Viren sind die zahlreichsten biologischen Objekte unseres Planeten. Und die Anzahl der Bakteriophagen, auch als Phagen - Viren, Infektion von Bakterienzellen und Archäen, nach den Schätzungen der Wissenschaftler, beträgt 1031 Teilchen. Sie beeinflussen stark die mikrobiellen Gemeinschaften, was als horizontale Gentransfervektoren wirkt, die Hilfsfunktionen kodieren, nützlich für Arten von Bakterien-Hosts.
Forscher haben seit Jahrzehnten Phagen nicht so schnell gelitten, wie sie wollten, wegen der Entstehung eines leistungsstarken Metagenomyls, wurde es möglich, eine beispiellose Anzahl von neuen Phagen zu erkennen. Somit war die unerwartete Entdeckung, dass die Mehrheit der Phagensequenzen nicht auf eine bekannte virale Taxonomie zurückzuführen ist, die vom Internationalen Ausschuss für Virus Taxonomie (ICTV) festgelegt wurde.
Es ist bekannt, dass Phagen verschiedene Ökosysteme beeinflussen, und Angesichts der Bedeutung der Zusammensetzung und Funktionen des Darmmikrobioms für die menschliche Gesundheit, wodurch die Aufmerksamkeit zunehmend auf die Phagen widmete, die diesen Körper bewohnen. Das Ungleichgewicht im Aggregat von Bakterien führt zur Entwicklung vieler Krankheiten und komplexen Staaten, wie Allergien und Fettleibigkeit. Bisher wussten wir jedoch relativ wenig über die Rolle, dass Darmbakterien und Bakteriophagen in Gesundheits- und Humanerkrankungen spielen.
Wissenschaftler des Labors der Wechselwirkung zwischen dem Gastgeber und Microbiota am Institut für Senger und dem Europäischen Institut für Bioinformatik (Vereinigtes Königreich), das Anwenden der DNA-Sequenzierungsmethode, die einen Katalog der Biodiversität der viralen Arten erstellt hat, die in 28.060 Sets menschlicher Darmgenomen entdeckt wurden 28 verschiedene Länder in sechs Kontinenten (Afrika, Asien, Europa, Nordamerika, Südamerika und Ozeanien) und 2898 Genome von bakteriellen Isolaten, die aus dieser Bauchorganisation erhoben wurden. Die Ergebnisse ihrer Arbeiten werden im Zellmagazin dargestellt.
Wissenschaftler haben 142.809 Genome der im Darm einer Person lebenden Phagen entdeckt, von denen mehr als die Hälfte jemals getroffen hat. Die virale Vielfalt erwies sich als der höchste unter einer solchen Art von Bakterien wie Unternehmen. Gleichzeitig waren etwa 36% der viralen Cluster nicht auf einen Typ beschränkt, wodurch Netzströme von Genen zwischen phylogenetisch unterschiedlichen Bakterien erzeugt wurden.
Bei Zehntausenden von Viren haben Wissenschaftler einen neuen weit verbreiteten Set von Phagen mit den Merkmalen identifiziert, die von der Crassphage-Bakteriophage erinnern, die 2014 im Abwasser vieler Länder entdeckt wurde. Diese Gruppe infiziert gramnegative anaerobische Bakterien-Bakterien der Familie Bacteroidaceae wurde Gubafag genannt. Und nach Experten, sie und Crassphage - ein gemeinsamer Vorfahren.
"Wir haben auch eine klare Trennung zwischen den Fagoms der Einwohner Nordamerikas, Europas und Asien und Proben aus Afrika und Südamerika beobachtet. Interessanterweise Fagiom-Muster (ein Satz von Sequenzen aller Phagengenome in der Probe. - Ref. Ed.) Korrelierte mit wichtigen Unterschieden im Lebensstil einer Person. Und die in städtischen Proben gefundenen Phagen zielten auf Bacteroide, aber nicht auf den Bakterien der Prevotelacea-Familie, während in ländlichen Proben aus Peru, Tansania, Madagaskar und Fidschi Phagen mit einer Reihe von Eigentümer enthielt, die auf Prebotelaceae anstelle von Bacteroiden, "Wissenschaftler", erzählte.
Demnach verbessert der resultierende hochwertige hochwertige Katalog der großen Kataloggenomen von Phages zukünftige Studien des Virus - der Viruskomponente des Darmmikrobioms - und ermöglicht es, die ökologische und evolutionäre Analyse menschlicher Darmbakteriophagen zu ermöglichen.
"Es muss daran erinnert werden, dass nicht alle Viren schädlich sind: Sie sind ein integraler Bestandteil des Darmökosystems. Die meisten Viren, die wir aufzeigen, haben DNA als genetisches Material, dh von den bekannten Krankheitserregern, wie Coronavirus SARS-COV-2 oder dem Zika-Virus, der RNA-Viren sind. Zweitens wurden unsere Proben hauptsächlich von gesunden Menschen erhalten, die keine speziellen Krankheiten haben ", sagte Dr. Alexander Almeida, einer der Autoren der Studie.
Quelle: Naked Science