Viirused on meie planeedi kõige arvukamad bioloogilised objektid. Ja bakteriofaagide arv, tuntud ka faagidena - viirused, nakatavad bakteriaalsed rakud ja arheys, vastavalt teadlaste hinnangutele, on 1031 osakesi. Nad mõjutavad tugevalt mikroobide kogukondade horisontaalse geeniülekandevektoritena, mis kodeerivad lisafunktsioone, mis on kasulikud bakterite võõrustajate tüübi jaoks.
Aastakümneid on teadlased kannatanud faagi kandnud mitte nii kiiresti kui nad tahtsid siiski suure jõudlusega metagenomüüli tekkimise tõttu, sai võimalikuks tuvastada enneolematu arvu uusi faagesid. Seega ootamatu avastus oli see, et enamik faagi järjestusi ei saa seostada mis tahes teadaoleva viiruse taksonoomia poolt kehtestatud rahvusvahelise viirusekomitee viiruse taksonoomia (IKTV).
On teada, et faagid mõjutavad erinevaid ökosüsteeme ja arvestades soole mikrobioomi koostise ja funktsioonide tähtsust inimeste tervisele, pöörates tähelepanu sellele kehale elavatele faagidele. Bakterite kogumi tasakaalustamatus viib paljude haiguste ja keeruliste riikide, näiteks allergiate ja rasvumise arendamiseni. Seni teadsime siiski suhteliselt vähe rolli kohta, mida soole bakterite ja bakteriofaagid mängivad tervise ja inimese haiguste mängimist.
Teadlased võõrustaja ja mikrobiota vahelise suhtluse laboratooriumi vahel Senger ja Euroopa Bioinformaatika Instituudis (Ühendkuningriik), DNA sekveneerimismeetodi rakendamisel tegi 28 060 inimese soole genoomide bioloogilise mitmekesisuse kataloogi kogutud viiruse liikide bioloogilise mitmekesisuse kataloogi. 28 erinevat riiki kuues mandril (Aafrika, Aasia, Euroopa, Põhja-Ameerika, Lõuna-Ameerika ja Okeaania) ja 2898 bakteriaalse isolaatide genoomi, mis tõstatati sellest kõhuorganist. Nende töö tulemused on esitatud raku ajakirjas.
Teadlased on avastanud inimese sooles elava faagide 142 809 genoomi, millest rohkem kui pooled on varem kohtunud. Viiruslik mitmekesisus osutus kõrgeimaks sellisest tüüpi bakterite seas ettevõtetena. Samal ajal ei olnud umbes 36% viiruse klastritest piiratud ühe tüübiga, luues võrku geenide geenide vahel fülogeneetiliselt erinevate bakterite vahel.
Kümnete tuhandete viiruste hulgas on teadlased tuvastanud uue laialdase faagide kogumi, mille omadused meenutavad crassfaadi bakteriofaagi, mis avastati 2014. aastal paljude riikide reostatava reostatavana. See rühm nakatab Gram-negatiivsete anaeroobsete bakterite bakterid Bacteioidioe perekonna nimetati gubafagiks. Ja ekspertide sõnul on ta ja crassfage - ühine esivanem.
"Samuti täheldasime ka selget eraldamist Põhja-Ameerika, Euroopa ja Aasia elanike ja Aafrika ja Lõuna-Ameerika proovide fagorite vahel. Huvitav on see, et fagioomi mustrid (kõikide faagi genoomide järjestuste komplekt proovis. - Ref. Ed.) Korrelatsioonis oluliste erinevustega inimese elustiilis. Ja linnaproovides leiduvad faagid olid suunatud bakterid, kuid mitte Pirvotellacea perekonna bakterid, samas kui Peruu, Tansaania, Madagaskari ja Fidži maapiirkondades sisaldasid PerAGacar ja Fidži parfaažid, mille eesmärk on bakatäride asemel prevotellaceae, "teadlased ütles.
Nende sõnul parandab saadud kvaliteetse suure kvaliteediga kataloog faagide genoomide kataloogi viiruse tulevaste uuringute uuringud - soole mikrobioomi viiruse komponent - ja teeb inimeste soole bakteriofaagide ökoloogilisele ja evolutsioonilisele analüüsile.
"Tuleb meeles pidada, et kõik viirused ei ole kahjulikud: nad on soole ökosüsteemi lahutamatu osa. Enamik viirustest, mida me selgus, on DNA geneetilise materjali, mis erineb tuntud patogeenide, nagu Coronavirus SARS-COV-2 või Zika viirus, mis on RNA viirused. Teiseks saadi meie proovid peamiselt tervetest inimestest, kellel ei ole konkreetseid haigusi, "ütles Dr. Alexander Almeida, üks uuringu autorid.
Allikas: alasti teadus