Los virus son los objetos biológicos más numerosos en nuestro planeta. Y el número de bacteriófagos, también conocidos como fagos, virus, infectar células bacterianas y arqueos, según las estimaciones de los científicos, son 1031 partículas. Afectan fuertemente las comunidades microbianas, actuando como vectores de transferencia de genes horizontales que codifican funciones auxiliares, útiles para los tipos de bacterias-hosts.
Durante décadas, los investigadores han sufrido fagos no tan rápido como quisieron, sin embargo, debido a la aparición de un metagenomilo de alto rendimiento, se hizo posible detectar un número sin precedentes de nuevos fagos nuevos. Por lo tanto, el descubrimiento inesperado fue que la mayoría de las secuencias de fagos no podían atribuirse a ninguna taxonomía viral conocida establecida por el Comité Internacional de Taxonomía del Virus (ITCV).
Se sabe que los fagos afectan a varios ecosistemas, y dada la importancia de la composición y las funciones del microbioma intestinal para la salud humana, el aumento de la atención comenzó a dedicarse a los fagos que habitan este cuerpo. El desequilibrio en el agregado de bacterias conduce al desarrollo de muchas enfermedades y estados complejos, como alergias y obesidad. Sin embargo, hasta ahora, sabíamos relativamente poco sobre el papel que desempeñan las bacterias intestinales y los bacteriófagos en la salud y las enfermedades humanas.
Los científicos del laboratorio de interacción entre el anfitrión y la microbiota en el Instituto de Senger y el Instituto Europeo de Bioinformática (Reino Unido) (Reino Unido), aplicando el método de secuenciación de ADN, hicieron un catálogo de biodiversidad de especies virales descubiertas en 28,060 conjuntos de genomas intestinales humanos en 28 países diferentes en seis continentes (África, Asia, Europa, América del Norte, América del Sur y Oceanía), y 2898 genomas de aislamientos bacterianos, que se elevaron a partir de este órgano abdominal. Los resultados de su trabajo se presentan en la revista Cell.
Los científicos han descubierto 142,809 genomas de los fagos que viven en el intestino de una persona, más de la mitad de los cuales se han encontrado antes. La diversidad viral resultó ser la más alta entre tal tipo de bacterias como firmas. Al mismo tiempo, aproximadamente el 36% de los clústeres virales no se limitaban a un tipo, creando flujos de redes de genes entre tipos filogenéticamente diferentes de bacterias.
Entre decenas de miles de virus, los científicos han identificado un nuevo conjunto de fagos generalizados con características que se asemejan a un bacteriófago de Crassphage, descubiertas en 2014 en las aguas residuales de muchos países. Este grupo que infecta la bacteria anaeróbica gramnegativa, las bacterias de la familia BACHACHEIDACEAE se llamaban GUBAFAG. Y, según los expertos, ella y la Cressphage, un antepasado común.
"También observamos una clara separación entre los faganos de los habitantes de América del Norte, Europa y Asia y muestras de África y América del Sur. Curiosamente, los patrones de fagioma (un conjunto de secuencias de todos los genomas de fagos en la muestra. - Ref. Ed.) Correlado con diferencias importantes en el estilo de vida de una persona. Y los fagos que se encuentran en muestras urbanas estaban dirigidas a bacteros, pero no en las bacterias de la familia de Prevotellacea, mientras que en muestras rurales de Perú, Tanzania, Madagascar y Fiji contenían fages con una variedad de propietarios dirigidos a Prevotellaceae en lugar de bacteroides, "científicos dijo.
Según ellos, el catálogo de genomas de gran escala resultante de alta calidad mejorará los estudios futuros de virus: el componente del virus del microbioma intestinal, y permitirá el análisis ecológico y evolutivo de los bacteriófagos intestinales humanos.
"Debe recordarse que no todos los virus son dañinos: son un componente integral del ecosistema intestinal. La mayoría de los virus que revelamos tienen ADN como material genético, es decir, difieren de los patógenos conocidos, como el SARONAVIRUS SARS-COV-2 o el virus Zika, que son virus de ARN. En segundo lugar, nuestras muestras se obtuvieron principalmente de personas sanas que no tienen enfermedades específicas ", dijo el Dr. Alexander Almíida, uno de los autores del estudio.
Fuente: Ciencia desnuda