Saksa teadlased uurivad SARS-COV-2 viiruse struktuuri 3D-modelleerimise abil. Koronaviiruse molekulaarne dekodeerimine aitab leida aktiivne patogeeni koostisosade vastu võitlemiseks.
Struktuurne bioloog Würzburg Andrea Thorn alates alates algusest pandeemia püüab dešifreerida üksikute valku komponendid SARS-COV-2. See on vajalik selleks, et arendajad vaktsiinide ja narkootikume üle maailma leida kaitsevahendid kirjutab Berliner Zeitung. Intervjuus avaldamisega ütles spetsialist, et tänu täpsele arusaamisele Coronaviiruse molekulide struktuurist ja nende mudelite olemasolust saate teada, kuidas viirus töötab. Näiteks, kui ta lööb inimese raku ja muudab selle toota rohkem viiruseid, siis iga etapp tehti valgumolekulist. Seetõttu on nende valgumolekulide lahtiühendamine infektsiooni peatamine.
Mida näeb välja SARS-COV-2?
Koronaviirus ei ole päris vooru. See näeb välja nagu seebi mull konstantsel liikumisel. Väliskiht on õhuke pehme ja koosneb rasvhapetest, mis on keemiliselt sarnased seebiga. Seega võib seebi viiruse kesta täielikult lahustuda - tingimusel, et käed pesta piisavalt kaua. Väliskiht on kaetud nn naeludega, mis võimaldavad viirusele tungida näiteks kopsurakkudes. Kuid asjaolu, et paljud kõne viirus on tegelikult see on lihtsalt "transpordi tüüp" viilu. Sees kannab see geneetilist materjali 28 valgu molekulile. Enamik neist ehitatakse kõigepealt peremeesrakkule, et muuta see viiruste tootmise objektiks.Paljud usuvad, et viirusi ei saa teha nähtavaks. Nad ei pruugi isegi mõista, et meedias näidatud värvipildid on viiruse pildid. Viirus ja selle oht ei ole nähtavad. "Inimesed ei näe palju surnud, ei näe täielikult ülekoormatud elustamisoksiid, sest külastuste keelustamine on ka üks põhjusi, miks me ka loonud ja trükitud
Ohu tekitamiseks käegakatsutavamaks muutmiseks märkis bioloog.
Kuidas dešifreerida molekulaarseid struktuure
Eksperdid mõõdavad mitte kogu viirust, vaid ainult selle individuaalseid molekule. Struktuursete bioloogide eesmärk on otsida SARS-COV-2 komponentide 28 erinevatest valkudest. Teine ülesanne on munavalgu kristalliseeruda. Kristallid on millimeetri kümnendiku suurus ja koosneb tuhandetest identsetest valgumolekulidest. Seejärel mõõdetakse seda kristalli kasutades röntgenkiirte nn sünkrotroni kiirendi AS Bessy II Berliinis. Need andmed võimaldavad meil luua kolmemõõtmelise mudeli molekuli, mille kristall on valmistatud.
Uuringu osana kontrollitakse ja parandatakse saadud mõõtmiste põhjal loodud mudelid. Andrea Thorni meeskonna liikmetele järgneb iga aatom 3D-ekraanil kujutatud aatom. Bakterite reprodutseerimine võib võtta 1 kuni 36 kuud puhastamisega, kuni see toimib. Munavalk kristalliseerub 1 kuni 24 kuud. Mõõtmine Sünkrotronis kestab umbes kolm minutit. Andmete kogumine ja konstruktsioonide kokkupanek eripunktide abil tegutseb nädalast neljaks kuuks Expert.
Praeguseks mõõdetasid teadlased 17-st 28 viiruse molekulist. Kuigi struktuurid ei ole nii palju - määratlus võtab mitu nädalat või kuud - kuid neid struktuure saab arvutis kergesti modelleerida. Kuna ainult mõned tuhanded molekuli muudetakse. Pärast pandeemia, uuringute arv on oluliselt vähenenud ja neid enam rahastatakse. Konstruktsiooniboloogi usub: Kui SARS-COV-2 uuringud viidi läbi pidevalt teadlastele, teadlasi oleks rohkem teadmisi Coronaviiruse kohta. See oleks tohutu eelis ja võimaldas tal järgmise pandeemia jaoks paremini ette valmistada.