Les scientifiques de l'Institut Skolkovsk Institute of Science and Technology, l'Institut des problèmes d'information des informations de Harkevich dans l'Académie des sciences de la Russie, la première université médicale d'État nommée d'après Pavlov et l'Institut Smorodintsev a publié une pré-empreinte de travail sur le portail virologique.org , dans lequel ils ont parlé d'un patient de 47 ans avec Covid dix-neuf ans. Le fait est que dans son cas, Coronavirus a acquis 18 mutations et elle était malade depuis plus de quatre mois.
À la fin du mois de mars de l'année dernière, une femme avec un lymphome Néhodgkinsky B-cellsky Quatrième étape a été hospitalisée pour le passage de la chimiothérapie planifiée Ritusimab (agent antitumoral d'un groupe d'anticorps monoclonaux). Elle se trouvait dans la même chambre avec un patient âgé, qui a rapidement révélé Covid-19.
Le 17 avril, une femme de 47 ans a été déchargée de l'hôpital, mais moins de deux semaines, elle a diagnostiqué une maladie coronavirus. «À ce moment-là, il est apparu des symptômes de Covid-19 (température corporelle élevée). Cet échantillon de source a été rejeté immédiatement après le test et n'était pas disponible pour le séquençage. Coups de nasoplices répétés datés du 14 mai, le 19 mai, le 9 mai et le 14 juillet, ils ont donné un résultat négatif sur SARS-COV-2. Néanmoins, le patient du 25 mai au 21 août, les symptômes de graves Covid-19 ont été observés. Les résultats de ses tests étaient à nouveau positifs 3, 5, 8, 11, 13, 17, 20, 21, 21, 26, 27 août, ainsi que les 3 et 9 septembre. Enfin, le résultat a été négatif le 12 septembre, puis réinitialisé le 10 novembre et le 16 décembre: «Les auteurs de l'étude écrivent.
Les scientifiques ont séquencé le génome de l'échantillon de virus obtenu le 20 août de la nasopharynx. À titre de comparaison, ils ont également séquencé l'échantillon de frottis de la femme (patient A), à partir duquel un (s) patient (s) âgé de 47 ans est probablement et infecté. En conséquence, il s'est avéré que de la référence, Wuhan Soud Sars-Cov-2, un échantillon de Russes distinguent 25 changements génétiques. "Parmi ceux-ci, sept variations de polymorphismes monocléotidiques, dont trois dans les positions voisines 21881-21883, sont placées dans l'échantillon d'un patient en ligne B.1.1. Le génome porte les 18 changements génétiques restants. Un échantillon du premier patient âgé et est placé dans la ligne de base B.1.1, confirmant que 18 mutations sont spécifiques au patient S ", a expliqué des experts.
Ainsi, les auteurs du rapport, séquencés par le génome de coronavirus du patient avec le lymphome, se caractérisent par une acquisition indépendante de 18 nouvelles mutations accumulées du 10 avril au 20 août: cela correspond à la vitesse de 1,67E-3. Le nucléotide par an, qui est, dépasse de manière significative le taux d'évolution moyen de manière significative SARS-COV-2. Y compris les mutations de la protéine S S-protéine Y453F et Δ69-70HV ("combinaison ΔF"), qui ont été révélées dans le coronavirus de vison contaminé.
"Les deux mutations se trouvent chez un patient avec une fréquence intermédiaire: c'est un cas de polymorphisme à l'intérieur de l'hôte. Étant donné que l'analyse phylogénétique a montré que le pedigree du patient n'est pas associé à un cluster de vison, des mutations ont été recouvertes. L'acquisition indépendante d'une paire identique de changements de vison et de patients atteints de lymphome, ainsi qu'entre plusieurs patients présentant une immunité déprimée, implique des changements convenus dans la sélection. Le patient a fourni le seul échantillon d'aujourd'hui avec une combinaison de mutations de Y453F et S: Δ69-70HV en dehors du groupe 5, c'est-à-dire acquis indépendamment du vison », a-t-il ajouté.
En outre, le patient a révélé deux autres mutations, qui ont déjà été trouvées chez d'autres patients atteints de Covid-19 avec une immunité affaiblie, y compris N501Y. Ce changement est présent dans la souche britannique de Coronavirus et la version sud-africaine.
"Étant donné que toutes ces mutations sont achetées avec Concorfinement (c'est-à-dire similaire au génotype. - Env. Ed.) Il contribue donc à la pression de sélection, qui est commun aux patients ayant une immunité affaiblie et, éventuellement pour visser, mais diffère de cela dans la population. Néanmoins, les options identifiées chez les patients présentant une immunité affaiblie (et dans le vison) peuvent s'étendre ultérieurement à une population commune, affectant les caractéristiques des souches de circulation », les auteurs de l'étude ont résumé.
Le chef du groupe scientifique Gregory Basykin, professeur de l'Institut Skolkovsky de la science et de la technologie, a noté dans le commentaire des médias russes, comme décrit dans le cas du rapport - un seul. «Pour une situation épidémiologique générale, elle ne représente pas beaucoup d'importance. On espère que ce virus, qui est originaire du corps de ce patient, n'est allé nulle part. Il s'agit plutôt de comprendre comment ce virus évolue et quelle sélection naturelle agit à ce sujet », a-t-il souligné.
Source: science nue