Koostuu ihmisen suoliston virusten täydellisin luetteloon

Anonim
Koostuu ihmisen suoliston virusten täydellisin luetteloon 2040_1
Koostuu ihmisen suoliston virusten täydellisin luetteloon

Virukset ovat planeettamme lukuisia biologisia esineitä. Ja bakteriofagien lukumäärä, joka tunnetaan myös faagiksi - viruksiksi, infektoimiseksi bakteerisoluista ja arkeilista tutkijoiden arvioiden mukaan, on 1031 hiukkasia. Ne vaikuttavat voimakkaasti mikrobiyhteisöihin, jotka toimivat vaakasuorina geeninsiirtovektoreina, jotka koodaavat apulaitteita, jotka ovat käyttökelpoisia bakteerien tyypit.

Vuosikymmeniä tutkijat ovat kärsinyt faagit, jotka eivät ole yhtä nopeasti kuin halusivat kuitenkin korkean suorituskyvyn metagenomityylin syntymisen vuoksi, oli mahdollista havaita ennennäkemätön määrä uusia faagit. Näin ollen odottamaton löytö oli se, että suurin osa faagisekvensseistä ei voitu johtua minkäänlaista viruksen taksonomian (ICTV) kansainvälisen valiokunnan määräämän virus taksonomiaan.

Tiedetään, että faagit vaikuttavat erilaisiin ekosysteemeihin ja kun otetaan huomioon ihmisten terveyden suoliston mikrobioma, koostumus ja tehtävät, yhä enemmän huomiota herättäisi tätä elintä. Bakteerien yhteenkuulutus johtaa monien sairauksien ja monimutkaisten valtioiden, kuten allergioiden ja liikalihavuuden kehittämiseen. Tähän asti tiesimme kuitenkin suhteellisen vähän roolista, että suoliston bakteerit ja bakteriofagit leikkivät terveys- ja ihmisen sairauksissa.

Sengerin ja Euroopan bioinformatiikan instituutin (Yhdistynyt kuningaskunta) välisen vuorovaikutuksen välisen vuorovaikutuksen tiedemiehet, jotka soveltavat DNA-sekvensointimenetelmää, teki DNA-sekvensointimenetelmän luettelon viruksen lajien biologisen monimuotoisuuden luettelosta 28 060 sarjassa 28 eri maasta kuudessa maanosassa (Afrikka, Aasia, Eurooppa, Pohjois-Amerikka, Etelä-Amerikka ja Oseania) sekä 2898 bakteerisolut, jotka ovat nousseet tästä vatsan elimestä. Työn tulokset on esitetty solulehdissä.

Tutkijat ovat löytäneet 142 809 ihmisen suolistossa asuvien faagien genomit yli puolet, joista on koskaan tavannut ennen. Viral-monimuotoisuus osoittautui korkeimmaksi tällaiseen bakteereihin yrityksinä. Samanaikaisesti noin 36 prosenttia virusklustereista ei rajoitu yhteen yhteen tyyppiin, mikä luo verkon virtauksia geeneihin filogeenettisesti erilaisten bakteerien välillä.

Koostuu ihmisen suoliston virusten täydellisin luetteloon 2040_2
Bakteriofagia ja sen rakenne / © Getty Images

Kymmenien tuhansien virusten joukossa tutkijat ovat tunnistaneet uuden laajan leviämisen faagit, joilla on ominaisuuksia, jotka muistuttavat vuonna 2014 monien maiden jätevedessä. Tämä ryhmä infektoitiin gram-negatiivisia anaerobisia bakteeribakteereja bakteeribakteerien bakteeribakteereista kutsuttiin GUBAFAGiksi. Ja asiantuntijoiden mukaan hän ja craspage - yhteinen esi-isä.

"Olemme myös havainneet selkeää erottamista Pohjois-Amerikan, Euroopan ja Aasian asukkaiden ja Afrikan ja Etelä-Amerikan näytteiden välillä. Mielenkiintoista, Fagioma-mallit (joukko sekvenssit kaikista näytteestä). - Ref. Ed.) Korreloivat tärkeitä eroja henkilön elämäntavoissa. Ja kaupunkien näytteissä löydettyjä faagit pyrkivät bakteerille, mutta ei prevottetacean perheen bakteereissa, kun taas Perusta, Tansania, Madagaskar ja Fidži sisälsivät faatteja, joilla oli erilaisia ​​omistajia, joiden tarkoituksena oli bakteeresin sijasta "Tutkijat kertoi.

Niiden mukaan tuloksena syntynyt faagien genomien laadukas laajamittainen luettelo parantaa suoliston mikrobioman viruskomponenttia - ja mahdollistaa ihmisen suolen bakteriofagien ekologisen ja evolutionaarisen analyysin.

"On muistettava, että kaikki virukset eivät ole haitallisia: ne ovat integroitu osa suolen ekosysteemistä. Suurin osa viruksista, joita paljastimme DNA: lla geneettisenä materiaalina, toisistaan ​​erikseen tunnetuista patogeeneista, kuten Coronavirus SARS-COV-2: sta tai Zika-viruksista, jotka ovat RNA-viruksia. Toiseksi näytteemme saatiin pääasiassa terveiltä ihmisiltä, ​​joilla ei ole erityisiä sairauksia ", sanoi tohtori Alexander Almeida, joka on yksi tutkimuksen tekijöistä.

Lähde: Alasti tiede

Lue lisää