Los científicos contaron sobre la mujer rusa en la que Koronavirus adquirió 18 nuevas mutaciones.

Anonim
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Los científicos contaron sobre la mujer rusa en la que Koronavirus adquirió 18 nuevas mutaciones.

Los científicos del Instituto Skolkovsk de Ciencia y Tecnología, el Instituto para los problemas de información de la información de Harkevich bajo la Academia Rusa de Ciencias, la Primera Universidad Médica estatal que lleva el nombre de Pavlov y el Instituto Smoroodintsev publicó una preimpresión de trabajo en el Portal Virológico. , en el que contaron sobre un paciente de 47 años con diecinueve Cuvid. El hecho es que en su caso, Coronavirus adquirió 18 mutaciones, y ella estaba enferma por más de cuatro meses.

A fines de marzo del año pasado, una mujer con una célula B-B-Cell Nehodgkinsky Linfoma Cuarta etapa fue hospitalizada para el paso del Rituximab de quimioterapia planificada (agente antitumoral de un grupo de anticuerpos monoclonales). Ella yacía en la misma cámara con un paciente anciano, que pronto reveló COVID-19.

El 17 de abril, una mujer de 47 años fue dado de alta del hospital, pero menos de dos semanas diagnosticó una enfermedad de Coronavirus. "En ese momento, apareció síntomas de COVID-19 (temperatura corporal elevada). Esta muestra de origen se descartó inmediatamente después de las pruebas y no estaba disponible para la secuenciación. Retunetas nasoplarcary repetidas fechadas el 14 de mayo, 19 de mayo, el 9 de junio y el 14 de julio, dieron un resultado negativo en SARS-COV-2. Sin embargo, el paciente del 25 de mayo al 21 de agosto, se observaron los síntomas de COVID-19 severo. Los resultados de sus pruebas fueron nuevamente positivos positivos 3, 5, 8, 11, 13, 17, 20, 21, 26, 27 de agosto, así como el 3 y 9 de septiembre. Finalmente, el resultado fue negativo el 12 de septiembre, y luego reinició el 10 y el 16 de diciembre, "los autores del estudio escriben.

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La posición de la muestra del paciente del coronavirus de 47 años en la línea B.1.1. El árbol filogenético B.1.1, reconstruido para 49,083 secuencias, se cortó para contener un conjunto aleatorio del 1% de todas las muestras, incluida una muestra de un paciente S (DOT rojo). El paciente A es un punto negro. La línea S (Roja) del paciente tiene 18 mutaciones, incluyendo Δ69-70HV y Y435F S-proteína marcada con dos círculos internos amarillos y azules, respectivamente. Línea B.1.1.7 y clúster 5 sombreado / © Basykin G.A. otro

Los científicos secuenciaron el genoma de la muestra de virus obtenidos el 20 de agosto de la nasofaringe. Para comparación, también secuenciaron la muestra de manchas de una mujer (paciente A), de la cual se presume de un paciente (s) de 47 años de edad, y se infecta. Como resultado, resultó que, desde la referencia, la tensión de Wuhan Sars-COV-2, una muestra de los rusos distingue 25 cambios genéticos. "De estas, se colocan tres variaciones de polimorfismos un solo nucleótido, incluidos tres en las posiciones vecinas 21881-21883, se colocan en la muestra de un paciente en la línea B.1.1. El genoma lleva los 18 cambios genéticos restantes. Una muestra del primer paciente anciano y se coloca en la línea de base B.1.1, lo que confirma que las 18 mutaciones son específicas para los pacientes, "Explicó expertos.

Por lo tanto, los autores del informe, secuenciados por el genoma de Coronavirus del paciente con el linfoma, se caracteriza por una adquisición independiente de 18 nuevas mutaciones acumuladas a partir del 10 de abril al 20 de agosto: esto corresponde a la velocidad de 1.67E-3 cambios a El nucleótido por año, es decir, supera significativamente la tasa de evolución promedio significativa SARS-COV-2. Incluyendo mutaciones de S-proteína Y453F y Δ69-70HV ("combinación Δf"), que se revelaron en coronavirus de visón contaminado.

"Ambas mutaciones se encuentran en un paciente con una frecuencia intermedia: este es un caso de polimorfismo dentro del huésped. Dado que el análisis filogenético ha demostrado que el pedigrí del paciente no está asociado con un clúster de visón, se reorganizaron mutaciones. La adquisición independiente de un par de cambios idénticos en el visón y el paciente con linfoma, así como entre varios pacientes con inmunidad deprimida, implica cambios acordados en la selección. El paciente S proporcionó la única muestra para hoy con una combinación de mutaciones Y453F y S: Δ69-70HV fuera del grupo 5, es decir, adquirido independientemente de visón ", agregaron.

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Spikelists en variantes de coronavirus bien conocidas y casos registrados de la llamada COVID-19 prolongada. Mostrando las mutaciones de la secuencia de aminoácidos codificadas por el gen de Spike. Filas de arriba a abajo: 501y: Variant V2; Versión VOC-202012/01 (cepa británica); opción de opción 5; Paciente con una inmunidad debilitada, recibiendo un plasma recuperado; Paciente con una inmunidad debilitada, recibiendo una mezcla de anticuerpos monoclonales regeneron; Paciente con una inmunidad debilitada, recibiendo un plasma de recuperación; Un paciente con una inmunidad debilitada que no recibió tratamiento con plasma o anticuerpos de recuperación. Colores brillantes marcados mutaciones observadas al menos en dos estudios / © Basykin G.A. otro

Además, el paciente reveló dos mutaciones más, que anteriormente también se encontraron en otros pacientes con COVID-19 con inmunidad debilitada, incluyendo N501Y. Este cambio está presente en la llamada cepa británica de Coronavirus y la versión sudafricana.

"Dado que todas estas mutaciones se compran con concreto (es decir, similares al genotipo. - Aprox. Ed.), Por lo tanto, contribuye a la presión de selección, que es común a los pacientes con inmunidad debilitada y, posiblemente para visón, pero difiere. De eso en la población. Sin embargo, las opciones identificadas en pacientes con inmunidad debilitada (y en Mink) pueden extenderse más tarde a una población común, afectando las características de las cepas circulantes ", resumió los autores del estudio.

El jefe del grupo científico Gregory Basykin, profesor del Instituto Skolkovsky de Ciencia y Tecnología, señaló en el comentario de los medios rusos, como se describe en el caso del informe, una sola. "Para una situación epidemiológica general, no representa mucha importancia. Se espera que este virus, que se originó en el cuerpo de este paciente, no fue a ninguna parte. Más bien, estos son intentos de entender cómo evoluciona este virus y lo que se actúa una selección natural ", subrayó.

Fuente: Ciencia desnuda

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