiyon an. - Ref. Ed.) Koehle ak diferans enpòtan nan fòm nan yon moun. Ak faz yo te jwenn nan echantiyon iben yo te ki vize a baktero, men se pa sou bakteri yo nan fanmi an PrevotelraCEA, Lè nou konsidere ke nan echantiyon nan zòn riral soti nan Perou, Tanzani, Madagascar ak Fidji genyen fags ak yon seri de mèt ki vize a PrevotelCeae olye pou yo bakteroye, "syantis te di.

Dapre yo, ki kapab lakòz-wo kalite gwo-echèl katalòg la nan jnom nan faz pral amelyore etid nan lavni nan viris - eleman nan viris nan mikrobiom nan entesten - epi yo pral fè li posib nan analiz ekolojik ak evolisyonè nan bakteryofaj imen entesten.

"Li dwe vin chonje ke se pa tout viris yo danjere: yo se yon eleman entegral nan ekosistèm nan entesten. Pifò nan viris yo ke nou devwale gen ADN kòm yon materyèl jenetik, se sa ki, diferan de ajan patojèn yo ki byen koni, tankou Coronavirus SARS-CoV-2 oswa viris la Zika yo, ki se viris RNA. Dezyèmman, echantiyon nou yo te jwenn sitou nan moun ki an sante ki pa gen okenn maladi espesifik, "te di Dr Alexander Almeida, youn nan otè yo nan etid la.

Sous: toutouni Syans

Li piplis