הידור הקטלוג המלא ביותר של וירוסים המאכלסים את המעי האנושי

Anonim
הידור הקטלוג המלא ביותר של וירוסים המאכלסים את המעי האנושי 2040_1
הידור הקטלוג המלא ביותר של וירוסים המאכלסים את המעי האנושי

וירוסים הם החפצים הביולוגיים הרבים ביותר על הפלנטה שלנו. ואת מספר bacteriophages, הידוע גם בשם phages - וירוסים, להדביק תאים חיידקים וארכאיס, על פי אומדני המדענים, הוא 1031 חלקיקים. הם משפיעים מאוד על קהילות מיקרוביאליות, מתנהג כמו אופקי גנים העברת וקטורים קידוד פונקציות עזר, שימושי עבור סוגים של חיידקים- hosts.

במשך עשרות שנים, החוקרים סבלו שלבים לא מהר כפי שהם רצו, עם זאת, בשל הופעתה של metagenomyle ביצועים גבוהים, זה הפך להיות אפשר לזהות מספר חסר תקדים של phages חדש. לפיכך, הגילוי הבלתי צפוי היה כי רוב רצפי phage לא ניתן לייחס לכל טקסונומיה ויראלית ידועה שהוקמה על ידי הוועדה הבינלאומית על טקסונומיה וירוס (ICTV).

זה ידוע כי שלבים להשפיע על מערכות אקולוגיות שונות, ונתנו את החשיבות של הרכב ותפקידים של מיקרוביומה המעי לבריאות האדם, הגדלת תשומת הלב החלה להקדיש את phages המאכלס את הגוף הזה. חוסר האיזון במצטברי חיידקים מוביל לפיתוח מחלות רבות ומצבים מורכבים, כגון אלרגיות והשמנת יתר. עם זאת, עד כה, ידענו מעט יחסית על התפקיד כי חיידקים מעיים חיידקים לשחק בבריאות ומחלות אנושיות.

מדענים מעבדה של אינטראקציה בין המארח לבין המיקרוביוטיה במכון הסנטר לבין המכון האירופי של ביואינפורמטיקה (בריטניה), החלת שיטת רצף ה- DNA עשויה קטלוג של המגוון הביולוגי של מינים ויראליים שנתגלו ב -28,060 סטים של גנומינאים מעיים אנושיים שנאספו 28 מדינות שונות בשש יבשות (אפריקה, אסיה, אירופה, צפון אמריקה, דרום אמריקה ואוקיאניה), ו 2898 גנומס של מבודד חיידקי, אשר גידלו מאיבר הבטן הזה. תוצאות עבודתם מוצגות במגזין התא.

מדענים גילו 142,809 גנום של שלבים החיים במעי של אדם, יותר ממחציתם נפגשו אי פעם בעבר. מגוון ויראלי התברר להיות הגבוה ביותר בין סוג כזה של חיידקים כמו חברות. במקביל, כ -36% של אשכולות ויראליים לא היו מוגבל לסוג אחד, יצירת זרמי רשת של גנים בין סוגים שונים של חיידקים.

הידור הקטלוג המלא ביותר של וירוסים המאכלסים את המעי האנושי 2040_2
Bacteriophage ואת המבנה שלה / © Getty Images

בקרב עשרות אלפי וירוסים, מדענים זיהו קבוצה חדשה של phages עם מאפיינים הדומה crassphage bacteriophage, שהתגלו בשנת 2014 בשפכים של מדינות רבות. קבוצה זו מדבקת חיידקים חיידקים אנאירוביים שלילית של גרם שלילית של משפחת בקטרואטאציא נקראת Gubafag. ו, לדברי מומחים, היא ו crassphage - אב קדמון משותף.

"גם אנחנו ראינו הפרדה ברורה בין התושבות של תושבי צפון אמריקה, אירופה ואסיה ודגימות מאפריקה ודרום אמריקה. מעניין, דפוסי fagioma (קבוצה של רצפים של כל הגנומים phage במדגם. - Ref. אד) מתואם עם הבדלים חשובים באורח החיים של אדם. ואת phages שנמצאו דגימות עירוניות נועדו לקטרואידים, אבל לא על חיידקים של המשפחה prevatellacea, ואילו בדגימות כפריות מפרו, טנזניה, מדגסקר ופיג 'י הכיל phages עם מגוון של הבעלים שנועדו prevotellaceae במקום bacteruides, "מדענים אמר.

לדבריהם, הקטלוג הגדול באיכות גבוהה בקנה מידה גדול של גנומים של phages ישפרו מחקרים עתידיים של וירוסים - מרכיב הנגיף של המיקרוביומה המעי - ויאפשר ניתוח אקולוגי ואבולוציוני של חיידקים מעיים אנושיים.

"יש לזכור כי לא כל וירוסים מזיקים: הם מרכיב אינטגרלי של המערכת האקולוגית המעי. רוב הווירוסים שחשפו יש דנ"א כחומר גנטי, כלומר, שונה מן הפתוגנים הידועים, כגון Coronavirus SARS-COV-2 או וירוס זיקה, אשר וירוסים RNA. שנית, הדגימות שלנו הושגו בעיקר מאנשים בריאים שאין להם מחלות ספציפיות ", אמר ד"ר אלכסנדר אללידה, אחד מחברי המחקר.

מקור: מדע עירום

קרא עוד