Creó un método para visualizar la imagen espectrométrica de masas, adaptada bajo visión humana.

Anonim
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Creó un método para visualizar la imagen espectrométrica de masas, adaptada bajo visión humana.

Los resultados del estudio se publican en la revista analítica química. La espectrometría de masas de alta resolución es un método de análisis de sustancias basado en la medición precisa de la relación de masa para cargar (m / z) moléculas ionizadas y la intensidad de la señal correspondiente (su cantidad relativa). Esta información le permite determinar el peso molecular de los compuestos, su estructura, que ayuda a identificar compuestos, tales como proteínas, lípidos, metabolitos, péptidos, componentes de fármacos y otras sustancias.

Espectrométrico de masas Imijing (MCI) le permite obtener información sobre la distribución espacial de las moléculas en los tejidos, realizando un análisis espectrométrico de masas de iones a la ionización local de las moléculas en cada punto de la muestra en estudio (por ejemplo, un corte de tumor).

La interpretación de los datos MSI es una tarea difícil. Inicialmente, es necesario visualizar la distribución de iones en la superficie de la superficie de corte de tejido, es decir, construir una imagen de color normal, en la que cada área que tiene una composición de iones similar, corresponde a su color. De miles de iones en cada punto, debe acudir a solo tres valores numéricos que deben respetar los datos MSI de manera completa y que pueden correlacionarse con el espacio de color tridimensional para su análisis posterior por parte del investigador.

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Descripción del método / © Skoltech Press Service

"Es importante maximizar el contenido de la información de la imagen resultante, es necesario tener en cuenta las características de la visión humana, en particular, su no linealidad y su sensibilidad cualitativamente diferente a los cambios en el brillo y el croma.

Y, aunque la teoría de la percepción del color se examina durante mucho tiempo (desde la primera mitad del siglo XX), incluso entre los expertos, no hay modelos matemáticos generalmente aceptados, que describen bastante todas las propiedades bien conocidas de la visión humana "El primer autor del estudio, estudiante graduado Skoltech Anastasia Sarychev dice.

Los investigadores del centro de las tecnologías de computación científica y de la ingeniería para tareas con grandes matrices de datos (CDISE) y el laboratorio de Visual SPI RAS ofrecieron un nuevo enfoque para la visualización de los datos MSI, no inferior a los métodos previamente conocidos en términos de detalle, pero en el Al mismo tiempo basado en la teoría de la percepción del color humano.

El nuevo método retiene los límites y los gradientes al aplicar áreas seleccionadas de composición iónica similar. En virtud de esto, la imagen resultante se interpreta más fácil que en otros enfoques de la imagen de los datos de MSI. El método se ha probado tanto en el modelo como en los datos experimentales obtenidos por los investigadores del laboratorio de espectrometría de masas de Skolteha, junto con los biólogos del centro de la neurobiología y la neurocilidad de Scothech.

Fuente: Ciencia desnuda

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