Compilou o catálogo máis completo de virus que habitan o intestino humano

Anonim
Compilou o catálogo máis completo de virus que habitan o intestino humano 2040_1
Compilou o catálogo máis completo de virus que habitan o intestino humano

Os virus son os obxectos biolóxicos máis numerosos do noso planeta. E o número de bacteriófagos, tamén coñecidos como fagos - virus, infectando células bacterianas e arqueas, segundo as estimacións dos científicos, é de 1031 partículas. Eles afectan fortemente ás comunidades microbianas, que actúan como vectores de transferencia de xenes horizontales que codifican funcións auxiliares, útiles para tipos de bacterias-hosts.

Durante décadas, os investigadores sufriron fagos non tan rápidos como querían, porén, debido á aparición dun metagenomilo de alto rendemento, fíxose posible detectar un número sen precedentes de novos fagos. Así, o descubrimento inesperado foi que a maioría das secuencias de fago non se puideron atribuír a ningunha taxonomía viral coñecida establecida polo Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV).

Sábese que as fagas afectan a varios ecosistemas, e dada a importancia da composición e funcións do microbioma intestinal para a saúde humana, a atención crecente comezou a dedicarse ás fagas que habitan este corpo. O desequilibrio no agregado de bacterias conduce ao desenvolvemento de moitas enfermidades e estados complexos, como alergias e obesidade. Non obstante, ata agora, sabiamos relativamente pouco sobre o papel que as bacterias intestinais e as bacteriófagos xogan en enfermidades sanitarias e humanas.

Os científicos do laboratorio de interacción entre o anfitrión e a microbiota do Instituto de Senger eo Instituto Europeo de Bioinformática (Reino Unido), aplicando o método de secuenciación de ADN fixo un catálogo de biodiversidade de especies virales descubertas en 28.060 conxuntos de xenomas intestinais humanos recollidos en 28 países diferentes en seis continentes (África, Asia, Europa, América do Norte, América do Sur e Oceanía) e 2898 xenomas de illados bacterianos, que levantaron a partir deste órgano abdominal. Os resultados do seu traballo preséntanse na revista Cell.

Os científicos descubriron 142.809 xenomas dos fagos que viven no intestino dunha persoa, máis da metade dos cales xa se coñeceron antes. A diversidade viral resultou ser a máis alta entre tal tipo de bacterias que as empresas. Ao mesmo tempo, preto do 36% dos clusters virales non se limitaron a un tipo, creando fluxos de rede de xenes entre tipos filogenéticamente diferentes de bacterias.

Compilou o catálogo máis completo de virus que habitan o intestino humano 2040_2
Bacteriófago ea súa estrutura / © Getty Images

Entre decenas de miles de virus, os científicos identificaron un novo conxunto de fagos xeneralizados con características que se asemellan ao bacteriófago de casos, descubertos en 2014 nas augas residuais de moitos países. Este grupo que infecta as bacterias de bacterias anaeróbicas gram-negativas da familia Bacteroidaceae chamábase GUBAFAG. E, segundo os expertos, ela e Crasspato - un antepasado común.

"Tamén observamos unha clara separación entre os fagoms dos habitantes de América do Norte, Europa e Asia e mostras de África e América do Sur. Curiosamente, os patróns de fagioma (un conxunto de secuencias de todos os genómetros do fago na mostra. - Ref. Ed.) Correlacionado con diferenzas importantes no estilo de vida dunha persoa. E as fagos que se atopan en mostras urbanas estaban destinadas a bacterias, pero non sobre as bacterias da familia Prevotellacea, mentres que nas mostras rurais do Perú, Tanzania, Madagascar e Fiji contiñan fagos con unha variedade de propietarios dirixidos a Prevotellaceae en lugar de bacterianos, "científicos) contou.

Segundo eles, o catálogo de gran escala de alta calidade resultante de genomas de fagos mellorará os futuros estudos de virus - o compoñente do virus do microbioma intestinal - e fará posible a análise ecolóxica e evolutiva dos bacteriófagos intestinais humanos.

"Hai que lembrar que non todos os virus son prexudiciais: son un compoñente integral do ecosistema intestinal. A maioría dos virus que revelamos teñen ADN como un material xenético, é dicir, difiren dos patóxenos coñecidos, como Coronavirus SARS-COV-2 ou o virus Zika, que son virus de ARN. En segundo lugar, as nosas mostras obtivéronse principalmente a partir de persoas sanas que non teñen enfermidades específicas ", dixo o Dr. Alexander Almeida, un dos autores do estudo.

Fonte: ciencia espida

Le máis